《夜半歌聲》為「夏日魔術」三部曲的第二部。這次的場景是「秋天」，故事是描寫來夢、耕平與北本這個「老中青三人組」再次回到《夏日魔術》中的異世界「黃昏莊園」解救其他人的故事。 從「黃昏莊園」逃出來九個星期後，時節由夏天進入秋天，來夢和耕平以及北本各自邁向自己的人生。三人的再次相遇是在耕平及北本的母校——聖魯卡斯大學的校慶上。朋友送給耕平的偶像歌手，小田切亞弓演唱會的票，那一夜三個人便去參加了亞弓的演唱會。異樣的氛圍中透露著即將發生奇異事件的訊息。隔天，三個人去拜訪母校的校長，得知學校里有個被黑魔術詛咒的傳聞...