那日下山之後，李世民派人入弘福寺，將玄奘接到玉華宮中。
玄奘一入玉華宮中，立刻覺得這裡為清涼好去處。其行在路上之時，天與地彷彿被太陽烤得冒煙，置身在野外，似處於一個大蒸籠之中。而玉華宮內，卻是一片窗明風細，簾捲煙茫的好所在。玄奘從心底里發出了一聲讚歎。
是時已入黃昏，晚霞像火焰一樣燃燒，遮掩了半個天空。附近的空氣似乎特別清新，又隱隱地罩著一層霧氣，顯得很柔和。
這時主事太監迎上前來，將玄奘迎入右側的一間凈房，其內已備好素齋。太監傳達了李世民的旨意，說今日時辰已晚，法師又鞍馬勞頓一天，可沐浴後安歇，明日再到丹鳳閣內會面。
玄奘也有些乏了，遂用過晚膳，沐浴後睡下，一夜無話。
第二日，玄奘在太監的導引下進入丹鳳閣。該閣建於半山腰間，其凌於谷上，可以一覽谷中美色。玄奘進入閣內，其裹挾的涼意充溢室間，似與外面景物與風雨渾然一體。一人當窗臨立，正凝神觀望外面的風景。他聽到腳步聲，扭頭說道：「法師昨夜休息得好嗎？」
李世民身穿一襲輕薄的緇衣，面露微笑，讓玄奘大感親近。玄奘斂身施禮道：「稟陛下，貧僧夜寐之後，一夜無夢，想是此地令人靜心所致。」
李世民手指窗外，微笑道：「朕入玉華宮後靜極思幽，因想與法師清談一回。你看，外面落雨無聲，滋潤萬物，正是觀雨清談的好時辰。」
玄奘見李世民心情甚好，遂面露微笑，靜聽下文。
李世民將玄奘讓到軒窗前的椅子上坐定，自己也當面坐下，問道：「法師這一段日子又譯了幾部經？《大唐西域記》進展若何？朕回京之後，身子一直不適，無暇入寺探望。」
玄奘答道：「自從陛下讓貧僧入弘福寺譯經，房大人日夕探問，並撥給筆墨之資，至年初已譯出《大菩薩藏經》等六部，現正譯《瑜伽師地論》百卷，已譯其半。至於《大唐西域記》，約年底前可以完成。」玄奘邊說邊捧起身側的書函，將其呈給李世民道：「前譯六經，貧僧請房大人代轉陛下，此書函為《瑜伽師地論》之前半部，敬請陛下過目。」
李世民接過書函，將之打開取出一函，凝神觀看了數頁，然後說道：「朕於佛學經典，未曾研讀。今觀此論，愈覺佛經猶如瞻天俯海，莫測高深，其宗源杳曠，靡知涯際。由此來看，佛學真學問也。若淺嘗輒止，難識其妙。朕今後若有閑暇時候，定請法師賜教。」
由於此前李世民貶謫釋法琳，又下詔置道教於佛教之上，國內佛徒皆知當今皇上抑佛。玄奘知道這些內情，雖見李世民現在讚揚佛學，然不敢造次，遂輕聲答道：「陛下如此盛讚佛學，實乃佛門之福。」
李世民何等睿智，從玄奘神色間發現他的局促，遂將書函輕輕放下，笑道：「朕請法師前來，專為清談，所以選擇此閣。記得佛門有句話為『眾生平等』，我們今日也平等一回。朕非九五之尊的君王，你亦非學富五車的得道高僧，這樣如何？」
玄奘想不通李世民今日何故如此，愈加局促不安，竟然不知道如何對答。
李世民即位以來，接觸到許許多多的臣民，他們迫於皇帝的威嚴多局促不安，這樣的場面實在很多。李世民不再繼續此話題，又拿起書函，以手指示道：「朕亦曾翻過不少佛經，大約為翻譯的緣故，許多經書讀來晦澀難懂，不似法師所譯之經如此準確，能讓人體會其意，法師，此為何故？」
玄奘沉吟道：「貧僧譯經之時，力求直譯，不加任何修飾。如此做，須同時精通漢語和梵語，方能表達其意。以往所譯佛經，譯者水平參差不齊，對許多章句，難用漢語準確表達，有時順勢大段音譯，如此訛傳下來，不免晦澀難懂。」
李世民點點頭。
玄奘接著道：「不過事分兩邊，有些詞非用音譯不可。譬如『佛陀』即是從梵語中音譯而來，其本意為智慧、覺悟等，漢文中難以找出字來匹配，也就約定俗成了。」
李世民默默思索片刻，既而說道：「朕聽說法師當初所以有西行之舉，源於當時佛學南北迥異，是非紛糾，因而要窮究佛典之訛謬。法師此次帶回經論六百五十七部，可謂佛典集大成者。希望法師要忠於原典，不加文飾，從而精確闡釋教義以求統一大乘諸宗，使其勿再相攻。」
這是皇帝的旨意，玄奘急忙起身領旨。
