日軍憑藉精心構築的工事，安全地躲過了中國空軍的轟炸。轟炸機剛剛離開，數百名日軍就跳出戰壕，哇哇怪叫著向中國軍隊據守的山頭衝去，輕重機槍和各種口徑的火炮猛烈開火，掩護他們衝鋒，與此同時，日軍部署在海灘縱深處的幾門150毫米口徑的大炮則連續不斷地對登陸船隊進行騷擾射擊，使登陸行動時斷時續，一直到下午三點多鐘才全部完成，並且被日軍炮火擊沉了八艘機帆船，死傷人數達到五百人，再加上在灘頭陣地上損失的兵力，傷亡人數已經超過了兩千人，卻沒有粉碎日軍的抵抗！
雖然空軍轟炸機群不時對日軍工事進行猛烈轟炸，但是由於情報有誤，攜帶的全部是五十攻擊的炸彈，根本無法摧毀日軍鋼筋混凝土結構的工事，因而對登陸部隊的幫助不大，日軍始終掌握著主動權！登陸部隊因為沒有艦炮火力支援，面對著日軍的堅固工事，陷入了無計可施的境地！
經過整天的激戰，至日落時分，登陸部隊的三個步兵團雖然在海灘上佔領了正面一千五百米，縱深八百米的登陸場，但是日軍也獲得了大量增援，兵力達到兩個步兵聯隊，武器彈藥更是通過公路源源不斷地從新竹輸送過來。中國軍隊經過一天的血戰，不但精疲力竭，彈藥和飲水也所剩無幾，情況十分危險，指揮官只得命令就地構築工事，一半人警戒，一半人休息，等待後續部隊和補給的到來。
由於缺乏大型高速艦艇，部隊的物資的輸送工作的絕大部分都是由機帆船來完成，以台灣海峽的寬度，即使中間沒有任何的停滯，等到後續部隊和物資全部裝船在運到台灣，最快也要到凌晨兩三點鐘，中間的空檔足夠日軍發起十幾次進攻，一旦日軍發動大規模反擊，後果難以預料。慶幸的是，整個夜晚日軍僅僅發動了幾次小規模的襲擾，均被輕易擊退。原來，空軍的轟炸雖然沒有摧毀日軍深埋在地下的工事，卻給其通信系統帶來一定程度的破壞，使其無法協調部隊的行動，只好放棄了這個機會。
無獨有偶，中路軍和南路軍的登陸行動都遭到了日軍的頑強抵抗，不但損失慘重，而且進展也不順利！顯而易見，台灣日軍早就針對中國軍隊的登陸行動進行了精心的準備，並且成功地瞞過了台灣軍團的偵察人員！
台灣派遣軍司令官的松井太久郎大將雖然在日本陸軍當中並沒有響亮的名聲，但是卻是個老奸巨滑的傢伙，他在43年七月份到任時，就準確地推測出中國軍隊會在44年初再次登陸台灣，因而制定了詳細的應急計畫——台灣派遣軍的戰鬥序列為兩個師團又一個步兵旅團，總兵力為六萬兩千人，即使加上全部的警察、憲兵、空軍基地的地勤人員，也只有七萬多一點，這點兵力既要對總兵力在三萬左右的台灣軍團實施封鎖、包圍，又要防禦超過一千公里的海岸線，顯然是不可能的，松井太久郎果斷放棄了全線布防的計畫，改為重點防禦，沒有從包圍台灣軍團的兩個師團抽調一兵一卒，僅僅依靠一個旅團的兵力就實現了對整個海岸的布防，非常大膽！
松井太久郎把三個步兵大隊和炮兵中隊部署在台中，把另外三個步兵大隊平均分配在基隆、新竹、嘉義和台南等處，而在中國軍隊可能登陸的地點僅僅配備了少量警戒部隊，主要的監視工作由警察來完成，這樣做看起來風險很大，但是由於中國海軍沒有高速艦艇，實際上卻非常安全。分配完部隊之後，松井立即命令工兵部隊全面檢修橫貫台灣全島的公路和鐵路，所有的橋樑都被加固，派有專人把守，比較重要的河道上還秘密架設了浮橋，並儲備了大量的補給品，從而保證台中的主力部隊能夠快速機動到島內的任何地點。另外，為了彌補兵力上的不足，松井定期把警察、政府公職人員和日本僑民集中起來進行嚴格的軍事訓練，並分發了武器，可以在一天之內集結超過兩萬人的預備隊。
與松井太久郎的精心準備形成鮮明對比的是，華南野戰軍參謀部對整個登陸行動的安排漏洞百出：出發陣地、航線和登陸地點與台灣軍團登陸作戰的完全一致，沒有任何改動；對守軍的準備情況一無所知，僅僅對登陸地點進行了幾次偵察，得出的又是日軍兵力薄弱，防禦鬆懈的結論；完全沒有考慮到後續部隊與先頭部隊之間的銜接問題——即使是快艇往返一次也要五六個小時，如果先頭部隊遭到頑強抵抗，後續部隊根本沒有辦法及時投入戰鬥。
