朝倉義景見自己的聯盟倡議手段完全不奏效也不召集，一計不成再生一計又想起調略高島郡內的國人反叛，或許是朝倉家的強勢早已深入畿內武士的心中，朝倉義景的使者三言兩語就把許多高島郡的武士給說動，除去郡內的高島七頭始終曖昧不明之外，其他的各路國人還頗有一些人聽信朝倉家的蠱惑。
眼看高島郡內生出幾分動蕩不穩的架勢，朝倉義景就寫信給自己的小舅子淺井長政，鼓動他趁著這個機會順勢發動對六角家的入侵戰，只要能把六角義賢這個草包給揉扁搓圓，整個近江就再也沒有能夠抵抗畿內三國同盟的力量。
這個要求恰好正中淺井長政的下懷，他早就盯上六角家這塊肥肉眼饞許久，尤其是去年六角義賢這個草包竟然罕見的沒有慫，在洛中合戰里死磕三好義賢打的是昏天黑地山河變色，最後自己折損八千餘眾還搭進去幾個家老可謂是元氣大傷。
可臨到了只撈到一個象徵意義的従四位下作為鼓勵獎賞，還有五千貫文永樂錢作為對忠勇死去武士的補償，六角家譜代眾早已對強情公方的行為怨氣衝天，可他們不能對幕府公方發火，那就只有六角義賢這個倒霉的家督要中槍。
正值六角家內動蕩人心混亂的時機，淺井長政就生出要趁你病要你命的想法，於是和朝倉家一拍即合立刻召集淺井家的國人眾商議出兵事宜，北近江的國人眾也是很清楚六角家內部的紛爭矛盾，幾乎沒花多少時間就敲定出陣的事宜，但是在出兵之前卻收三好家傳遞的情報。
三好長慶身為三國同盟的發起者以及實際上的盟主，同樣表示支持女婿淺井長政出兵儘快打下六角家，他給予的支持就是派出五千軍勢越過淀川在山城國東部駐紮，佯裝作出威脅六角家左翼的樣子，吸引六角義賢的主力不能完全轉向北部淺井家的真正壓力，同時三好長慶又委派松永久秀為自己女婿的攻略燒上一把火，這把火就是調略。
永祿三年五月初，在松永久秀的從旁協助下很輕易的寢返愛智郡肥田城城主高野瀨秀隆，此君的父親高野瀨賴定為六角氏履歷功勛並英勇戰死，卻沒有得到應得的封賞，因而高野瀨秀隆始終對六角家抱有不滿。
這種不滿隨著日積月累逐漸發酵，尤其當他看到幾個昔日的舊友同僚不是高升就是委派重任就更加不平衡，在松永久秀的使者居中幾番調略就輕易的說服他反水，至於反叛以後能否得到他所需要的封賞之類的問題從來沒想過，許多時候人是衝動的也是盲目的，高野瀨秀隆就是個衝動而盲目的武士。
他宣布反水投靠淺井家以後引發巨大的影響，六角義賢收到這個消息的時候出離的憤怒了，他覺得六角家對此君也算挺好的，雖然沒有知行增封但地處琵琶湖東側土地肥沃物產豐富，這可是近江甲賀郡里多少武士盼不來的好地方。
更何況肥田城又承擔著拱衛觀音寺城的重任，可以說只要六角家的家督不腦袋不清醒就絕對不會動他們這一族，在六角義賢眼裡高野瀨秀隆是最不可能出問題的一環，比其家裡的幾個難纏的譜代家老絕對算的上人畜無害的代名詞。
可就是這麼個「乖寶寶」卻突然對自己齜牙咧嘴，甚至不惜投靠越發不聽話的淺井家配下，這讓六角義賢感到十分的憤怒和羞辱，覺得這幾十年的真心對待全都喂狗了，於是他二話不說率領一萬五千軍勢對肥田城展開進攻，同時將情報傳遞給坐鎮坂本的山本時幸，希望他看住山城國邊境的三好軍勢的五千餘釘子。
高野瀨秀隆一邊籠城固守一邊向淺井家呼救，但是淺井長政並沒有作出立刻出陣的選擇而是集結軍勢在小谷城內待機，他這麼做也是考慮到戰國時代的攻城的兩種極端，要麼是幾天破城要麼就是長期攻而不克，擔心自己貿然出陣還沒到地方就發現肥田城被攻破，不如等一等看情況再做調整，順便還能消耗六角家的銳氣。
六角家那邊的行動卻十分迅速，六角義賢統領一萬五千軍勢迅速肥田城包圍，位於愛知郡的肥田城距離位於蒲生郡的觀音寺城實在太近，六角軍只用一天就來到肥田城外大舉圍困，六角義賢先是象徵性的派出使者勸降，待勸降不成就大舉圍困。
不過他的圍困還是十分巧妙的，可以看的出六角義賢是個心思縝密的家督，他很清楚對於六角家來說目前的形式不允許長期在外圍困肥田城，於是就下令就地徵發普請役在肥田城的周圍修築一道堤壩，將肥田城南北兩側的愛知川和宇曾川的河水水引入堤壩內，打算用水攻困死六角家的叛逆高野瀨秀隆。
