卻說川楚陝三省的教徒，頭目雖多歸擒戮，餘孽尚是不少。額勒登保、德楞泰，又往來搜剿，直到嘉慶七年冬季，始報大功戡定。嘉慶帝祭告裕陵，高宗陵。宣示中外，封額勒登保一等威勇侯，德楞泰一籌繼勇侯，均世襲罔替，並加太子太保，授御前大臣。勒保封一等伯，明亮封一等男，碌碌因人。楊遇春以下諸將，爵秩有差。
自此以後，裁汰營兵，遣散鄉勇，兵勇或無家可歸，或歸家不敷食用，又經發放恩餉各官吏，層層克剝，七折八扣，煞是可恨。因此游兵冗勇，又糾眾戕官，出沒為患。復經額、德兩將帥，東剿西撫，忙了一年，事始大定。自教徒肇亂，勞師九載，所用兵費，竟至二萬萬兩，殺傷的教徒不下數十萬，清兵鄉勇的陣亡，五省良民的被難，且算不勝算，無從查考。和珅之肉，其足食乎？只這位嘉慶帝，當軍事緊急時，很是審慮周詳，勵精圖治，到西北平定，內外官吏，又是歌功頌德，極力鋪張，嘉慶帝也道是功德及民，漸漸的驕侈起來。逸豫忘身，中主多半如此。慶賞萬壽，下嫁公主，挑選妃嬪，儀注都非常繁備，金銀也用了許多。
還有一樁賞罰倒置的事情：川楚陝平靖後，因地勢阻奧，增設營泛，陝西省中添了一個寧陝鎮，就用楊芳做了鎮台，寧陝的地方，地險糧貴，當時創議的人，因例餉不足兵用，酌定每月加給鹽米銀，每人五錢，三年遞減，次年屆期應減一錢，布政使朱勛，以未奉部文，並四錢也都停發，兵士大嘩。會陝西提督楊遇春，方奉旨入覲，寧陝總兵楊芳調署提督，副將楊之震護寧陝鎮，將嘩噪的兵士，不問曲直，統拿來笞杖一頓，一味蠻做。兵士愈加怨憤。內有兩個小頭目，都是姓陳，一名達順，一名先倫，居然糾眾抗命，殺死副將游擊，劫了庫中的銀兩，放出獄中的罪犯，趁勢大亂。時楊遇春尚未出境，朝旨即命他回剿，另簡成都將軍德楞泰為欽差大臣，赴陝督師，遇春到方柴關，叛兵設伏以待，推蒲大芳為首領，大芳驍桀善戰，竟將遇春圍住，官兵叛卒，互相認識，竟不肯聽遇春號令，紛紛四散。遇春止率親兵數十名，登山斷後，見大芳策馬而來，大聲叱道：「你何故造反？」大芳見是遇春，就下馬遙跪，哭訴營官克餉的情形。遇春道：「營官克餉，你可上訴，何苦做此大逆不道的勾當。」大芳道：「現在已處騎虎之勢，不能再下，須求大帥諒我！」言畢，起身徑去。還虧遇春平日恩信及人，不至被迫。
是時楊芳亦馳來相救，遇春與他商議，楊芳道：「叛兵都經過百戰，並非一時烏合，若要除滅了他，很不容易。況官兵九載勤勞，瘡痍未復，又前時與叛兵多系同功一體，以兵攻兵，終無鬥志。聞叛首蒲大芳見了大帥，尚下馬遙跪，卑鎮家屬，亦由大芳送至石泉。可見大芳雖叛，還有舊部情誼。卑鎮願親自出撫，若得大芳歸降，便可迎刃而解。」遇春喜甚，即命楊芳去撫大芳。到了大芳營前，敵矛林立，軍壘森嚴，楊芳的背後，有隨員數名，都嚇得戰戰兢兢，請楊芳折回。楊芳道：「天佑蒼生，我必不死。且為國息兵，雖死何恨。汝等若果畏懼，不妨退還。讓我一人前去便了。」遂揚鞭獨進，直入大芳營。大芳忙出來迎見，楊芳向著大芳，慟哭失聲道：「我與汝等戮力數年，同患難，共生死，彷彿如家人骨肉一般，今朝兩下對壘，反同仇敵，我不忍見汝等身隕族滅，所以單騎前來，請你等先殺了我，免得見你慘禍。」蒲大芳等聽了這番言語，不由的感激，便道：「我等小兵，安敢冒犯鎮台大人？大人真心相待，大芳也有天良，寧不知感。只朝廷未必肯赦前罪，奈何？」楊芳道：「你果誠心悔過，我當於欽差大人前，極力保免，要生同生，要死同死，要犯罪同犯罪，不使你等獨受災殃。」沉痛語，亦刻摯語，安得不令大芳敬服？大芳到此，不禁涕零，即聲隨淚下道：「鎮台大人，真是我的生身父母。我若再自逆命，恐怕皇天也不容我呢。」已五體投地了。當下對眾人道：「大芳今日已悔前過，情願聽這位楊鎮台大人，楊鎮台令我活，我就活，楊鎮台要我死，我亦甘死，若兄弟們不以為然，一概聽便。」大眾齊聲道：「願隨楊大人。」楊芳見叛兵都願就降，便道：「眾位都願相隨，乃是很好的了。但倡亂的人，曾在此處么？」大芳道：「不在此處。」楊芳道：「這卻不便赦他。他戕了官，劫了庫，破了獄，無法無天，若不照律究辦，還要什麼政府？」先寬後緊，可謂善於操縱。大芳道：「這都在大芳身上，請大人放心！」楊芳隨即回營。
