《秦謎：秦始皇的祕密》在大陸出版的時候，沒有附錄和參考書目。理由嘛，比較簡單；我知道這本書該如何定位，自感不甚瞭然，因而難以確定有沒有必要附上這些比較專門的東西。
書出來以後，我一邊聽取讀者的反應，一邊自我審視，似乎有了一些新的認識。現在看來，我這本歷史推理，可以說是一部學術研究著作的普及推廣讀本。形式上盡可能生動有趣，通俗易懂，基本上是學術研究的最新成果。可以自信的說，本書的內容和見解，都是有學術根據的，不但對於一般的歷史愛好者是新穎的，對於從事相關研究的歷史專家來說，也是新穎的。
有了這樣的認識以後，本書台灣版的定位就比較清楚了。首先，從版本上看，定位在精，相對中華書局的普通版而言，是精品版。新增的地圖和彩照，最是代表。其次，從書品上看；定位是雅，比較中華書局的大眾普及版而言，本書力圖向典雅的方向靠近。基於這種考慮，我為本書增添了＜大事年表＞和＜秦始皇年表＞、＜秦王嬰父子列傳＞和＜昌平君列傳＞，以及＜焚書坑儒，半樁偽造的歷史＞等幾個附錄。這些附錄，既是有利於理解本書內容的便利工具，也是有利於對內容做深入理解的一些學術參考。
在中華書局版中，對於引用史料的來源，都做了明確的標註，對於不得不提到的學術論著的出處，以夾註的形式寫在書中。在台灣版中，我保留了前者，而將本書曾經比較多的參考過的學術論著，以參考論著要目的形式單獨附錄出來。這種安排，也是為了向典雅靠近。