1941年11月26日凌晨6點，海軍中將南雲忠一指揮的第一航空艦隊從現在在俄國人手裡的北海道擇捉島單冠灣出發，踏上了前往珍珠港的三千五百海里航程。
在南雲忠一指揮下的陣容是這樣的：負責空襲的是第一航空戰隊，司令官南雲忠一中將，航空母艦赤城，加賀。
第二航空戰隊，司令官山口多聞少將，航空母艦蒼龍，飛龍。
第五航空戰隊，司令官原忠一少將，航空母艦瑞鶴，翔鶴。
負責警戒的是第一水雷戰隊，司令官大森仙太郎少將，輕巡阿武隈；第17驅逐隊，驅逐艦浦風，磯風，谷風，浜風，第18驅逐隊，驅逐艦霞，霰，陽炎，不知火，秋雲。
負責支援的是第三戰隊，司令官三川軍一少將，戰列艦比睿，霧島。
第五戰隊，司令官阿部弘毅少將，重巡利根，築摩。
負責艦隊補給的是補給船隊，司令官大藤正直大佐第一補給隊，給油船極東丸，健洋丸，國洋丸，神國丸。
第二補給隊，給油船東邦丸，東榮丸，日本丸。
第六艦隊的三艘潛水艇伊19，伊21，伊23在今泉喜次郎大佐的指揮下已經在夏威夷周圍展開，負責監視美國太平洋艦隊。
從11月初開始，這些艦艇船隻或是單艘，或是雙艘，零零散散地根據聯合艦隊的指令，或是從佐伯灣，或是從吳，或是從橫須賀集中到擇捉島的單冠灣，航路全部是已經指定好了的，沒有人知道為什麼要去單冠灣。
在此之前，第一航空戰隊的飛行員們被全部從中國大陸召回，在鹿兒島的鹿兒島灣，出水，鹿屋，佐伯等八個地方開始了訓練。這些都是日本海軍航空兵的精華，平均飛行時間是1500小時，最高的有2500小時。但所有人對這次訓練的目的都摸不著頭腦：在民房密集的住宅區，從海上俯衝落下，做完投彈動作必須急速拉高，有時甚至需要做翻滾動作才能避開撲面而來的樓房和煙囪，訓練的內容已經超過了一般的投彈訓練，這是特技飛行訓練。
而且是要求精度極高的特技訓練，比如要求魚雷轟炸機的飛行員們必須做到在發射高度：10-20米，速度：160節，飛行角度：0度或者發射高度：7米，速度：100節，飛行角度：4.5度的情況下發射魚雷。
這都是為了珍珠港的專項訓練，珍珠港入口狹窄，軍港背後就是高山和林立的高樓，飛機做完投彈動作以後就必須馬上拉升大轉彎。對魚雷轟炸機的要求是一航艦作戰參謀，海兵57期首席，第39期，也是最後一期的海大首席，原高尾海軍航空隊長吉岡忠一少佐在經過大量的研究後找到的數據，只有在這兩種情況下命中率才能達到80%。
吉岡忠一專搞高空轟炸的，從1937年開始他就駕駛著九六式中攻機從台北起飛對南京，上海進行轟炸，後來又從三亞，西貢起飛轟炸昆明，切斷援蔣通道，是個技術高超的飛行專家，但是不要忘記他的高超技術在什麼地方練出來的。
當時的常識是魚雷投放高度在100米，最高不能超過250米，可是吉岡把這個高度提高到了2500米，就是無法擊中目標。航空本部教育部長大西瀧治郎聽說以後發了火：「打不中去研究什麼」這才停止了這項研究，這次襲擊珍珠港，本來是準備把長門型戰列艦用的穿甲炮彈改造成航空炸彈來用，但山五十六堅持一定要用魚雷，否則無法消滅美國的戰列艦，大西瀧治郎才把吉岡少佐推薦給了源田實。吉岡把原來對研究超高空投放時對魚雷做的改造照搬到超低空投放來，發現照樣能用，吉岡本人的命中率達到了100%。
但是有了點子能不能實用則是另外一個問題。
一航艦原來的航空母艦赤城，加賀各有27架艦載轟炸機，蒼龍，飛龍各有18架，合計90架。從赤城，加賀各抽12架，蒼龍，飛龍各抽8架，總共40架97式艦上轟炸機組成魚雷攻擊隊，由同樣命中率100%的赤城號飛行隊長村田重治少佐擔任隊長負責魚雷攻擊。
但是貧乏的日本工業無法向日本海軍提供改造過的淺深度魚雷。
三菱兵器製作所到11月10日才剛剛完成28枚改造魚雷。結果有12架魚雷攻擊機的加賀只能先從佐伯港去往佐世保，停在工廠的旁邊等，但是一直到11月18日12枚魚雷還是沒有完成。加賀只好把未完成的半成品和三菱的技術人員，機械全部裝上船，一邊啟航前往單冠灣，一邊在船上組裝，測試，總算在第一航空艦隊，也就是所謂機動部隊出港的前一天，11月25日才完成全部魚雷。
