統籌全局，多爾袞策定了澄清宇內、勦撫兼施，進取次第的方略。大清朝欲求政權穩定，長治久安，有三方面的障礙，必須掃除。首先是李自成，非徹底勦滅不可；其次是明朝的福王朱由崧即位於江南，改元「弘光」，以史可法為大學士，駐揚州督師；南明雖有「江淮四鎮」，尚擁重兵，但福王毫無心肝，南都奸佞滿朝，將帥唯知殘民以逞，史可法縱有忠肝義膽，無奈獨木難支，多爾袞決定先致書勸降，勸降不成，用兵未晚，而且預料將如摧枯拉朽，指日可以告捷。這分大功勞，他決定送給他的同母弟豫親王多鐸。
此外就是張獻忠了。此人是陝西延安人，黃面長身虎頷，外號「黃虎」，狡譎異常；崇禎三年陝西流寇大起，張獻忠聚寇作亂，流竄於大河南北，江淮湖廣。當李自成破京時，張獻忠亦自夔州入川，進陷成都，效李自成的竊號自娛，自稱「大西國王」，用李自成的「國號」「大順」，作為他的「年號」以蜀王府為「王宮」，分設「左右丞相」、「六部」、「五軍都督府」，分眾大掠諸府州縣，據有全蜀。從古以來「天下未亂蜀先亂；天下已治蜀未治」，四川別成天地，不妨慢慢收拾。當務之急是分道追勦李自成。
李自成稱「王」於西安，自京師西遁後，由山西復歸西安「就國」。多爾袞以西征重任賦予靖遠大將軍阿濟格，而以吳三桂所部為主力，策略是由邊外入長城南下，佔領米脂、綏德，斷李自成的歸路；同時派多鐸為定國大將軍，率師征江南以前，先由河南西攻潼關。南北夾攻，逼得李自成復又流竄，自西安走西南，由藍田出龍駒寨，遁入湖北襄陽，復至武昌。阿濟格分兵兩路窮追；其時南明鎮守武昌的大將左良玉，領兵東下去「清君側」，打算誅奸臣馬士英，因而武昌空虛，李自成得以盤踞五十餘日，及至阿濟格、吳三桂的精兵，連破李自成的八座老營，所部或降或走，李自成在武昌立不住腳，南竄延寧、蒲圻，遁入與河西接壤的通城九宮山中，清軍包圍，糧盡援絕。有一天李自成帶了二十多人，下山掠食，其時流寇已如「過街老鼠，人人喊打」，一聲號召，紛紛聚集，李自成帶著人突圍而走，那知人馬都陷入泥淖之中，有人朝他當頭一釘耙，腦破而死，上前剝開衣服，裡面穿的是繡龍的黃緞夾襖，隨身帶著一顆金印，細看面貌，一隻眼是瞎的，斷定就是李自成。報到阿濟格那裏，派遣認識李自成的吳三桂的部下去檢驗，由於屍首腐爛，無法驗明正身，但李自成的妻妾、兩個叔叔，以及他的「大將」劉宗敏，相繼被俘，卻是事實。
這是順治二年九月裏的事。二月間，多鐸移師江南，「揚州十日」、「嘉定三屠」，五月中入南京，六月初俘福王於蕪湖，南明覆滅。多爾袞開始討伐張獻忠。
這個任務落在豪格身上——順治元年九月，七歲的皇帝由原為豪格的心腹而改投多爾袞的何洛會奉迎至北京，十月初一祭告天地宗廟，即皇帝位，十月初十頒大赦詔；第二天大封皇族，豪格復爵，仍為肅親王，派到山東、河南去掃蕩流寇餘孽。順治三年正月，派為靖遠大將軍，率領禮親王代善的長孫，衍禧郡王羅洛；廣略貝勒褚英的第三子貝勒尼堪等征四川。在此以前，何洛會奉命駐防西安，並以定西大將軍的名義，防堵張獻忠逸出四川；至三月間豪格抵達西安，何洛會回京。這樣走馬換將，是多爾袞預定的策略，第一，保護何洛會，始終不讓他跟豪格在一起，以防遭受暗算；其次將心腹留在身邊備顧問，讓冤家身蹈危地。
豪格這一回的出征，是最艱苦的任務，因為兩年多的工夫，四川人幾乎讓張獻忠殺光了。崇禎十六年春天，張獻忠自廣濟、蘄水入黃州，經麻城西陷漢陽，攻破武昌，生擒楚王華奎，裝入竹籠，沉入長江，楚王全族被屠；男子二十以下，十五以上，錄用為兵，其餘一律屠殺，芳草萋萋的鸚鵡洲以下，浮屍蔽江，「人脂」積蔽水面一寸多厚，有名的「武昌魚」竟不可食。但較之屠川，猶是小巫見大巫。
張獻忠天性好殺，一日不殺人就會悶悶不樂，殺人愈多則愈樂；殺人先從成都開始，先殺讀書人，假稱「開科取士」，將士子集中在青羊宮，殺得一個不留，筆墨成丘成塚。其次是殺明太祖自詡為「吾養兵百萬，不費民間一文錢」的衛所兵——實際上大部分是農民，不過有軍籍而已，總計九十八萬餘。最後是殺成都的百姓，掘大坑活埋。同時遣派「四將軍」分屠各府州縣，名為「草殺」，意思是像鋤草一樣，根本不分良莠。「四將軍」名叫孫可望、艾能奇、劉文秀、李定國，都是張獻忠的養子，賜姓為張。