過了兩日，大芳果誘縛陳先倫、陳達順二人，獻至清營，束手歸命，這次亂事，若非楊芳單騎招撫，以誠服人，眼見得叛兵四齣，如火燎原，比川楚陝三省的教徒，還要厲害幾倍呢。德楞泰將二陳磔死，其餘依了楊芳的議論，盡行赦宥，釋歸原伍。只奏摺上卻說是叛卒窮蹙乞命，把楊芳招撫事，擱起不提。
詎料嘉慶帝忽下嚴旨，說德楞泰寬縱專擅，竟要將他嚴譴。德楞泰急得沒法，又上了一篇奏章，推在楊芳一人身上。德公尚且不德，何況別將。嘉慶帝遂將楊芳革職充戍，蒲大芳二百餘人，亦命隨楊芳發充伊犁，又密令伊犁將軍松筠，將蒲大芳等誘誅。楊遇春亦坐罪降為總兵，德楞泰處罰罪輕，總算革職留任。後德楞泰調任陝西，剿平西鄉叛兵，賞還原職。德公也天良發現，密奏楊芳功，方將楊芳赦回，然已受侮不少了。忠而被謗，最堪憤惋。西北一帶，經數次痛剿，已算無事，偏偏東南的海寇，又興起波，掀起浪來。海洋開禁，自康熙年間起頭，康熙帝嘗任用客卿，如西洋人湯若望、南懷仁等，俱命司歷務，外洋商船，得了內援，便在中國海濱互市，往來江浙閩粵間。乾隆末年，安南阮光平父子，竊位據國，國庫中很是缺乏，他卻想了一個盜賊政策，招集沿海無賴，給他兵船，封他官爵，叫他在海中劫掠商船，充作國用，這種政策，倒是特色。於是海寇日盛一日。嘉慶五年，海寇駕艇百餘艘，聚逼台州，居然想上岸劫奪，浙江定海鎮總兵李長庚，生長閩海，素識海中險要，且忠勇的了不得，是日聞警，帶領三鎮水師，出口抵禦，巧值颶風陡起，雷雨大作，寇艇多半撞溺，有幾百個海寇，避風上岸，被長庚捉得一個不剩，當場審訊，內中有四個頭目，系是安南總兵，佩有安南王敕印。長庚大怒，把四人磔死，並行文安南，將敕印擲還。
會安南又有內亂，廣南王后裔阮福映，自暹羅入國，得暹人援助，恢複舊土，滅了新阮，方思聯絡清朝，遂一面聲明縱寇誨盜，系阮光平父子所為，與己無涉，一面奉表入貢，求清冊封，乞仍以越南名國。嘉慶帝封他為越南國王，令嚴杜海寇，阮福映遵敕照辦。怎奈海寇已是不少，雖失了安南政府的保護，終究野心未戢，仍然出沒海上。就中有兩個悍頭目，叫著蔡牽、朱濆，兼并群盜，號令一方。蔡牽有百數十艇，朱濆也有百艇，把閩海作了根據，無論何國的商船，一出海洋，須要繳通行稅四百圓，進港加倍，就是買路錢的別名。因此他二人竟做了海上富豪。又交通陸地會匪，使陰濟兵械，餉械充足，猖獗萬分，官兵都奈何他不得。
只一智勇深沉的李長庚，還好與他酣戰幾場，但長庚單知忠國，不善逢迎，不如是，不足為忠臣。往往為上司所忌。可恨可嘆！嘉慶帝因長庚有功，擢他為福建提督，閩督玉德，偏與長庚反對，奏稱長庚籍隸福建，須要迴避，似乎名正言順。朝旨乃調任浙江。浙江巡撫阮元，系江蘇儀征縣人，素擅文名，兼通武略，見了李長庚，談了一回剿寇事宜，甚為合意，遂大加賞識。惺惺惜惺惺。長庚獻造船制炮兩大策，阮撫台一律採用，即為籌款十餘萬兩，交與長庚。天下無難事，總教現銀子，長庚得了這項巨款，就放著膽子，造起大船三十艘，名叫霆船，鑄就大炮四百尊，就各船配搭，乘風破浪，所向披靡，連敗蔡牽於岐頭東霍等洋，擒住賊目張如茂等，兵威大振。嘉慶八年，蔡牽至定海，到普陀山進香，長庚探悉，將霆船一齊放出，四面掩擊。蔡牽不及防備，忙跳下小船，單舸逃去。餘外大艇，多被長庚一陣炮彈，打得篷穿桅折；並傳令舟師追趕。
此時的蔡牽，正如喪家犬，漏網之魚，逃至閩洋，又見霆船追至，據著上風，不能衝突，他連忙取了數萬銀子，遣人至閩督玉德處乞降。玉德見了銀子，好似蒼蠅見血，叮住不放，為了此物，誤盡天下官吏。還管什麼真假，立飭興泉道慶徠，赴海口招撫。蔡牽與慶徠約，如果許降，須令李長庚退兵回港，勿得窮追。慶徠飛報玉德，玉德飛飭李長庚回兵。長庚明知蔡牽詐降，無如提督的位置，要受督撫節制，總督有命，不得違拗，未免落了幾點英雄淚，帶兵回港。
蔡牽恰慢慢兒修好檣械，備好餱糧，揚帆遁去。暗地裡恰賄通姦商，替他製造巨艦，比霆船還要高大，只說載貨出洋。一出了口，便交與蔡牽。蔡牽得此巨艦，又縱橫海上，劫得台灣米數千擔，接濟朱濆，與濆合勢，再犯溫州。溫州總兵胡振聲，倉皇失措，領了一班不整不齊的水師，出去截擊，不值牽、濆兩人一掃，非但全軍覆沒，連胡振聲亦溺斃水中。牽、濆連䑸八十餘，返馳入閩，閩中沒有一人敢上前抵敵。