遼瀋、淮海、平津三大戰役結束之後，1949年1月15日，中央軍委作出決定，人民解放軍各部先後進行統一整編。
1949年2月9日，華東野戰軍正式改稱第三野戰軍。
華東野戰軍改編為第三野戰軍後，陳毅為司令員兼政治委員，粟裕為副司令員兼第二副政治委員，譚震林為第一副政治委員，張震為參謀長，唐亮為政治部主任，劉瑞龍為後勤司令員兼政治委員。軍隊轄七、八、九、十共四個兵團和一個特種兵縱隊。
第七兵團由王建安任司令員，譚啟龍任政治委員，姬鵬飛任副政治委員兼政治部主任，李迎希任參謀長。兵團轄第二十一軍（下轄第六十一、第六十二、第六十三師），滕海清任軍長，康志強任政治委員；第二十二軍（下轄第六十四、第六十五、第六十六師），孫繼先任軍長，丁秋生任政治委員；第二十三軍（下轄第六十七、第六十八、第六十九師），陶勇任軍長，盧勝任政治委員；第三十五軍（下轄第一零三、第一零四、第一零五師），吳化文任軍長，何克希任政治委員。
第八兵團由陳士榘任司令員，袁仲賢任政治委員，江渭清任副政治委員兼政治部主任，何以祥任參謀長。兵團轄第二十四軍（下轄第七十、第七十一、第七十二師），王必成任軍長，廖海光任政治委員；第二十五軍（下轄第七十三、第七十四、第七十五師），成鈞任軍長，黃火星任政治委員；第二十六軍（下轄第七十六、第七十七、第七十八師），張仁初任軍長，王一平任政治委員；第三十四軍（下轄第一零零、第一零一、第一零二師），何基灃任軍長，趙啟民任政治委員。
第九兵團由宋時輪任司令員，郭化若任政治委員，覃健任參謀長，謝有法任政治部主任。兵團轄第二十軍（下轄第五十八、第五十九、第六十師），劉飛任軍長，陳時夫任政治委員；第二十七軍（下轄第七十九、第八十、第八十一師），聶鳳智任軍長，劉浩天任政治委員；第三十軍（下轄第八十八、第八十九、第九十師），謝振華任軍長，李干輝任政治委員；第三十三軍（下轄第九十七、第九十八、第九十九師），張克俠任軍長，韓念龍任政治委員。
第十兵團由葉飛任司令員，韋國清任政治委員，陳慶先任參謀長，劉培善任政治部主任。兵團轄第二十八軍（下轄第八十二、第八十三、第八十四師），朱紹清任軍長，陳美藻任政治委員；第二十九軍（下轄第八十五、第八十六、第八十七師），胡炳雲任軍長，張藩任政治委員；第三十一軍（下轄第九十一、第九十二、第九十三師），周志堅任軍長，陳華堂任政治委員。
特種兵縱隊番號不變，陳銳霆任司令員，張凱任政治委員。
以膠東軍區武裝編為第三十二軍（下轄第九十四、第九十五師），譚希林任軍長，彭林任政治委員，軍隊暫歸華東軍區指揮（後於1950年2月調歸第三野戰軍第十兵團指揮）。兩廣縱隊撥歸第四野戰軍建制，曾生任司令員，雷經天任政治委員。這時，華東軍區約42萬人，第三野戰軍約58萬人。
擔負渡江任務的第三野戰軍先在原地學習毛澤東發表的新年獻詞《將革命進行到底》，進行一個月的政治練兵，而後南下江邊。從皖北到蘇北東海之濱，到處都有渡江部隊在召開渡江南征的決心大會、表彰英雄模範大會、行軍比賽大會，地方政府召開歡迎解放軍南征大會，給解放軍敬酒獻旗。特別感人的是在南征大會上，各部隊選出代表，站在毛主席和朱總司令的像前，緊握戰旗，莊嚴地舉手宣誓。開過決心大會，各部即陸續開赴江邊，展開大練兵。2月11日，中央軍委批准總前委關於渡江戰役的初步部署和部隊訓練計畫，並認為此次我百萬大軍渡江南進，關係到全局勝利與否。所以，淮海戰役總前委照舊行使領導軍事及作戰職責。
3月22日上午，蚌埠以南的孫家圩子。太陽剛剛露出笑臉，村子的上空籠罩著一層透明的水霧，像是把小村罩在玻璃罩中。很快，水霧消散了，村子裡的農民一個個都驚呆了。原來，村子四周都是兵。不僅有兵，還有幾十輛吉普車停在打穀場上和路邊。村民們怎麼也想不通，一夜之間，這些天兵天將是怎麼來的？令他們驚異的是，這些當兵的腰間都挎著手槍，年齡越大，手槍越小。事後他們才知道，這是解放軍渡江戰役總前委在這裡召開兵團以上高級幹部會議，參加會議的是高級幹部和隨行的警衛人員，所以都挎著手槍。
