卻說伏允可汗，聞唐軍又復殺到，慌忙從帳後逃出，跨馬疾奔，所有妻妾子女，一齊丟下。契苾何力舞刀直入，還管甚麼生命不生命，見一個，殺一個，見一雙，殺一雙，從騎緊緊隨上，各仗著快利兵器，試那番眾頭顱。番眾在昏夜中，倉猝莫辨，還疑唐軍有數十百萬到來，嚇得沒命亂跑，但教保住頭皮，總算是萬分僥倖，霎時間逃得精光，單剩伏允的妻妾子女，聚做一團，在帳後亂抖。何力當然不與客氣，指顧軍士，一一捆住。尚有雜畜二十餘萬，搬不勝搬，可巧萬均等馳至，遂幫同移取，一古腦兒送至大軍，聽候李靖發落。靖聞先驅得勝，自然欣慰。適值侯君集等，也進逾星宿川，進至柏海，與靖合軍。各路將帥，統行趨集，只有高甑生未至。靖待了兩日，方見甑生到來，免不得責備數語。甑生懷恨在心，及靖再擬窮追，他卻暗中運動諸將，意圖逗撓，湊巧吐谷渾遣使至軍，舉國請降，表文上乃是慕容順出名，靖詢明來歷，乃知伏允窮蹙，已自經死。從李靖傳文，不從《通鑒》。伏允子順為大寧王，不在軍中。至伏允死後，乃馳往奔喪。番國因兵敗主亡，統由天柱王一人所致，遂戴順為主，殺了天柱王，奉表唐師，情願投誠。靖即令飛驛馳奏，有詔封慕容順為西平郡王，仍得統轄舊部。且命李大亮駐兵數千，暫作聲援。外如李靖以下，一律還朝。靖與侯君集等，入朝復旨，太宗一一慰勞，犒賞有差。忽高甑生訐靖謀反，並陰嗾廣州刺史唐舉義，作為干證。太宗令有司案驗，毫無實據，乃坐甑生等誣告律，減死徙邊。實有可殺之罪。
既而西平郡王慕容順，懦弱無剛，竟為國人所戕。順子諾曷缽尚在少年，避匿得免。大臣爭權，國中大亂，李大亮擬往彈壓，因恐兵力不足，表請濟師。太宗令侯君集引兵往援，君集星夜前進，到了吐谷渾，與大亮同入番帳。番眾相率懾伏，不敢違命。君集大亮，查得亂首數人，捕獲正法，餘眾免究，今迎諾曷缽為主，諾曷缽才放心出來，做了可汗，自是感念唐恩，遣使入朝，請頒曆書，願奉正朔，並遣子弟入侍，太宗一一允諾，且封他為河源郡王。至貞觀十三年，諾曷缽馳驟入朝，太宗嘉他恭順，特把宗女弘化公主賜給為妻。諾曷缽非常感謝，挈了公主，仍歸本國去了。暫結吐谷渾事。
當李靖出征吐谷渾時，唐室忽遭大喪，太上皇一病不起，竟在垂拱殿中，宴駕歸天，享壽七十一歲。太宗因居喪守制，不便臨朝，特令皇太子承乾，暫行聽政。過了五月，葬上皇於獻陵，廟號高祖，謚曰大武。先是築陵制度，擬仿漢長陵故事，長陵系漢高祖陵。培高九丈。秘書監虞世南上疏，略言：「陛下聖德，度越唐虞，今乃以秦漢為法，似屬非宣，應如《白虎通》所云，墳高三仞，以昭儉德。」疏入不報。世南復奏，太宗乃召群臣會議。房玄齡等謂漢長陵高九丈，原陵光武陵。高六丈，今九丈太崇，三仞太卑，不如仿原陵制度，以六丈為定例。太宗依議而行。葬後逾年，乃御殿如初，不意過了半載，長孫皇后又復抱病，逐日增劇，太宗心不自安，命太子承乾，日夕侍母側。承乾欲請大赦，且延方士入宮禳災。後呵禁道：「死生有命，非人力可以挽回，若修福果可延年，我生平並未為惡，倘行善無效，我尚何求？況赦令系國家重典，佛老為遠方異教，俱皇上所不願為，怎得因我亂天下法？汝不宜妄奏！」太子乃不敢奏請，惟轉告房玄齡。玄齡卻入白太宗，太宗嘆美不止。群臣遂請特頒赦詔，太宗已有允意，偏為皇后所聞，固請停赦，詔乃不發。會玄齡偶有小譴，令歸就第，後時已大漸，與太宗訣別，嗚咽陳請道：「玄齡久事陛下，小心慎密，不愧忠良，若非大故，幸勿輕棄。妾家本支，因緣懿戚，得列顯階，無德苟祿，最易取禍，幸勿再委政權，但得以外戚奉朝請，已出隆恩。妾生無益於時，死不可以厚葬，願因山為壠，毋起墳塋，毋用棺槨，器用瓦木，約費送終，庶不致增妾罪戾，願陛下勿忘！」語語可為天下法。說至此，喉中痰已作壅，喘息了好一歇，復握太宗手道：「此後陛下為政，能親君子，遠小人，納忠諫，屏讒慝，省勞役，止游畋，妾雖死無恨了。」太宗不能無過，長孫後實是完人。太宗聽到此處，不禁淚下，只是向後點頭，反答不出甚麼言語。應有此情。後恐太宗傷心，也不欲再談。又延了一日有餘，竟瞑目而逝，年只三十六歲。如此賢后偏不永年，天道誠令人難測。
