敵華中方面軍進佔我京、滬、杭三角地帶後，於民國二十六年十二月，為節約兵力，以調往其他戰場使用，乃改取守勢，以富陽、餘杭、吳興、長興、宣城、蕪湖為第一線，扼要構築工事，敵所節餘兵力第一股渡江至安徽餘縣與江北之江都，敵共抽二師團與一支隊轉用華北。三戰區遂於是時普遍發動游擊戰，阻敵運輸，打擊敵小部隊，以困擾敵人。民國二十七年一月下旬，敵第十三師團出現向蚌埠進攻，三戰區為牽制敵兵力起見，以戰區主力向杭州、太湖、宣城、甫京、蕪湖等重要城市附近大舉游擊，迫敵向蘇、浙、皖邊區五路進攻，主力滯留華中，使五戰區徐州會戰容易。
民國二十七年春季，軍委會又命收編贛閩及鄂皖區殘匪五千人為新四軍，以葉挺為軍長，並於皖南劃銅陵、繁昌二縣為其守備區，擔任皖南遊擊。新四軍利用統一戰線口號，欺騙青年，煽惑民眾，裹脅壯丁，擴大其叛亂武力，後因該軍違抗命令，擅自行動，我三戰區乃將其繳械，並將葉挺俘虜押解重慶，嗣後葉匪又被釋回延安。
民國二十七年，武漢會戰時，我三戰區編成特種部隊多組，每組有山砲兵、戰防砲、步兵、工兵等分向長江江邊挺進，挺進各小組襲擊敵運輸艦艇與兵艦，斬獲頗多，敵因而增兵沿江，牽制敵第一一六師團，派兵扼守沿江重地，掩護交通，減少武漢壓力。
武漢會戰時，我得諜報，敵大本營曾開會檢討全盤戰局。敵因陸軍投進我戰場有如陷於泥淖，先後雖已動用三十師團（關東軍在外），然僅佔領若干重要鐵道沿線，此外皆由我游擊隊控制。敵擬以武力決戰之意圖既未得逞，以殲滅戰取勝之信念至此亦完全幻減。因我軍非有制勝把握，不輕於打硬戰，為保存實力，以劣勢裝備對敵，庶可持久。武漢會戰後，敵於東北仍有十四個師團，本國也有七、八個師團尚未動用，但敵之陸軍用以對付蘇聯為主，故不敢再增加於中國戰場。敵既未能達到武力決戰之效果，故於武漢會戰後，改變戰略，注意扶持偽組織，以華制華，掠取戰地物資，以戰養戰，作持久戰之計，蓋其積極意圖為南進。我方則採取游擊戰，以配合正規戰，此關係以後戰局甚大。