不但殺百姓，張獻忠連他自己封的「官」都殺，當「朝會」時，喚出來幾十條狗，誰讓狗聞一下，隨即拉出來砍頭，名為「天殺」。此外還有各種殘暴的殺人方法，最慘酷的是「生剝皮法」；皮未去而其人已死，行刑的劊子手抵命，因而必須講究生剝人皮的方法，才能保命。部下錄功，亦以殺人多寡為斷；尚有人性的賊將不忍多殺，但不多殺必為張獻忠所殺。
張獻忠不但殺他自己的「官」，而且還殺他的妻兒。有一天夜靜無事，忽然自語：「這時候殺甚麼人？」想一想，交代衛士殺他的妻妾，有一個兒子，同樣亦在被殺之列。因此，在他左右的人，無不自危；有一天他跟他的部下汪兆麟說：「我當初起事的時候，跟我的只有五百人，所向無敵。現在人太多了，前年出漢中，讓小毛賊賀珍打敗了我；我就想，人一富貴了，就不肯拚命了，即使人多，並無用處。這回出川，我想只要像起事那樣，有五百人就行了。」
「那麼，大王，」汪兆麟問：「其餘的幾十萬人怎麼辦？」
「都殺掉！」
汪兆麟大吃一驚，「幾十萬兵怎麼殺？消息一傳，大王還沒有殺他，他先造反了。」他想了一下，獻上一計：「不如先立法，命將軍、都督，多派偵探，查訪各營，有私下說不中聽的話，或者其他小過失，立即抓出來，按軍法從事，而且要連坐。這樣殺之有名，就沒有人知道大王的用心了。」
「此計大妙！好，照辦。」
話雖如此，也不是一時能殺得完的，於是想重施故技，用活埋的方式，一次可以殺數千數萬。首先看中的一個目標是都督劉進忠，他的部下原來都是四川人，被裹脅成賊；劉進忠倒是早就想反正了，得此機密消息，更加強了他的決心，拉了他的隊伍往北走，打算出川入陝西。
其時豪格的大軍駐紮南鄭，苦於蜀道崎嶇，無人帶路；一見劉進忠投誠，喜不可言，當下命麾下大將鰲拜，在劉進忠嚮導之下，由羊圈山入川，兼程南下，經巴州至保寧府南部縣，與張獻忠很接近了。
張獻忠是十一月夷平了成都府，率眾東行，打算流竄到湖北。其時鰲拜已由劉進忠帶領自南部向西，直奔成都，但張獻忠不知道，過了三台縣，行至南部與三台中途的鹽亭驛，大霧曉行，突然在一個名為鳳凰坡的地方，與鰲拜所部遭遇，清軍萬矢齊發，流寇呼嘯潰散，張獻忠倉皇下馬，躲在一個柴垛下面，那知一枝流矢從孔隙中穿入，張獻忠中箭呻吟，為清軍發覺，被擒立斬。伐蜀的戰局，就此大定。
大捷的戰報傳至以抵達南部的豪格，既驚且喜，不道成功如此之速而易。諸將紛紛入賀，有人說了一個最新的故事，據說張獻忠初入成都時，毀棄一座古塔，塔下掘來一塊石碑，上面刻著一首詩：「修塔於一龍，毀塔張獻忠，吹簫不用竹，一箭貫當胸。」當時大家不知所謂，如今才知道是符讖，「吹簫不用竹」，蕭字去竹頭，是個「肅」字，正應著肅親王；「一箭貫當胸」就更明白了，張獻忠要死在肅親王手裏，早就命中註定了。
這個故事使得豪格深感興趣；待諸將告退時，特為將一個護軍統領希爾根留了下來有話說。
這希爾根世居長白山，太宗居藩時，選拔他充任護衛，也是年齡相仿的豪格的玩伴，因而成為心腹。豪格留他下來，自然是談他心裡的話。
「張獻忠勦滅了，你看我是自請班師呢？還是在四川肅清了再回京？」
八旗親貴重臣，領兵出征，向來有輪番瓜代的制度，為的是勞逸平均，也各有立功的機會。豪格受命將及一年，巨寇既平，自然可以自請班師；但希爾跟聽出他有言外之意，當即反問一句：「王爺的意思怎麼樣呢？」
「我的意思——」毫格想了一下才開口，毫不客氣地直呼他的叔父的名字：「多爾袞在山海關大破李自成，完全是靠那一陣突如其來的東風幫忙，不比咱們平張獻忠，真正吃了不知多少苦？」
「是！這比起睿親王的運氣來，王爺才真是力戰經營。」
「多爾袞貪天之功，我實在不服氣。他讓我討伐張獻忠，你知道不知道。黃鼠狼給雞拜年，沒有安著好心。」
「我知道。王爺不提起來，我也不敢說，都是何洛會那小子在搗鬼。」
「喔！」豪格很注意地問：「他怎麼搗鬼？」
「王爺不知道？」
「不知道。」豪格催促著：「你快說，是怎麼回事？」
「睿親王派何洛會到西安來駐防，是要監視張獻忠。去年這個時候，他掛了『平