令人感動奇怪的是，這份漏洞百出的登陸計畫不但的到華南野戰軍司令部的認可，而且也被統帥部首肯，究其原因不外乎以下三點：第一，輕敵！當初台灣軍團在沒有制空權的情況下不但順利登陸，而且橫掃全島，幾乎把日軍趕到大海里去，如今具有了壓倒性的空中優勢，又有台灣軍團為內應，還不是手到擒來嗎？第二，沒有兩棲作戰的指揮經驗。中國的海軍實力等於零，軍隊的將領和統帥部的長官們又清一色是陸軍出身，完全是用陸軍的戰術來進行兩棲作戰；第三，過高地估計了轟炸的效果。日軍的岸防工事以坑道為主體，非常堅固，而轟炸機攜帶的又是僅僅五十公斤重的炸彈，既不能摧毀工事，又不能有效地殺傷日軍地面部隊，甚至連大口徑火炮轟擊的效果都頗有不如！
接到登陸部隊的報告之後，余漢謀在把情況向統帥部報告的同時，命令後續部隊加快裝船速度，並臨時安排兩個步兵師作為預備隊，隨時準備登船。
凌晨兩點鐘左右，從金門島出發的七艘快艇滿載著四個步兵連的官兵剛剛越過海峽中線，全速向台南靠攏，千餘名戰士強忍胃裡翻江倒海般的滋味，手握鋼槍，借著天空中微弱的星光，眺望著越來越大的陸地。
突然，幾道耀眼的光芒筆直地籠罩在船隊上，戰士們下意識地閉上了眼睛，還沒等他們適應這突如其來的強光，耳邊就想起了驚天動地的巨響，十幾道黑乎乎的水柱衝天而起，洶湧的浪頭頓時把快艇打得七零八落，數十名戰士滾落到水裡——兩艘輕型巡洋艦並排出現在幾公里外的海面，黑乎乎的炮口威嚴地挺立著，不斷向外噴射巨大的火球，把一枚枚140毫米的炮彈劈頭蓋臉地砸向中國船隊。
船隊正中間的一艘快艇連續被三發炮彈擊中，轟然斷成兩截，倖存下來的戰士們頓時被捲入洶湧的波濤之中，附近的幾艘快艇冒著密集的炮火向沉船地點靠攏，準備打撈落水的戰友。然而，日軍艦艇卻一邊射擊一邊高速沖了過來，黑黝黝的海面上掀起一層層巨浪，排水量在三百噸左右的快艇被輕飄飄地推到一邊，全副武裝的落水者很快被無情的海水吞沒了！
中國軍隊沒有被日軍艦艇的氣勢壓倒，毫不猶豫地掉轉船頭，全速向對方沖了上去，戰士們手中的武器猛烈地跳動著，噴射出數百道憤怒的火焰。
巡洋艦不慌不忙地向後退卻，始終和快艇保持著兩公里左右的距離，艦上140毫米主炮以每分鐘二十發的速度把炮彈傾瀉在船隊中間。滾滾的浪濤把快艇沖的左右搖擺，上下起伏，中彈的船隻燃起衝天大火，近失彈片和爆炸掀起的氣浪把船舷兩側的戰士接連不斷地衝到海里，然後消失在黑沉沉的海面上。很快，第二艘快艇又被擊穿了船底，洶湧的海水從五米多寬的缺口瘋狂地涌了進來，然後帶著兩百餘名戰士沉入海底！
儘管快艇把速度開到了極限，但是在對方炮火的猛烈轟擊下，始終無法縮小這段致命的距離，而部隊攜帶的輕武器也不能給巡洋艦造成任何傷害！一個小時之後，七艘快艇全部被擊沉，海面上漂浮著大塊的油污和快艇的殘骸，大部分還在燃著熊熊的火焰，幸免於難的幾十名士兵抱著隨手抓來的木板、油桶等物隨波逐流，等待黎明的到來。
兩艘巡洋艦並沒有理會這些落水的士兵，而是立即加速，向海峽中間疾馳而去，尋找新的目標。
當天晚上，游弋在台灣島東部海域的日本聯合艦隊出動了四艘輕型巡洋艦和七艘驅逐艦，對中國的輸送船隊進行了全方位攔截，並取得了驚人的戰果——從福建出發的船隊只有三分之一到達台灣，其餘的不是被迫返航，就是被炮火擊沉，死傷人數達到四千八百餘人。
日軍艦隊在黎明到來之前高速馳離台灣海峽，與主力艦隊匯合，與此同時，二十多架轟炸機和四十多架戰鬥機從兩艘航空母艦上騰空而起，向台灣島呼嘯而去，對困在灘頭陣地上的中國軍隊發起第一次空襲！
早上六點半鐘，登陸部隊在空軍的全力支援下，經過一個小時的激烈戰鬥，雖然擊退了日軍的空地協同進攻，但是武器彈藥和食品、淡水嚴重缺乏，只能依靠飛機空投來維持，而日軍卻利用這短短的兩天時間集結了八千多人的預備隊，從沖繩島出發的兩千名海軍陸戰隊員也在基隆登陸，中國軍隊的登陸行動已經到了失敗的邊緣！