遠東艦隊和波羅的海艦隊的覆滅，使沙皇尼古拉二世不得不現實地來看在遠東到底發生了什麼事。這是一件在尼古拉二世看來無法解釋而在其他人看來又很好解釋的事情。不管俄國的國力和陸海軍武力是如何比日本強大於日本，也不管俄國軍隊是如何善戰，俄軍士兵是如何英勇，但俄國軍隊的將帥由於沙皇本人的干擾從而根本無法指揮作戰，甚至有時候俄國將領根本就不想作戰。
日本海大海戰時的第三太平洋艦隊司令官內博加托夫少將是一個例子，陸上戰鬥中的黑溝台戰役更是一個例子。1905年1月，特別善於冬戰的俄軍在黑溝台終於咬住了立見尚文中將指揮的日軍第八師團和秋山好古的騎兵第一旅團主力，10萬俄軍已經把彈盡糧絕的日軍給團團圍困，可以說日軍插翅難逃。
第31聯隊打完了子彈，已經和俄軍玩開了「銃劍術」拼上了刺刀。臨時湊出來的由第二，第三，第五師團組成的救援隊伍甚至都開始絕望了，但就在這個時候，1月28日晚上俄羅斯軍隊突然從日本人眼前消失了——俄軍主動撤退了，天照大神又一次在向日本人微笑了。
怎麼回事呢？原來從黑溝台戰役是新從彼得堡派來的奧斯卡·格里彭博格中將指揮下的俄國遠東第二軍的傑作，但是身為遠東陸海軍總督的庫魯帕特金大將卻害怕如果格里彭博格真的得手，他這個「退卻將軍」的污名將永遠揮之不去，因此利用職權強行下令撤退，給了日本人逃生的機會。
這個黑溝台戰役在世界戰爭史上都是挺有名的一次戰役，有名的理由倒並不是因為俄國人內部勾心鬥角的荒唐，而是這是首次大規模使用機關槍的戰役，秋山好古首先集中了所有機槍在俄軍的主攻方向防守，證明了「突破有機槍防守的戰壕是不可能的」是一條準則，這條準則在後來的第一次世界大戰中幾乎被發展為鐵則，一直到第二次世界大戰中納粹德國的閃擊戰才使這條準則壽終正寢。
順便講一下這個第八師團長立見尚文，這是日本陸軍的一個異類。這位在戰後的1906年晉陞為陸軍大將的人物，不但不是出身於當時主宰日本陸軍的長州藩，而且根本就不是明治軍隊出身。他是幕府軍出身，戊辰倒幕戰爭時他帶著桑名藩的兵把明治軍給打得一愣一愣的。戊辰戰爭他是最後向明治政府投降的幕府軍人，打完了仗去法院找了個書記員的工作混碗飯，一直到西南戰爭官軍屢戰屢敗又想起他來了請他出山。所謂薩長軍人在他面前抬不起頭來的不少，誰要是想炸一下翅什麼的，這位一句話就過去了：「某年某月某日某地，要不是老爺看你可憐放你逃跑，你還有資格在這兒胡說八道？」
陸軍的最長老山縣有朋牛不牛？連大正天皇在御前會議上打打瞌睡他都敢用拐杖杵地板的人，但是一輩子躲開立見尚文走路，一直到他1907年去世時有大山岩陪著才敢到他靈堂里去露個面。
立見尚文的晉陞由於他的出身，實際上是很不公平的。但最後終於由於這次黑溝台的勝利而在60歲上晉陞了大將，也算俄國人照顧了他的官運。
言歸正傳，尼古拉二世是弄不明白這些情況的，所以他不能理解為什麼俄國軍隊不能勝利，他想不出來理由，因此就一直在拒絕日本通過美國發出的媾和建議。
其實從日俄戰爭一開始列強各國就跟著一起在摻和媾和談判這件事。法國在名義上是俄國准盟國的友好國家，但法國非常不願意看到的是俄國和德國的接近，所以一直對在日本和俄國之間保媒拉縴非常有興趣。法國在旅順艦隊被殲滅後就開始了日俄和談的調停活動，但那個努力當時被日本所拒絕了。因為日本認為在俄羅斯還擁有能夠東來的波羅的海艦隊，俄羅斯陸軍也還沒有受到毀滅性的重創，在依然能夠威脅日本的俄羅斯依然存在的時候決不是和談的時機，因為這時候不可能從談判桌上得到日本所希望的東西。
另一方面，尼古拉二世的表哥，「黃禍論」的極端信奉者德皇威廉二世又在圖謀聯合美國法國一起對日強行干涉，想再重演一出十年前甲午戰爭時的「三國干涉」逼日本停戰。但是俄國所表現出的對中國領土的極度露骨的野心本身就不對主張「門戶開放，利益均沾」的美國人的胃口，美國不會希望看到俄國人全身而退，因此德國人的努力也沒有成功。但是美國人對遠東事務抱有濃厚的興趣，拒絕德國人的邀請並不意味著美國不過問這件事，美國人只是在等待介入的最好時機。
