本部……部隊長軍醫中將或少將
總務部……部長軍醫大佐或中佐
第一部……部長軍醫少將或大佐
第二部……部長軍醫大佐或中佐
第三部……部長軍醫大佐或中佐
第四部……部長藥物學者或軍醫大佐或中佐
大連分室……室長=特別參謀
支隊
牡丹江支隊……支隊長軍醫少佐或中佐
林口支隊……支隊長軍醫少佐或中佐
孫吳支隊……支隊長軍醫少佐或中佐
海拉爾支隊……支隊長少佐或中佐
本部及各支隊人員如下：
本部人員
陸軍軍醫……35人
藥物學者……18人
衛生軍官……約25人
技術軍官……約10人
財務軍官……5人
工程師……約30人
陸軍教官……3人
翻譯……1人
下士官……約100人
輔助技術員……約150人
衛生兵等人員……若干人
支隊人員
陸軍軍醫……1人
藥物學者……1人
衛生軍官……1人
財務軍官……1人
下士官……約10人
輔助技術員……約10人
衛生兵……400人
文職人員……若干人
1、總務部
①計畫與管理
②業務
③人事
④財會
⑤運輸通信
⑥建築物管理
⑦醫務
2、第一部
①關於各種傳染病的預防與治療的調查研究
②各個種類的物理試驗與化學試驗
③關於改良預防注射液和醫療用血清等的研究
④關於預防傳染病的基礎研究
3、第二部
①關於實施預防傳染病措施的研究
②進行預防傳染病器材的實驗
③預防傳染病措施的實施
④預防傳染病的指導
⑤快速運輸有關預防傳染病的器材和人員
4、第三部
①關於改良給水設備的實驗
②各項給水措施的實施
③供應凈化水的指導
④製造和維修給水設備
5、第四部
①製造預防注射液和醫療用血清等
②實施醫學實驗
6、器材部
①保管和供應預防傳染病、給水及各種實驗器材
②關於預防醫藥的研究
③製造預防醫藥
④繁殖和供應實驗用的小動物
7、支隊
①分擔區域內預防傳染病和給水措施的實施與指導
②分擔區域內有關預防傳染病與供應凈化水的調查
③防疫給水設備的小規模維修
8、大連支隊
①關於改良預防注射液和診斷、治療用的血清等研究
②製造和供應預防注射液及血清等
③病源菌的研究
④分擔區域內預防傳染病措施的實施
1、防疫研究
①改良菌苗：腸傷寒與副傷寒、赤痢、霍亂、鼠疫、百日咳、流行性腦脊髓膜炎、淋病菌等菌苗
②研究抗毒素：瓦斯壞疽、破傷風、白喉、猩紅熱等的抗毒素
③改良治療用的血清：瓦斯壞疽、破傷風、猩紅熱、丹毒、白喉、赤痢、連鎖狀球菌、葡萄狀球菌、肺炎、流行性腦脊髓膜炎、鼠疫等血清
④增進士兵健康的措施：有關營內的食物、休息、睡眠和給水的研究
⑤預防肺結核：
a.食物、休息、睡眠、給水與軍事作業所需的營養（熱量）之間的關係
b.預防注射
c.檢疫與消毒
⑥立克次氏體與病毒疫苗的研究：斑疹傷寒、滿洲熱、流行性出血熱、森林壁虱腦炎、狂犬病、天花等疫苗
⑦維生素的研究
⑧脫水研究。預防血清和治療血清、診斷用劑及血漿的脫水與乾燥保存方法
⑨繁殖研究用的小動物：20天的幼鼠、老鼠、土撥鼠、兔子、山羊
⑩環境衛生的研究；研究研究所人員的食品自給；預防炭疽和馬鼻疽方法的研究
2、診斷學的研究
①診斷用劑的乾燥與供應的研究
②診斷用的血清及其乾燥的長期保存
③診斷用變應性抗原：結核菌素、鼠疫、野兔病等抗原試驗
3、治療學的研究
①外科處置早期切除鼠疫和炭疽引起的淋巴腺
②內科處置腸傷寒和副傷寒帶菌者的根本治療
③化學處置馬法尼、琉化利凡諾、盤尼西林
④病毒感染患者的根本治療流行性出血熱、森林壁虱腦炎
⑤血清療法腸傷寒、鼠疫、炭疽、赤痢
⑥研究乾燥血漿野戰輸血的效果部隊人員及其家屬使用時的效果
⑦物理處置對血清病脾臟的X光射線照射
⑧斑疹傷寒的病毒療法
⑨炭疽和馬鼻疽的治療
4、野戰消毒的研究
①野戰消毒的方法
②消毒劑
③地面消毒用的野戰消毒車
④服裝和人員消毒用的野戰消毒車
⑤野戰細菌檢測車的研究
⑥火車與船舶防疫及檢疫的研究
⑦使用飛機進行消毒的研究
5、藥品研究
①馬法尼與琉化利凡諾的合成
②生產盤尼西林
③提煉索通培養劑用的天門冬醯胺
④從「蒺瑰」中提煉維生素C
⑤利用白樺樹油精作殺蟲劑
⑥維生素B1和B2的合成
⑦腖的研究
⑧利用野生蠶蛹製造肉精
⑨精製白喉凝集用的工業用硫化氨
⑩製造胃液素和胰液素；利用白樺樹油作汽車燃料；利用褐煤作汽車燃料；使用「滿洲」的資源製造酒精；用酒精作飛機油料使用時，去除耐寒潤滑油(豆油或蓖麻油的混合物）產生的膠狀物質，如果用80%酒精與20%汽油或者80%酒精與20%松油，可以防止出現這種物質；研究氯試紙
6、代用衣料及食品的研究
①利用滿洲野生蠶作代用衣料
②利用滿洲資源製造代用食品
③冷藏青菜
④以食用野草來代替青菜
⑤以食用野草來代替飼養小動物的青菜
7、研究供應野戰時的凈化水
①衛生過濾裝置用的耐寒設備
②衛生過濾器的重量與體積的小型化
③過濾器內鋁與鐵的代用品
④大量生產硅藻土過濾器
⑤野戰用消毒水測定法
⑥檢測水中的毒素
⑦軟化硬水
⑧去除濾水管中的鐵
⑨改進清洗濾水設備的方法
⑩利用狗運輸小型過濾器；空投袋裝凈化水的供應；增加硅藻土過濾管容量的方法
8、研究運輸
①空運防疫人員與器材
②利用飛機撤離傳染病患者
③耐寒衛生學的研究
9、用於防禦炸彈和飛機噴霧的防疫研究
①對研究所製造的實驗炸彈的防禦措施
②噴霧撒布與防禦措施的研究
10、製造
①疫苗
a.乾燥疫苗
b.鼠疫疫苗
c.腸傷寒與副傷寒疫苗
d.瓦斯壞疽疫苗
e.破傷風疫苗
f.霍亂疫苗
g.赤痢疫苗
h.猩紅熱疫苗
i.百日咳疫苗
j.白喉疫苗
k.斑疹傷寒疫苗
1.利用雞蛋製造疫苗
m.利用白鼠肺製造疫苗
n.利用野生松鼠肺製造疫苗
②治療用血清
a.瓦斯壞疽血清
b.破傷風血清
c.白喉血清
d.赤痢血清
e.連鎖狀球菌血清
f.葡萄狀球菌血清
g.治療丹毒用血清
h.治療肺炎用血清
i.治療流行性腦脊髓膜炎用血清
j.治療鼠疫用血清
③診斷用抗原
a.腸傷寒抗原
b.副傷寒抗原
c.斑疹