等退下不久，復又叫起，這次是召見奏摺上列名的十五個人，兩宮太后在御榻左右分坐，臉色都很沉靜，恭王就知道皇帝已經准奏了。
推測得一點不錯，皇帝是這樣說：「天下事不可一日鬆懈，李師傅代為繕摺，是權宜的辦法，這百日之內，我想求兩位太后代閱摺件，等百日之後，我照常好生辦事。」
「是！」恭王代表大家領旨。
「恭親王要敬事如一，」皇帝用很嚴厲的聲音說：「萬萬不可蹈以前故習！」
恭王依舊只能應一聲：「是！」
接著便是慈禧太后開口：「昨天你們上摺子，我因為茲事體大，不便答應，要你們先奏明皇帝。」說到這裡她轉臉向皇帝解釋：「昨天西暖閣召見，是軍機、御前請見，當時我怕你心裡煩，沒有告訴你。」
這是當面撒謊，好在沒有一個人敢去拆穿，皇帝亦信以為真，連連點頭，彷彿感激她的體恤。
「你不必再煩心。」慈禧太后目光掃過，先看慈安太后，再看恭王等人，最後仍舊落在皇帝臉上，哄小孩似地說：「你放心養病好了，當著大家在這裡，我答應下來就是了。」
意思是「勉徇所請」，皇上和諸臣還得表示感激慈恩。等退了下來，一面擬旨，一面商量。皇太后與皇帝到底不同，看摺以及跟軍機見面，固無二致，但一般官員的引見，以及祭享典禮，皇太后無法代行天子之職，得要想個章程。
「馬上就過年了，年底太廟祭享，得要遣派親王恭代。」寶鋆一一指明：「元旦朝賀，免是不免？京內外官員引見，怎麼變通？各種差考，誰來出題？」
「元旦朝賀，經筵等等儀典，自然暫緩舉行。郊壇祭享，臨時由禮部奏請皇太后欽派人員恭代行禮。差考出題，由軍機辦理。只是京內外官員引見，」恭王想了想說：「改為驗放如何？」
也只好如此。因為皇太后到底不便召見外廷臣子，而且看摺也不是攝行皇帝之職。於是照恭王的意思擬定四條，連同沈桂芬所擬的上諭，一起送上去請旨。
旨稿很快地核可了，只改動了少許字樣，拿下來立即送內閣明發，當天就是「邸鈔」，是這樣「通諭中外」：
「朕於本月遇有天花之喜，經惇親王等合詞吁懇，靜心調攝。朕思萬幾至重，何敢稍耽安逸？惟朕躬現在尚難耐勞，自應俯從所請。但恐諸事無所稟承，深虞曠誤；再三吁懇兩宮皇太后，俯念朕躬正資調養，所有內外各衙門陳奏事件，呈請被覽裁定。仰荷慈懷曲體，俯允權宜辦理，朕心實深感幸，將此通諭中外知之。」
於是從第二天起，兩宮太后便在漱芳齋辦事，批閱章奏，在養心殿西暖閣召見軍機，裁決軍國大事，這又回復到垂簾的光景了。
當然，慈禧太后大權在手，樂得收買人心，再度聽政的第一天，就問起瑞麟的遺缺。瑞麟死在九月裏，留下兩個缺，一個是兩廣總督，這個缺因為有許多收入與宮廷及內務府有關，非萬不得已，不補漢人，特調安徽巡撫英翰升任。另一個是內閣首席的文華殿大學士，照規矩應該由資序較次的大學士遷轉殿閣，騰出一個大學士缺，歸協辦大學士寶鋆升補，但皇帝因為停園工的案子，跟恭王鬧脾氣，而寶鋆是恭王的心腹密侶，便有意擱置不理。此刻慈禧太后一提起來，自然是照規矩辦事，李鴻章由武英轉文華；文祥由體仁轉武英，寶鋆大拜，榮膺體仁閣大學士。
這一下便連帶有了變動，寶鋆的吏部尚書，為六部之首，例規是協辦大學士的候補者；有人該升協辦，便得先調吏部。論起來兵部尚書英桂的資格夠了，因而寶鋆改為「大學士管部」，仍管吏部，而以英桂調任吏部尚書。英桂的遺缺，由弘德殿行走的廣壽，以左都御史調補。空出來的一個缺，與尚書同等，為「八卿」之一，慈禧太后問恭王：「你看補誰呀？」
恭王因為皇帝的告誡，記憶猶新，在這些加官晉爵的事上，要避把持的嫌疑，所以這樣答道：「臣心目中並無合適的人，請懿旨辦理。」
「左副都御史，是新補的，當然不能馬上就坐升左都御史，照規矩應該在侍郎裏頭挑。現在倒是些甚麼人呀？」
六部侍郎，共計二十四人之多，恭王也記不清楚，寶鋆原是吏部尚書，自然唸得出全部名單，所以他回頭說道：「你跟皇太后回奏。」
於是寶鋆便唸：「吏部左侍郎魁齡。」
「對了！」剛唸了頭一個，就讓慈禧太后打斷：「就讓魁齡去吧！」
這是間接示惠於恭王。魁齡曾在七月底由恭王保薦，升任工部尚書，已經擬旨奉准，就因為停園工之故，皇帝一怒收回成命，此刻到底當上了一品官兒了。
