那一天，人類失去了半個世界——為阻擋「黑霧」的威脅而建造的巨大「高牆」劃分地球，全世界有半數人口失去故鄉。 為收容變成難民的人們而建造的人工都市「方舟」，現在已經以國家的形式成為人們的新故鄉。 少數的日本人殘存者之一，紫堂緣在第九號「方舟」經營偵探事務所。 他善用各種槍炮武器，能使用發動全身之「氣」的紫堂流忍術。 某天，一樁追捕男性竊盜嫌疑犯的簡單工作找上門來，但男人在緣面前揭露了自己的真正身分。 面對悄聲襲來的巨大陰謀和組織，緣真的有勝算嗎！？