「嘩啦啦~」
時間進入了1629年的六月，北京城的室外氣溫已經升高到了二十多度，而在一些通風不太好的室內，悶熱的環境下，若是再多上一群糙漢子不停的呼出二氧化碳，那溫度直直的往著三十度上沖。
可就是在樞密院的辦公場所里，一群孔武有力的糙漢子，頂著滿頭大汗，大眼瞪小眼的一頁又一頁的翻著厚厚的《刑法典》，卻沒有一個人叫苦叫熱。
「沒有！真的沒有啊！你們那邊呢？」
「也沒有，我負責審閱的第七卷，也沒有！」
「哈哈哈，看來是真的沒有了！皇上萬歲！」
「皇上，皇上啊，真是我們的好皇上啊！」
「是啊，兩百多年了，不，自北宋那些王八蛋開了刺配充軍的先例後，七百多年了，罪犯充軍的條款，終於被皇上徹底廢除了！」
大明的軍人社會低，原因有很多。但非常重要的一點就是：國家法律明文規定，普通老百姓犯了罪，罪不至死的，往往都是充軍——這是國家政權公開對軍人的歧視。國家都如此了，你還能指望社會尊重軍人？
在大明律里，涉及到充軍的有整整189款。偷竊、盜墓、搶劫、貪污受賄、強|奸、通姦統統都可以充軍。甚至一些不太嚴重的死刑犯，溝通到位了，也可以以充軍免死……這麼搞下來，整個大明軍隊，簡直就成了人|渣集中地——俗話說一顆耗子屎壞掉一鍋湯，按照大明的這個做法，那不是美味里夾雜一顆耗子屎的問題了，簡直就是專門燉的屎湯啊！
而且大明律還超變態的定了終身充軍和永遠充軍：前者就是你一個人一輩子充軍，後者是你家世世代代子子孫孫都要充軍——當兵居然成了讓人恐怖的，禍及子孫的刑罰！
這麼個搞法，社會上的輿論怎麼看軍人？軍人自己怎麼看自己？這樣的軍隊又怎麼可能有戰鬥力？
從朱由棟重建橫海衛起，他的新軍在兵源上始終都是以普通農夫、流民、礦工為主，堅決不接受刑部發配過來的充軍罪犯。在後來他做了皇帝後，新式陸軍、海軍的組建上，也是嚴禁罪犯進入軍隊。
但這一切，只是皇帝的個人行為：大明律還在那裡擺著呢，地方官們還在不斷的按照大明律判決某某犯人充軍呢。
而到了這新的，完全取代大明律的諸多法典問世後，雖說心裡早就清楚皇上肯定會善待軍人。但是當樞密院的參謀們一個字一個字細細的審閱了整部刑法典，確認這部厚厚的法典里，沒有一條有『充軍』字眼的時候，六十五歲的樞密院使麻承詔，還是忍不住流出了熱淚。
「好，好，從此以後，我們武人再也不會受歧視了。」
由著年輕的參謀們歡呼雀躍了一番後，麻承詔沉聲道：「如此皇上，我們武人若是不拚死效忠，那就真的沒得救了。悄悄的給各地駐軍主官發下話去，對接下來皇上的動作要絕對支持。若是各地有什麼不滿的苗頭……」他伸出右掌，虛空狠切了下去。
「樞相放心，我大明數十萬將士，決然誓死效忠皇上！但有宵小作亂，必然頃刻間將其化為齏粉！」
……
從魏忠賢和田爾耕那裡不斷得到消息，確認民間反對的聲音並不太大，而軍隊更是忠誠度爆表後，朱由棟的步子一下子邁得更大了。
1629年11月，吏部尚書孫承宗上了《請拆分細化朝廷各部司》的奏章，大明的政體改革，終於進入了實質性的階段。
有句老話怎麼說的？經濟基礎決定上層建築。但是這話後面還有一句話：上層建築對經濟的發展有重要影響甚至是決定性作用。
大明現有的官制，真要追根溯源，可以追到隋朝。一千三百多年來，中華帝國雖然是在治亂循環的怪圈裡反覆折騰，但好歹也是螺旋上升的。社會發展到現在，別說穿越者不斷給社會加速了，就算沒有穿越者，這套起源於隋朝的三省六部制，也嚴重的阻礙了經濟的發展。
所以，必須改。唯有在政體上改良了，才能給經濟進一步的鬆綁，大明的國力才能再次躍升。
在巡遊天下三年多的時間裡，朱由棟除了和熊廷弼長期通信，反覆探討各部法案的修訂外。也和孫承宗反覆就朝廷的機構設置反覆溝通。不過，到底還是這次的變動實在是太大了，所以即便孫承宗竭力配合，這個事情最終還是等到朱由棟回京後，師徒二人坐在一起，花了五個多月的時間，才最終敲定。