會議在小祠堂里舉行。由幾個公文箱搭成的方桌上蒙了一塊大白布，桌子兩邊擺了兩排紅漆椅子，一幅巨大的長江地區戰略態勢圖佔了一面牆。會場上煙霧繚繞，笑聲不斷。劉伯承、陳毅、譚震林、李達、張震分別坐在紅漆椅子上，總前委書記鄧小平主持會議，三野參謀處長王德帶著五六個參謀在一旁刷刷地做著記錄。
鄧小平向大會作《京滬杭戰役實施綱要》的報告。他用那濃濃的四川鄉音，平穩而有力的語調，高度概括說：「同志們，偉大的渡江戰役即將開始。蔣介石也好，李宗仁也好，都不願放棄半壁江山，他們想搞什麼劃江而治，苟延殘喘。毛澤東主席熟知中國歷史，當然不願讓歷史上的南北朝在現代中國重演。千百年來，在南京建都的封建帝王都夢想依恃長江天險，長治久安，流芳百世。但是，從三國東吳到南唐，在石城建都的七個朝代的帝王們，都沒有逃脫滅亡的命運。蔣介石、李宗仁想劃江而治是白日做夢！」他拿起小木棒，指著巨大的地圖說，「渡江戰役是我軍的戰略目標，以第二、第三野戰軍全部，殲滅上海、鎮江、南京、蕪湖、安慶等地及浙贛線蔣軍的全部或大部，佔領蘇皖南部和浙江全省，奪取京滬杭，徹底摧毀國民黨反動政府的政治、經濟中心。」
這時，會場上的氣氛活躍起來，大家被輝煌的前景所鼓舞，抑制不住激動的心情。陳毅大聲說：「講得好，長江沒什麼了不起！無論戰與和，渡江解放全中國是肯定的！同志們，加油干哪，誰先過大江，我陳毅為他作一首歌詞！」
譚震林揮舞著拳頭，說：「小平講得對，和談成了我們要過江；和談不成，我們也要過江。打過長江去，解放全中國的決心不變。我們現在的唯一任務，就是練兵過大江！」
劉伯承笑著糾正說：「不能說過江是現在唯一的任務，你們三野過江後還要打上海，那是一塊大骨頭。」接著，他望著陳毅說，「你陳毅還要準備一副好牙齒去啃骨頭呢！」
鄧小平分析在我軍渡江成功後，敵軍可能發生以下幾點變化：
（1）收縮兵力於京滬杭三角地區和南京、蕪湖地區，控制南京、上海、杭州、蕪湖、鎮江、無錫諸要點，並於我東西兩軍相距尚遠之際，集結兵力與我突進至京滬線上之東線兵團實行決戰，而以蕪湖以西各部退至浙贛線上，以保障其退路。
（2）向後撤收。一線在無錫、南京、蕪湖及其以南地帶布置防線，利用浙贛鐵路迅速轉運兵力控制浙贛沿線，確保南京、蕪湖兩要點，並求得割斷我東西兩軍之聯繫，然後再視情況，或在京滬杭三角地區與我決戰，或退在浙贛線上與我決戰，或沿浙贛線作戰略之撤退。
（3）主動放棄武進、鎮江、南京、蕪湖地段。沿江各敵全線向南退至浙贛線上和無錫、上海、杭州沿海地帶，以便利用鐵道和海口做頑強之抵抗，或做有秩序之撤退。
（4）在情況不利於撤退的時候，分別固守京滬杭諸點，以圖頑抗。
（5）只要我軍渡江成功，無論敵人採取何種處置，戰局均將發生於我有利之變化，並有可能演變成敵人全部混亂的局面。
鄧小平分析後，點燃一支煙，深深吸了一口，然後傳達了總前委的作戰部署：
（1）由粟裕、張震兩人率三野統帥機構，直接指揮三野第八、第十兩個兵團之主力，共六個軍及三個獨立旅，由張黃港至龍稍港段及由口岸、三江營、京口段實行渡江。另以第八兵團之第三十四、三十五兩個軍，於戰役發起同時，以積極佯攻的手段，吸引和鉗制兩浦之敵。
（2）由譚震林指揮三野第七、第九兵團，由裕溪口至姚溝段及姚溝至樅陽鎮段實行渡江。
（3）二野由樅陽鎮至望江段實行渡江，渡江後除殲滅當面之敵外，應派一個兵團以最快速度挺進至浙贛線衢州及其以西以北地區，確實控制浙贛鐵路一段及屯溪南北公路，斷敵退路。
（4）各部隊渡江成功後，應派兵接應左右友鄰兵團渡江。各部隊應與友鄰部隊保持聯絡，互通情報，密切配合，並積極主動地支援友鄰作戰。
淮海戰役期間，粟裕因勞累過度，尤其是腦部過度疲勞，曾經昏迷過。2月底，粟裕在濟南治療養病，因此，孫家圩子總前委會議他並不是一開始就參加的。3月28日，會議快結束時，他從濟南趕來參加。原定的我軍渡江作戰部署，是以蕪湖至安慶段為重點的，因而將三野的指揮位置定在合肥，總前委、華東局和華東軍區機構和三野指揮部在一起。粟裕認為蕪湖至安慶地段，江面較窄，敵人防守