後天性仁厚，撫視庶子，幾過所生，妃嬪以下，無不愛戴，訓誡諸子，常以謙儉為先。胞兄無忌，本與太宗為布衣交，太宗因他為佐命元功，得出入卧內，且欲引他輔政。後固言不可，舉漢呂霍事以為證。太宗不從，竟命無忌為尚書僕射，後反怏怏不悅，密令無忌辭職。無忌乃一再固辭，太宗才行准奏。後喜動顏色，方無戚容。太子承乾乳媼，請增東宮什物，後怫然道：「太子所慮，無德與名，奈何請增什物呢？」後女長樂公主，下嫁長孫沖，太宗以公主為嫡後所出，敕有司資送，視長公主加倍。唐制皇姑為大長公主，皇姊妹為長公主，皇女為公主。魏徵進諫道：「昔漢明帝欲封皇子，謂我子不得與先帝子比，今陛下資送公主，反視長公主加倍，臣意竊為未解。」太宗不悅，入告後知，後嘆道：「妾嘗聞陛下推重魏徵，不識何因，今聞征言，乃引禮義導陛下，這真是社稷臣呢。」太宗乃改令減損資奩，並賜征帛四十匹，錢四十萬，後亦遣中使齎帛賜征，且傳語道：「聞公正直，今才得實，願公常守此志，勿少變更呢！」征自是不憚極言。太宗一日罷朝，退語後道：「我總要殺此田舍翁。」後問田舍翁為誰？太宗道：「便是魏徵，他屢來絮聒，且嘗廷辱朕躬，所以必殺死了他，才得泄恨。」觀此言，可知太宗納諫，非出真誠。後聞言退出，添著朝服，復入內拜賀道：「妾聞主明臣直，今朝有直臣魏徵，就是陛下的聖明呢。」太宗乃轉怒為喜，待遇魏徵，優禮如初。後生平最喜觀書，雖容櫛不少輟，嘗采古婦女得失事，為女則三十卷，及崩後，始由宮司奏聞，太宗隨閱隨泣，覽畢舉示近臣道：「皇后此書，實足垂範百世，朕非不知天命，為無益的悲慟，但入宮不聞規誡，失一良佐，是以可哀。」乃追謚為文德皇后，就葬昭陵，太宗自著表序，刊鐫陵左。又在苑中作一層觀，屢望昭陵。一日，引魏徵同登，語征道：「卿見陵墓否？」征熟視良久，方道：「臣昏眊不能見。」太宗乃指陵示征，徵答道：「臣以為陛下望獻陵，若昭陵原是早見哩。」是謂譎諫。太宗為之泣下，乃令毀去層觀。惟房玄齡已早令複位，總算依後所託，不負遺言。
後生三子，一是太子承乾，一是魏王泰，一是晉王治，就是後來的高宗皇帝，太宗懷念故後，因遂鍾愛三子。魏王泰折節下士，又善屬文，太宗寵之，為後文易儲張本。即令就府中置文學館，使自引學士。諫臣等稍有異言，乃令王珪為魏王泰師，且諭泰道：「汝事珪，當如事我。」泰承上旨。每見珪必先拜。珪亦以師道自居，不稍貶損。泰嘗問珪以忠孝二義，珪語道：「王以皇上為君，事思盡忠，王以皇上為父，事思盡孝。忠孝可以立身，可以成名。」泰復道：「忠孝二字，既已受教，敢問從何處學起？」珪又道：「漢東平王蒼，嘗稱為善最樂，願王謹記勿忘！」泰乃不復言。太宗聞珪教泰，很是喜慰，語侍臣道：「吾兒可從此無過了。」卻也難必。珪子敬直，尚南平公主，太宗第三女。珪以帝女下嫁，素多挾貴，蔑視舅姑，至此獨喟然道：「主上每事循法，我當受公主謁見，為國家成一美名。」於是與夫人並坐堂上，令公主執笄盥饋，然後退入。此禮一行，凡公主下降，始行婦禮。特志之以示婦道。珪於貞觀十三年病歿，年六十九，贈吏部尚書，追謚為懿。帶過王珪。
太宗又令諸子吳王恪、齊王祐、蜀王愔、蔣王惲、越王貞、紀王慎等，分任各州都督，或為刺史。恪督安州，屢出遊獵，侵擾居民，侍御史柳范，上書彈劾，恪乃免官。後來諫議大夫褚遂良，奏稱：「皇子稚年，未知從政，不應令掌州事，現不若留居京師，待教養有成，乃可遣往治民。」太宗雖以為然，但不過召還一二人罷了。貞觀十一年七月，大雨兼旬，谷洛水溢，流入洛陽宮，毀壞官寺民居，溺死約六千餘人。有詔令所毀宮室，略加修繕，不得過費；撤廢明德宮內的玄圃院，把院中材料，賜給受災備民家；且命內外百官，各上封事，極言過失。大臣等應詔陳言，多切時弊。魏徵上十思疏，尤為剴切。略云：
人君善始者實繁，克終者蓋寡，豈取之易守之難乎？蓋在殷憂，必竭誠以待下，既得志，則縱情以傲物。竭誠則胡越為一體，傲物則骨肉為行路。雖董之以嚴刑，振之以威怒，終苟免而不懷仁，貌恭而不心服。怨不在大，所畏惟人。載舟覆舟，所宜審慎。誠能見可欲，則思知足以自戒；將有作，則思知止以安人；念高危，則思謙沖而自牧；懼滿盈，則思江海下百川；樂盤游，則思三驅以為度，憂懈怠，則思慎始而敬終；慮壅蔽，則思虛心以納下，懼讒邪，則思正身以黜惡；恩所加，則思無因喜以謬賞；罰所及，則思無以怒而濫刑。總此十思，宏茲九得，簡能而任之，擇善而從之，則文武並用，可垂拱