反過來對於日本人來說美國人是一個可信賴的中介人。除了美國人當時在遠東的存在還比較稀薄之外，美國總統西奧多·羅斯福和當時的日本外相小村壽太郎還有日本前一屆內閣（第四次伊藤博文內閣）的法務大臣金子堅太郎均為哈佛大學同學，在學校時就保持著良好關係，因此在日本人看來西奧多·羅斯福本人就很可信賴。而西奧多·羅斯福也確實沒有辜負日本人的期待。1905年3月的奉天會戰結束之後，美國總統西奧多·羅斯福就開始了日俄間的媾和斡旋。
奉天會戰在名義上是以日本人的勝利而告結束的，實際上是一筆糊塗賬。
和日本軍七萬五千人的死傷數字相比，俄羅斯軍隊也不過死傷九萬人加上四萬俘虜，考慮到俄羅斯十倍於日本陸軍的一百萬軍隊，也實在不能說俄羅斯軍隊受了多麼大的打擊，不如說是日本勝利得非常悲慘更加合適，因為當時日軍連乘勝追擊的氣力都沒有了，乃木希典的第三軍已經減員過半而且無法補充，陸軍士官學校出身的尉官幾乎全部喪盡，下級軍官都是臨時召集來的只受了速成訓練的預備役軍官。
話說回來，日軍沒有了追擊的力量可能也不是什麼壞事。因為俄國軍隊最擅長的就是那種誘敵深入的大踏步後退，因此俄羅斯軍隊的撤退沒有誘使日軍追擊而陷入像拿破崙曾經掉如果的陷阱也算是俄羅斯戰術上的失敗，而日軍真的開始了追擊的話，士氣已經空前低下了的俄軍撤退難免不會演化成一場潰逃。
不管奉天會戰到底是勝是敗，明白這裡面的名堂的山本權兵衛和兒玉源太郎知道到了議和的時候了，他們否決了參謀本部要求滿洲軍乘勝追擊到海參崴和再編組第13，14，15，16四個師團在庫頁島登陸的計畫，轉而請求羅斯福總統出面進行媾和斡旋。
看慣了後來日本外交的拙劣表演的人會很欽佩明治年間日本的外交官們。
為了換取美國人的全力支持，在朴次茅斯和談開始一個月以前的1905年7月，日本首相桂太郎和訪問新獲得的亞洲殖民地菲律賓途中路過日本的美國當時的陸軍部長，三年後的美國總統霍華德·塔夫脫達成了被後世稱為「桂——塔夫脫協定」的默契。說這個協定是默契是因為這個條約沒有經過什麼換文簽字的手續，就僅僅一個會談紀要而已，而且這個會談紀要在很長時間內是不為人所知的秘密，一直到1924年才被人無意中在西奧多·羅斯福的外交檔案中發現了這個會談紀要。
「桂——塔夫脫協定」的主要內容是日本承認美國為菲律賓的宗主國以換取美國承認朝鮮為日本的屬國。這個協定是兩個後起的列強在瓜分殖民地問題上進行的骯髒交易，現在幾乎已經被人遺忘。除了日本人在談到朴次茅斯和談時介紹背景時會談一下之外，就是韓國的歷史教科書的批判了。不管怎麼說，俄國人不知道日美之間的交易，不知道美國人在談判開始就已經決定了要幫日本人的忙了。
尼古拉二世在一開始根本就不願意和日本人談判，和猴子們談判也太有傷偉大的斯拉夫民族自尊心了。一直到日本海大海戰結束，波羅的海艦隊檣櫓煙滅，沙皇尼古拉二世才開始認真考慮媾和的問題，派出了以財政大臣維特伯爵為首席代表的和談代表團和以外交大臣小村壽太郎為首的日本人在新罕布希爾的朴次茅斯談判，其實真正談判的會場卻是在緬因州的朴次茅斯海軍造船廠。
漫天要價，指望著俄國人就地還錢，日本人先提出的主要條件是：1.承認在朝鮮的日本特殊利益；2.俄軍從滿洲撤退；3.轉讓遼東半島的租讓權；4.轉讓從哈爾濱到旅順間的中東鐵路南滿支線；5.逃往中立國港口被解除武裝的軍艦一律歸日本所有；6.賠償軍費；7.割讓庫頁島及其附屬島嶼；8.容許日本漁船在俄羅斯沿海捕魚；9.限制俄國在遠東擁有海軍軍力；10.海參崴改為不設防的商港。
尼古拉二世一看悲憤滿腔，這也太不把俄羅斯當玩意了，當即表示第5條，第6條，第7條和第9條絲毫沒有談判的餘地，要不然重新再打一場。小村和國內一商量，對維特說如果俄國人能在第6條和第6條上讓步，日本可以放棄第5條和第9條。維特上奏尼古拉二世以後，尼古拉二世的回答是：「具體怎麼談都行，你說了算，反正本皇帝不賠款，不割地」維特也肯定鬱悶千千——能夠不賠款不割地那還要談什麼？你那些有能耐的大臣呢？哦，全部投降了讓黃皮猴子關在戰俘營里在呢。
日本雖然把沙皇的心愛大臣給關起來了幾個，但自己也實在堅持不下去了，再熬下去估計俄羅