新的政改方案，首先改變的是中央政府的部門設置。
皇帝之下，是內閣、樞密院、都察院、最高法院。四個部門分別掌管行政、軍事、監察、司法。
內閣負責人由某殿大學士、首輔什麼的統一改稱為首相，首相有兩個副手，稱副相。首相的權力極大，在民政這一塊，文官五品以下的任免，單筆財政支出在100萬銀元以下者，首相主持召開內閣會議就可以單獨決定，不必再票擬送司禮監批紅——自朱元璋廢除丞相制度，大學士只是顧問和參謀的狀況，到了這裡得到了改變。大明的文臣們再一次有了像唐宋的丞相們那般，在一些具體事務上有了獨斷的權力。
這當然是朱由棟在立憲方面得罪了文臣後，拿出來安撫文臣的措施之一。當然，做皇帝這麼多年，他也深切的感受到：哲學裡的重點論是真理，什麼都要管什麼都要抓是可以的，但這麼做很可能是什麼都做不好。適當的放出去一些權力，抓住更重點的東西，才符合取捨之道。
首相與副相之下，是各部尚書。但是現在，大明徹底廢除了三省六部制，而是改為了帶有濃厚穿越者風格的近代政府制度。
吏部拆分為人事部、勞動部。前者掌官員考核升遷任免，後者主要負責社會保障。
戶部拆分為財政部、稅務總局、農業部、工商總局、商務部、審計總署。
禮部拆分為教育部、外務部，專門負責接待外賓的鴻臚寺併入外務部。部分禮部人員與太常寺、光祿寺合併，成立新的禮儀總局，負責國家內部各項典禮的安排籌備工作。
兵部拆分為國防部、兵役總局。以前專掌全國馬政的太僕寺合併入國防部。
刑部拆分為公安部、司法部，部分人員與大理寺合併，成立最高法院。
工部拆分為建設部、重工業部、輕工業部。
以方山科學院為基礎，合併欽天監，新成立科技部。
以方山科學院醫學實驗室為首，合併太醫院，成立衛生部。
詹事府、國子監、翰林院三個機構合併，成立大明政治學院：從此之後，這裡就是大明的官員繼續提高的地方。
以張世澤的既有班底為基礎，新成立宣傳部，專掌文化宣傳。全國的報紙、劇團、說書人甚至秦樓楚館的職業女性們全都劃入了宣傳部管轄範圍。除此之外，將逐步的允許民間資本進入傳媒業。
大明皇家銀行繼續保留，但存款貸款的職能要逐步減弱。國家準備再成立三至五家官方銀行，並逐步開放民間資本成立私人銀行。
通政司保留原名，但其職責轉變為內閣的辦公廳。
都察院保留原名，但其職責已經徹底轉變：風聞言事被禁止，糾察官員道德問題被置於極靠後的位置。現在的都察院，獲得了獨立的經費，獨立的調查權，其工作職能主要在於監察百官的履職和經濟問題，另外還承擔政府公訴職責。
錦衣衛保留原名，詔獄繼續保留。不過作為國家情報機關，雖說他仍然保留了一定獨立的司法權，但這種權力，更多是針對被認為可能是間諜的相關人員的審訊。對於官員的一般審訊，只能走法院。
廢除尚寶丞，其掌管、製作印璽的職責，轉入內廷。
內閣首相、樞密使、最高法院首席法官、都察院左都御史四人，是大明大臣的頂端，俱為正一品。
副相、樞密副使。次席法官和右都御史為從一品。
新成立的各部尚書、總局局長，政治學院院長，錦衣衛指揮使，皇家銀行行長等，均為正二品。
按照朱由棟的旨意，在中央政府各部門完成重整後，大明境內的各省、區，以及省下面的州府，除外交、國防、民族事務、幹部培訓、國家情報等部門外，其他的，均要按照中央政府新部門的設置，在地方政府里設置相應的部門。
至於縣級政府，限於這個時代的社會發展水平，倒是暫時不用把相應的部門全都也跟著設置齊全。但是縣衙里也要設置相應人員來對接上級政府各廳局的工作。
在這一整套政府架構設置完成後。朱由棟又下了一道聖旨：新機構設置完成後，逐步廢除吏、役，改以全面公務員制度。從天啟十三年開始，國家不再有所謂的科舉，而改以中央政府公務員考試和地方公務員考試！