愛知郡又名愛智郡，書寫方法的不同經常出現通假字之一，比如加賀兩字就是通假字，京都城東側的鴨川既可以叫加茂川也可以叫賀茂川，所以愛知郡也叫愛智郡，同理還有愛知川和愛智川也是一個道理。
他的計策確實取得不凡的成效，愛知川和宇曾川恰好環抱著兩川之間的肥田城，兩條河川就有現成的堤壩可以使用，一萬普請役只是耗時一個月就勉強修起高一間多高的堤壩，以這到堤壩為依託掘開河壩發動水攻立刻就對肥田城造成毀滅性的打擊。
肥田城大半被浸泡在水塘里，只有二丸及以上憑藉著修建城砦時的高度勉強擺脫大水的侵襲，面對如此巨大的損失已經把高野瀨秀隆逼到絕路上，越是如此就越發不願意投降認輸，因為他知道此刻投降只有死路一條。
事實證明他的堅持是有用的，時值六月正是雨水最豐沛的季節，一場巨大的暴風雨席捲畿內引發近江地區的河川暴漲，傾盆大雨連下十幾天讓愛知川和宇曾川也隨之引發洪災泛濫，本就不堅固的河堤迅速被洪水衝出決口，反過來把堤壩外的六角軍淹成落湯雞。
六角義賢差點被氣死，自以為機關算盡必然能成功，還特地用一套水攻就能輕易的收拾肥田城的叛逆，卻遺忘為將之道最重要的天時之事條，洪水沖開剛修築而並不堅固的堤壩，沖入平原上引發洪水泛濫，六角軍的大寨被洪水淹到許多糧草輜重報廢。
水攻失敗反而搭上不少損失，事到如今已經是無法再圍城的，六角義賢無奈之下只得做出勒兵後退的決定，可這個時候淺井長政卻親率一萬一千軍勢出陣南近江，強勢出現在六角軍的面前擺出要決一死戰的架勢。
六角義賢很清楚這場合戰多半是躲不掉的，可眼下軍心不齊士氣低落如何戰鬥還是個問題，他只得命令家中的譜代家臣迅速增援五千軍勢，這五千人是六角義賢訓練的五千新兵，第一次亮相就是大戰多少還有點不放心。
有這五千生力軍加入使得六角家的軍勢膨脹到兩萬人，不管士氣糧草的損失如何但起碼在人數上還是取得一定的優勢，於是雙方的軍勢就在愛知郡附近展開對峙，直到六月底雲收雨歇露出晴朗的天氣，大水退去又把被掘開的堤壩重新修復，雙方的大將都意識到大戰即將拉開。
六角義賢率領兩萬大軍在肥田城以南的宇曾川南岸駐紮，並派出蒲生定秀、永原重興作為先陣大將統兵五千在野良田鄉布陣，在他們的身後進藤賢盛、池田景雄、楢崎壱岐守、田中治部大夫為二陣在次第設防。
而淺井軍則以百百內蔵助、磯野員昌、丁野若狹守率領先陣五千人在宇曾川北岸以肥田城為後詰布陣，總大將淺井長政則帶著赤尾美作守清綱、今村氏直、安養寺氏秀、上坂刑部率領六千人作為後真駐紮在肥田城外。
經過幾天的躁動還是年輕氣盛的淺井長政決心發起進攻，命令磯野員昌率領五千軍勢強渡宇曾川，六角軍的先陣大將蒲生定秀果斷抓住半渡而擊的寶貴機會發動突襲，五千軍勢迅速突襲正在渡河的淺井軍，百百內蔵助所部在頑固的堅持一陣便率先崩潰。
而此時淺井長政已經開出大軍要吃敗仗的苗頭，立刻下令本陣隨之強渡宇曾川趕在大敗之前把局勢強行扭轉過來，不得不說這個年輕的家督所擁有的血性和勇氣，完全不是他那個軟弱的父親所能比擬的，年輕人敢想敢做絲毫不顧忌小敗一場和全軍失利哪個更划算，就是我要和你鐵橋硬馬的正面進攻。
六角軍則趁此機會打出一連串勝利，即使是淺井家內有「江州第一將」之稱的磯野員昌也毫無辦法，雖然沒人能說清楚吉良家的中條時秀到底有多強，但淺井家的武士一直認為本土武士里磯野員昌絕對是當之無愧的第一人，中條時秀終究是土生土長的三河武士。
而此時渡河的五千先陣混亂成一鍋粥，半渡而擊這個千古奇計自然不會在這場戰役里失守，哪怕在強的武士也無法改變整體大劣的局勢，淺井軍的陣形已經被撕扯的完全不成樣子，磯野員昌在勉力帶著一千軍勢擊敗幾股六角軍的圍攻之後被迫向後撤退。
六角義賢沒想到自己竟然撞到好運氣，年輕氣盛的淺井長政竟敢當著他的面強渡宇曾川，蒲生定秀也不負眾望的抓住這個機會咬住淺井軍的先陣窮追猛打，在宇曾川南岸下場的河原上淺井軍的陣形完全展不開，即使再厲害的武士也只有被動挨打的結果。
在野良田鄉東南處的蓮照寺中，大半成遊方僧人的松永久秀搖頭嘆息，他對這個名義上的連襟真是沒有什麼好