可是一共就只有40枚，魚雷攻擊就只能進行一次。這就是後來日本海軍無法對除了戰列艦以外的美國海軍巡洋艦進行魚雷攻擊的原因——沒有攻擊的武器。
吉岡忠一在回憶錄里說：「如果有80枚魚雷的話……」
海上補充燃油的問題研究從10月初開始進行，一直無法解決，油管一拉就斷，不但航母加不了油，戰列艦，巡洋艦也加不了。南雲忠一隻好詢問各艦能夠裝多少油桶，赤城的回答是能夠裝2000個兩百立升的油桶，山口多聞發了火，說：「別問這個問題，帶著第二航空戰隊去就行了，我們航程短，只準備了單程，不回來了」——準備死在珍珠港了。
到了10月9日吃中飯的時候一航艦參謀長草鹿龍之介突然出了個怪注意：「都是媽媽抱孩子餵奶，孩子能不能抱著媽媽吃奶？」
一航艦到目前為止的研究一直是補給艦拉著被補給艦，草鹿的意思是噸位大的被補給艦反過來拉補給艦。大家飯碗一放就出海去實驗，結果非常成功。
順便說一句，現在的日本海上自衛隊海上加油技術也是第一流的。從2001年11月開始日本自衛隊的補給艦在印度洋上為進攻阿富汗的美國，英國，巴基斯坦，法國，加拿大，西班牙，義大利，紐西蘭，荷蘭，希臘等盟國軍艦加油，累計供油50多萬噸，沒有出過一次事故。
進入單冠灣的全部艦艇保持無線靜默，與此同時一航艦通信作戰參謀小野寬治少佐指揮各航空基地進行偽電作戰，各基地依然使用各艦艇的呼號進行與平時一樣的無線通訊，企圖給美國人一個「聯合艦隊沒有異常活動」的假象。
11月23日，單冠灣內停泊的機動部隊向全體官兵宣布了此次作戰的方向和目的，艦隊上下一片歡騰，總算能打那些「英美鬼畜」了，那些年輕，從沒吃過虧的飛行員們，很認真地相信大日本帝國海軍是天下無敵的。
艦隊在北太平洋上航行，沒有任何通信行動，唯一的指示來源是NHK海外放送結束時朗誦的漢詩：「山川草木轉荒涼，十里風腥新戰場，征馬不前人不語，金州城外立斜陽。」
這首詩是乃木希典在日俄戰爭金州戰役以後寫的，NHK播送這首漢詩並不是在懷古或是在歌頌軍神乃木，這是個暗號，是在告訴機動部隊：「日美談判還沒有結果，機動部隊繼續前進」美國，美國人到底知不知道就要大禍臨頭了？
美國人在珍珠港事件上的表現是很古怪的。
可以用「奇襲珍珠港」的字眼來描述珍珠港事件，但不能用「珍珠港戰鬥」因為那根本不是一場戰鬥，是一場單方面的襲擊，甚至可以說是一場單方面的屠殺。
日本海軍是很有些獨創性的，不少古怪的規則能找到日本海軍身上去。首先是襲擊珍珠港屬於不宣而戰，這就違反了國際法，而這條有關宣戰的國際法就和日本有關。
歐洲從文藝復興時期開始就有了宣戰這麼一說，而日本帝國在其所進行的甲午和日俄兩次戰爭中都不宣而戰，所以從1899年的海牙公約中的《陸戰法規與慣例公約》和1907年的修訂版都與日本有關。
陸軍的主張是開戰的第二天以公布天皇的宣戰詔書的形式宣戰。打仗就是打仗，打得贏就行，何必拘泥於那些倒霉的形式？但日本是在1911年批准了海牙公約的，長期生活在歐美的山本五十六知道國際法的利害，所以主張無論如何也要先向美國宣戰，哪怕兩小時也行。外相東鄉茂德也主張要宣戰，但是軍部就是不肯告訴他到底什麼時候開戰。
11月27日，美國政府的最後回答，也就是「赫爾備忘錄」送到了日本人手中，其實在前一天機動部隊已經出發去打珍珠港去了，但東鄉不知道，東鄉彷彿記得這些丘八們以前什麼時候說過一句找個星期天那些鬼畜上教堂的時候去打他們，一看日曆慌了，星期天就是12月1日，在最後決定開戰的11月29日大本營政府聯絡會議上，聽到丘八們又在糊弄他：「你只管去談判，別的不要管了」實在忍不住說了：「還有沒有談判的時間，你們不是1號就要開大了嗎？」
參謀總長杉山元和軍令總長永野修身對望了一眼以後，永野開了口：「這麼說吧，開戰是12月8日，下下個星期天，確實還有時間，你還可以繼續談判」東鄉鬆了一口氣，確實還有時間。
12月1日有關開戰的最後一次御