觀檄中所載，如毛璩以下，多半是虛張聲勢，未得實情。郭昶之何曾反正，王元德並且被誅。就是諸葛長民，亦未能據住歷陽，不過訛以傳訛，也足使中土向風，賊臣喪膽。桓玄自劉裕起兵，連日驚惶。或謂裕等烏合，勢必無成，何足深懼？玄搖首道：「劉裕為當世英雄，劉毅家無擔石，樗蒱且一擲百萬，何無忌酷似若舅，共舉大事，怎得說他無成呢？」恐亦慚對令正。果然警報頻來，吳甫之敗死江乘，皇甫敷敗死羅洛橋，那劉裕軍中，只喪了一個檀憑之，進戰益厲。玄急遣桓謙出屯東陵，卞范之出屯覆舟山西，兩軍共計二萬人。
劉道憐
魏詠之
魏欣之
魏順之
">檀憑之 檀祗隆
檀范之
檀韶 劉藩
孟懷玉
向彌
管義之
周安穆
劉蔚
劉珪之
劉毅等還居尋陽，總道是元兇就戮，逆焰消除，可以高枕無憂，哪知死灰復燃，復有兩桓餘孽，襲取江陵。急忙令何無忌、劉道規二將，進討兩桓。師至馬頭，已由桓謙派兵扼住。兩下里殺了一場，謙眾敗退。無忌、道規，直趨江陵。桓振令黨徒馮該，設伏楊林，自率眾逆戰靈溪。無忌恃勝輕進，被賊軍兩路殺出，沖斷陣勢，大敗奔還。幸虧劉敬宣聚糧繕船，接濟無忌、道規，復得成軍，蹶而復振。
臧寶符
部將殷仲文叛玄降劉，奉晉二後還京。玄再返江陵，人情離叛，沒奈何乘夜出奔，欲往漢中。南郡太守王騰之，荊州別駕王康產，奉安帝入南郡府，尋遷江陵。
童茂宗
周道民
田演
范清
安帝改元義熙。再下赦書，除桓謙等不赦外，獨赦桓沖孫胤，徙居新安，令存桓沖宗祀，保全功臣一脈。沖系桓玄叔父，有功晉室，封豐城公，詳見《兩晉演義》。劉裕聞報，使劉毅、劉道規留屯夏口，命何無忌奉帝東歸。安帝乃自江陵啟鑾，還至建康。百官詣闕待罪，有詔令一併復職。授琅琊王司馬德文為大司馬，武陵王司馬遵為太保，且封賞功臣，首劉裕，次及劉毅、何無忌、劉道規。詔敕有云：
昶與道規，偽勸桓弘出獵，以詰旦為期。翌日昧爽，昶等率壯士數十人，佇待府署門前，一俟開門，便即馳入。弘方在啜粥，被道規持刃直前，劈破弘腦，死於非命。當即收眾渡江，來會劉裕。
徐州司馬刁弘，聞丹徒有變，方率文武佐吏，來至丹徒城下，探問虛實。裕登城偽語道：「郭江州已奉戴乘輿，反正尋陽，我等奉有密詔，誅除逆黨，今日賊玄首級，已當曉示大航。諸君皆大晉臣，無故來此，意欲何為？」刁弘等信為真言，便即退去。
可巧劉道規、孟昶等自廣陵馳至，眾約千人，裕即令劉毅追殺刁弘。待毅歸報，又令毅作書與兄，即遣周安穆持書入京，促令起事。原來毅兄劉邁留官建康，桓玄令邁為竟陵太守，整裝將發。既得毅書，躊躇莫決。安穆見邁懷疑，恐謀泄罹禍，匆匆告歸，連王元德、辛扈興、童厚之等處也未及報聞。邁計無所出，意欲夤夜下船，赴任避禍。忽由桓玄與書，內言北府人情，未知何如？近見劉裕，亦未知彼作何狀，須一一報明。此書寓意，乃俟邁抵任後，令他稟報。偏邁誤會書義，還道玄已察裕謀，不得不預先出首。這叫作賊膽心虛。遂不便登舟，坐以待旦，一俟晨光發白，即入朝報玄。
玄聞裕已發難，不禁大懼，面封邁為重安侯。邁拜謝退朝，偏有人向玄譖邁，謂邁縱歸周安穆，未免同謀。玄乃收邁下獄，並捕得王元德、辛扈興、童厚之三人，與邁同日加刑。一面召弟桓謙，及丹陽尹卞范之等，會議拒裕。謙請從速發兵，玄欲屯兵覆舟山，堅壁以待。經謙等一再固請，始命頓邱太守吳甫之，右衛將軍皇甫敷，北遏裕軍。
敬宣即劉牢之子。前時逃往山陽，擬募兵討玄，未克如願。再往南燕乞師，南燕主慕容德，不肯發兵。敬宣潛結青州大族，及鮮卑豪酋，謀襲燕都，事泄還南。時玄已敗死，走歸劉裕，裕令為晉陵太守，尋又遷授江州刺史。他因劉毅等討玄餘黨，所以籌備舟械，隨時接應。補筆不漏。
無忌夜作檄文，為母劉氏所窺，且泣且語道：「我不及東海呂母，王莽時人。汝能如此，我無遺恨了！」兄弟之仇，不可不報。至無忌檄已草就，翌晨呈入。裕即令頒發遠近，大略說是：
