★故事設定於「人類補完計畫」未發生的三年後的世界…… ★《新世紀福音戰士》機械設定山下いくと親自執筆，全新故事、機體充滿魅力！ 這是「人類補完計畫」遭到碇真嗣阻止的世界…… 昔日的特務機關NERV重新編組為「NERVJPN」， 在總司令──葛城美里的領導下，已經十七歲的適任者防備使徒捲土重來。 但是，扛起全球使徒偵測殲滅網的「四個」綾波零之一── No.卡特爾突然失控。 真嗣試圖阻止她，卻連同初號機被伽瑪射線雷射轟穿而消失…… 從電視動畫第二十四集產生分歧的另一個《新世紀福音戰士》可能性的故事， 經過十年後在此復甦。