山城市行動失利後，執玉司追蹤矢茵來到海港市，繼續追查黑玉「呂」的下落。但在銀行之戰中，矢茵聯手阿特拉斯，逃出執玉司的監視網。 執玉司面臨重建以來的最大危機。組織上開始考慮失去了「呂」的執玉司是否還有必要存續。矢理卻提出執玉司現在有更緊急的任務需要完成…… 執玉司四號明昧，孤身追擊阿特拉斯與矢茵，提出一個特別的交換條件。執玉司有另一塊失落的黑玉的線索。三方合作拿到這塊黑玉，執玉司願意以此交換矢茵手中的黑玉「呂」…… 而在太洋最深處的某個與世隔絕的小島上，一個危險的秘密，正引誘著所有人飛蛾撲火……