夫成敗相因，理不常泰，狡焉肆虐，或值聖明。自我大晉，屢遘陽九，隆安以來， 國家多故，忠良碎於虎口，貞賢斃於豺狼。逆臣桓玄，敢肆陵慢，阻兵荊郢，肆暴都邑。天未忘難，凶力繁興，逾年之間，遂傾里祚，主上播越，流幸非所，神器沈辱，七廟毀墜。雖夏後之罹浞、殪，有漢之遭莽、卓，方之於玄，未足為喻。自玄篡逆，於今歷年，亢旱彌時，民無生氣，加以士庶疲於轉輸，文武困於版築，室家分析，父子乖離，豈惟大東有杼軸之悲，摽梅有傾筐之怨而已哉！仰觀天文，俯察人事，此而可存，孰為可亡？凡在有心，誰不扼腕？裕等所以椎心泣血，不遑啟處者也，是故夕寐宵興，搜獎忠烈，潛構崎嶇，險過履虎，乘機奮發，義不圖全。輔國將軍劉毅，廣武將軍何無忌，鎮北主簿孟昶，兗州主簿魏詠之，寧遠將軍劉道規，龍驤參軍劉藩，振威將軍檀憑之等，忠烈斷金，精白貫日，荷戈奮袂，志在畢命。益州刺史毛璩，萬里齊契，掃定荊楚。江州刺史郭昶之，奉迎主上，宮於尋陽。鎮北參軍王元德等，並率部曲，保據石頭。揚武將軍諸葛長民，收集義士，已據歷陽。征虜參軍庾頤之，潛相連結，以為內應。同力協規，所在蜂起，即日斬偽徐州刺史安城王桓修，青州刺史桓弘。義眾既集，文武爭先，咸謂不有統一，則事無以輯。裕辭不獲命，遂總軍要，庶上憑祖宗之靈，下罄義夫之力，翦馘逋逆，盪清京華。公侯諸君，或世樹忠貞，或身荷爵寵，而並俯眉猾豎，無由自效，顧瞻周道，寧不弔乎！今日之舉，良其會也。裕以虛薄，才非古人，受任於既頹之連，接勢於已替之機，丹忱未宣，感慨憤激，望霄漢以永懷，盼山川以增佇，投檄之日，神馳賊廷。檄到如律令！
惟諸葛長民愆期未發，謀泄被執，刁逵尚未得建康音信，把長民羈入檻車，派使解京。途次聞桓玄敗走，建康已為劉裕所據，那使人樂得用情，即將長民放出，還趨歷陽。歷陽軍民，乘機起事，圍攻刁逵。逵潰圍出走，湊巧遇著長民，兜頭截住，再經城中兵士追來，任你刁逵如何逞刁，也只好束手受縛，送入石頭，飲刀畢命！
裕至覆舟山東，令各軍飽餐一頓，悉棄餘糧，示以必死。劉毅持槊先驅，裕亦握刀繼進，將士踴躍隨上，馳突敵陣，一當十，十當百，呼聲動天地。湊巧風來助順，因風縱火。煙焰蔽天，燒得桓謙、卞范之兩軍，統變成焦頭爛額，與鬼為鄰。桓謙、卞范之，後先駭奔，裕復率眾力追，數道並進。玄已料裕軍難敵，先遣殷仲文具舟石頭，為逃避計。至是接桓謙敗耗，忙令子升策馬出都，至石頭城外下舟，浮江南走。裕得乘勝長驅，直入建康。
司徒王謐本系桓玄爪牙，玄篡位時，曾親解安帝璽綬，奉璽授玄。當時大眾目為罪魁，勸裕誅謐，偏裕與謐有舊，少年孤貧時，嘗由謐代裕償債，至此不忍加誅，仍令在位。未免因私廢公。謐又向裕貢諛，願推裕領揚州軍事。裕一再固辭，令謐為侍中，領揚州刺史，錄尚書事，謐更推裕都督八州，揚、徐、兗、豫、青、冀、幽、並。兼徐州刺史，裕乃受任不辭。令劉毅為青州刺史，何無忌為琅琊內史，孟昶為丹陽令，劉道規為義昌太守，所有軍國處分，均委任劉穆之。倉猝立辦，無不允愜。
這二十餘人各具智勇，充作前隊。何無忌冒充敕使，一騎當先，揚鞭入丹徒城，黨徒隨後跟入。桓修毫不覺察，聞有敕使到來，便出署相迎。無忌見了桓修，未曾問答，即拔出佩刀，把修殺死。隨與徒眾大呼討逆，吏士驚散，莫敢反抗。劉裕也馳入府署，揭榜安民，片刻即定。當將桓修棺殮，埋葬城外。召東莞人劉穆之為府主簿，更派劉毅至廣陵，囑令孟昶、劉道規，即日響應。
玄至江陵，收集荊州兵，有眾二萬，復挾安帝東下。行抵崢嶸洲，正值劉毅各軍，揚帆前來。劉道規望玄船，麾眾先進，劉毅、何無忌，鼓棹隨行。此時正是仲夏天氣，西南風吹得甚勁，道規乘風縱火，毅等亦助薪揚威，燒得長江上下，煙霧迷濛。玄所督領諸戰艦，多半被焚，部卒大亂。玄慌忙改乘小舟，仍將安帝挾去，遁還江陵。
益州刺史毛璩有侄修之，為玄屯騎校尉，誘玄入蜀。玄依言西行，至枚回洲，適上流來了喪船數艘，船首立著一員衛弁，與修之打了一個照面，便厲聲呼道：「來船中有無逆賊？」修之不答，桓玄卻顫聲說道：「我是當今新天子，何處盜賊，敢來妄言！」此時還想稱帝，太不自量。道言未絕，那對船上又跳出二將，拈弓搭矢，飛射過來，玄嬖人萬蓋、丁仙期，挺身蔽玄，俱被射倒。玄正在驚惶，突有數人持刀躍入，為首的正是對船衛弁。便駭