「御水師」，即為22世紀人類產生的「踏破深海的異能」。山城湊成為了指導御水師訓練生的教官，回到了母校學院。他有兩位學生：學業落後卻毫不緊張的星野夏香，性格有問題但天生擁有寶貴的御水師才能的科洛·奈特莉。她們雖然偶爾叛逆，但依然逐漸前進，湊以教官的眼光看著她們，漸漸期待起來。然後，當沉入深海的都市中響起「SOS」時——湊和平的日常宣告結束了。「深海」X「絕望」戰慄的本格恐怖小說登場。一切的「結束」，我們還不知曉。