李世民見玄奘現在已應對自然，遂微笑問道：「法師入宮之前，心裡不免惴惴。定然奇怪朕既行佛事，又多建寺院，卻貶謫釋法琳，使道士居於僧人之上吧？如此來觀，朕實在為一言行不一之人，法師有此想嗎？」
玄奘老老實實答道：「陛下，貧僧確實有疑惑。」
「嗯，朕剛才說了，我們今日清談，可以說心裡話，即使說錯了話，朕也不怪罪。朕所以這樣做，是有緣由的。一者，佛法入中國以來，漸成燎原之勢，上至朝堂，下至庶民，所信者眾。朕即位以來，力求國內安靜，諸般措施須謹慎為之，不能貿然排佛惹起民怨沸騰。何況，朕興兵平定天下之時，得過少林寺僧兵之助，佛學慈悲為主，流智慧之海；膏澤群生，翦煩惱之林，所以朕在決勝戎場建造七所佛寺，以超度亡靈，濟其營魂。」
李世民說出這段話，可以看出其對佛教的態度，是基於君主治理國家需要而對佛教有所放任，有著濃厚的功利色彩。玄奘默默聽言，心裡不以為然，但不直言相駁。
李世民接著道：「二者，佛為胡神，起自西域，後傳中國，於百姓無補，於國家有害。許多人求其道者未驗福於將來，修其教者反受辜於既往。昔梁武帝窮心於釋氏，傾金帛以供僧人，殫人力以供塔廟。及至侯景之亂，梁武帝被俘餓死台城。可見因果之報，何其謬也。」
南北朝時，南朝梁武帝最為崇佛。其自稱為「三寶之奴」，四次捨身到佛寺中出家，大臣們只好以重金將其贖回。他親自撰寫《大涅槃》、《大品》諸經的疏記及問答等百卷，還親自登殿講經。在他的帶動下，梁朝有寺二千八百四十六座，僧尼八萬餘人，僅都城建康就有大寺七百餘座，僧尼信眾達萬人之多。其如此佞佛的結果，不少人傾家蕩產求佛拜佛，大批的糧食被遊手好閒的僧眾吃光。及至侯景之亂，梁武帝竟然被餓死。
李世民的這一段話，很明白地把自己對佛教的態度說了出來。
玄奘聽言後不再默默，點頭說道：「陛下以九五之尊俯視天下，所行仁政取得天下大治。像天竺戒日王為大山所隔，亦能聞陛下事迹。可見陛下之行，亦合慈悲佛理，為天下所敬仰。貧僧以為，陛下實為大德之君。」
李世民見玄奘依然出言謹慎，有心想說話，又怕阻了玄奘下面的言語，遂緘口靜聽下文。
「昔釋迦牟尼佛為王子之時，多閱世間磨難，遂在菩提樹下靜默四十九天，終於得悟成佛陀。何為佛陀呢？其實就如國子監內的教授，其將四書五經讀懂讀透，然後致力於教導他人。」
「教授？」李世民聽到這個解釋很驚奇，因為天下佛門信徒將釋迦牟尼佛視為天神，皆膜拜叩首，以求其靈。
「是呀，釋迦牟尼佛本為一凡人，其要傳道四方，豈能將自己塑為人人不可企及的神人？信徒受其智識所限，多虔誠膜拜，或求財，或求官，或求子，實在是落於下乘。」
「如此說，朕超度亡靈，也歸入此列了。」李世民笑問道。
「非也。人生世上，有『業』有『惑』，其猝死之後，因生前未將戒、定、慧修持完滿，在地獄中難免有倒懸之苦，所以要為之超度。每年的七月十五日，佛界專設盂蘭盆節，即專為超度亡人而設。」
李世民向來不信鬼神之事，其聽到「地獄」二字，不禁哂道：「法師為得道高僧，何來『地獄』之語？由此來看，法師境界未臻空明，依舊與虛妄不舍呢。」
玄奘攏攝一下心神，鎮定答道：「人死之後，其魂靈升於幽冥之界，須依今生修行人『六道』。何謂『六道』？即天、人、阿修羅、畜生、餓鬼、地獄。人若按佛法所引修『真如』，行善積德，即可升到天界；若違背佛法，即要變成餓鬼、畜生，甚至下地獄，是為生死輪迴。大乘教以為，修持者不僅要求得自身的解脫，亦要普度眾生，使眾生者達到涅槃彼岸。超度亡靈，即為普度眾生之一種修持方式。」
佛教的基本教義為四諦說（苦、集、滅、道諦）、八正道、十二因緣和三法印、因果報應、業報輪迴、三世論等。玄奘現在不想說這些令人費解的術語，而從最簡單的生死說起，以向李世民灌輸佛學教義。
「朕剛才以梁武帝為例，其一生虔信佛學，建寺數千，度僧無數，到頭來為何不得善報呢？由此來看，佛學之因果報應、業報輪迴並不靈驗。
「貧僧剛才以國子監為例，講明佛學之旨在於教授。其教授為何？即是釋迦牟尼佛在菩提樹下所悟出的『無上正覺』，其含義有三，一曰自覺，二曰覺他，三曰覺行圓滿。若眾生修持成此三覺