因為總稱為龍的怪物們突然出現，使得世界為之一變——終於在人類之中，誕生了擁有龍之力量，被稱為『D』的異能少女們。存在受到隱蔽的唯一男性『D』——少年·物部悠，被強制丟進『D』少女所聚集的密得加爾學園，不小心看到了學園生伊莉絲這名少女的裸體。另外，更在那裡與自幼分離的妹妹·深月再會，於因緣際會之下進入這個學園就讀……！？「真到萬不得已的時候，我會——殺掉伊莉絲。」「我可以……相信你嗎？」原本要成為最強暗殺者的少年，與吊車尾少女所展開的『唯一的故事』，無盡的學園戰鬥動作故事就此揭開序幕——！