再有兩個陞官的，就是太醫院的左右院判，李德立以三四品京黨候補。莊守和以四五品京堂候補。旨意一下，在太監中就引起竊竊私議，說李、莊兩人陞官升得出了格，而且值不值得如此酬庸，也大成疑問，因為皇帝的天花，不見得治得很好，飲食甚少，「歇著」的時候也不多，整夜能夠熟睡的，只不過亥子之交的個把時辰。
照李德立的診斷說，這是「元陽不足，心腎不交」的證象，所以用的藥是「保元湯」，有鹿茸、有肉桂，這也引起好些太監，特別是年紀較長，略知藥性的人的非議，說皇帝才十九歲，血氣方剛，不宜用這些熱性的補劑。
處廷的大臣，當然比太監要明理得多，他們所重視的是脈案，既然「元陽不足」，則用「保元湯」是理所必然之事。但十九歲的少年，何以有此證象？以前的脈案中，也曾一再指出「腎虧」，這是少年放縱，酒色斫喪，進入中年才有的現象，而竟出現在十九歲的少年身上，是件很難索解的事。
於是，「天花之喜」所帶來的憂慮，反而擱在一邊，擔心的是皇帝的體質。而真正瞭解「病情」的，卻又有難以言說的隱憂，覺得皇帝的病情，要比已知的情形嚴重得多，李德立如此處方，便隱然存著卸責的餘地。
這些看法，兩宮太后自是毫無所聞，亦毫無所知，所看重的仍是皇帝的天花，認為危險未過，唯在普施恩澤，感召天和，猶之乎民間所說的，「做好事，積陰功，」庶幾逢凶化吉，遇難成祥。所以慈禧太后先用皇帝的名義，為自己加「徽號」，作為起端，由軍機承旨，發了這樣一道上諭：
「朕於本月遇有天花之喜仰蒙慈安端裕康慶皇太后，慈禧端佑康頤皇太后調護朕躬，無微不至，並荷慈懷曲體，將內外各衙門章奏代為披覽裁定，朕心實深欣感，允宜崇上兩宮徽號，以冀仰答鴻慈於萬一，所有一切應行典禮，該衙門敬謹辦理」
緊接著又連下三道恩詔，第一道以「奉懿旨」的名義，將慧妃晉封為皇貴妃，瑜嬪、珣嬪晉封為妃。第二道是「優加賞賚內廷行走」，第一名是惇王「賞食親王雙俸」；第二名是恭王，本已賞食雙俸，再賞加一分。王公親貴之後是軍機大臣，都賞戴雙眼花翎；再下來是內務府大臣，或者賞雙眼花翎，或者賞「宮銜」，或者兩者得兼。
之後就是「弘德殿行走」諸臣及南書房翰林，亦各蒙榮典此外「所有王公及京外大小官員，均賞加二級，京師八旗及各營兵丁，均賞給半月錢糧」。凡此都表示「行慶推恩至意」。
第三道恩詔是惠及囚犯：
「奉皇太后懿旨，所有刑部及各省已經結案監禁人犯，除情罪重大，及常赦所不原者外，著軍機大臣會同刑部，酌量輕重，分別請旨減等發落。其軍流徒杖以下人犯，一併分摺減等完結。俾沾寬大之恩，勉圖自新之路，用示子惠兆民，法外施仁至意。」
在慈禧太后及軍機大臣是如此「推恩」的想法，蒙恩的大小臣工，當然亦覺得感奮，但有些比較冷靜的，卻有異樣的感覺，感覺不祥。因為似此普遍推恩，像是「易代」之典——新君登基，才會頒發這樣的恩詔。
除了尊崇太后，推恩臣工以外，還有對鬼神的崇功報德，在十一月初一診斷確定為天花那天起，慈禧太后就根據內務府的建議，在大光明殿供奉痘神。痘神或稱「痘母」，宮裏稱為「痘神娘娘」，又簡稱「娘娘」。皇子、皇女出天花，照例要上祭，由皇子、皇女的生母行禮。這一次是天子出天花，更非同小可，最初有人翻出陳年老賬來建議，說「順治爺出天花的時節，曾經下詔，禁止民間炒豆燃燈。似宜照行。」結果碰了一鼻子灰，慈禧太后最忌諱的，便是拿「順治爺」來比當今的皇帝，「順治爺」就是出天花駕崩的，如何好比？
當初是否供過痘神，已不可考，不過供奉了「娘娘」，皇帝的天花出了出來，足見已獲保佑，所以慈禧太后在十一月十二日，特地又將「娘娘」從大光明殿接到養心殿，預定供奉三天，恭送出宮。「娘娘」啟駕，要用轎馬，內務府弄了九副紙紮的龍船，陳設在乾清宮。在這三天之中，宮內「一片喜氣」，只見到處都是紅地毯、紅對聯。
「聖天子百神呵護」，所以還有許多祭儀，照太監的說法，到處都有日久成精的神怪，到處在保護皇帝，自然須有酬報，上祭以外，內務府特地行文禮部，請奏請將諸天眾聖，普加封號。禮部接到咨文，頗為為難，因為供例無據，事