卻說劉遐、應詹，相繼去世，晉廷特派車騎將軍郗鑒，出領徐州刺史，前將軍溫嶠，出領江州刺史，再命征虜將軍郭默，為北中郎將，監督淮南諸軍事。劉遐妹夫田防，及部將史迭、卞咸、李龍等，不願他屬，竟擁遐子肇接任，反抗朝命。遐妻邵氏，諭止不從，乃潛自縱火，毀去甲械，免得滋亂。田防等尚不肯罷手，仍部署徒眾，準備迎敵。晉廷即遣郭默進兵，往討亂黨。默甫就道，那臨淮太守劉矯，已乘便襲擊，得斬田防、卞咸。史迭、李龍，奔往下邳，由矯督兵追及，也即擒誅，傳首詣闕。朝議令劉遐遺眷，及參佐將士，悉還建康。且因邵氏與肇，本未從亂，仍令肇襲父爵，留都養母，這也不必細表。
惟郗鑒陛辭出都，朝臣皆為餞別，王導常稱病乞假，至是也出送鑒行，為尚書令卞壺所見，即上書劾導，說他虧法從私，失大臣體，應免官示罰。宮廷雖擱起不提，但舉朝皆憚鑒風裁，各有戒心。壺平生廉儉，處事勤敏，不肯苟合時趨。丹陽尹阮孚，嘗語壺道：「君常無閑泰，終日勞神獨不嫌辛苦么？」壺正色道：「諸君子道德恢弘，侈尚風流，壺不與同性，自甘勞役，宜被人笑為鄙吝了。」是時貴遊子弟，多慕王澄、謝鯤等人，好為放達。壺在朝指斥道：「悖禮傷教，實犯大罪，中朝傾覆，皆由此輩，我恨不一洗惡習哩。」實是正論。隨即商諸王導、庾亮，擬奏劾當時名士。導與亮皆以文採為高，怎肯依議？壺只得罷休。惟導素尚寬和，能得眾心，至亮專國政，任法裁物，不滿人意。豫州刺史祖約，自恃重望，不落人後，偏明帝顧命，但及郗、卞諸人，於己無與，不由的心下怏怏。及遺詔褒進大臣，又不及約，連陶侃亦不得與列，所以約與侃書，疑亮從中舞弊，故意刪除，侃因此亦不能無嫌。侃且如此，遑問他人。
歷陽內史蘇峻，討賊有功，威望素著，部下甲仗精銳，遂致輕視朝廷，又嘗招納亡命，仰食縣官，稍不如意，即肆忿言。事為庾亮所聞，當然加忌，故令溫嶠出督江州，居守武昌，復調王舒為會稽內史，陰樹聲援。一面修繕石頭城，作為預備。丹陽尹阮孚，私語親屬道：「江東創業未久，主幼時艱，庾亮輕躁，德信未孚，恐禍亂又將發作了。」遂求為廣州刺史，得請即行。卻是趨避的妙法。南頓王宗，被亮調為驃騎將軍，失去要職，遂生怨望，常與蘇峻往來通書，欲廢執政。亮頗有所聞，已有意除宗，可巧中丞鍾雅，劾宗謀反，遂不請詔令，即使右衛將軍趙胤，率兵捕宗。宗也挈部出拒，戰敗被殺，貶宗族為馬氏。宗三子綽、超、演，皆廢為庶人。西陽王羕，系是宗兄，也降封為弋陽縣王。前右衛將軍虞胤，已徙職大宗正，至此復左遷桂陽太守。宗是王室近支，羕又是先王保傅，一旦翦黜，罪狀不明，勢不能愜服輿情，成帝全未聞知。過了多日，始問及亮道：「前日的白頭公，許久不見，究往何處？」原來宗多白髮，故呼為白頭公。亮沉吟半晌，方答稱謀反伏誅。成帝流涕道：「舅言人反，便好殺死，倘人言舅反，應該如何處置呢？」幼主能作是語，卻也不凡。亮不禁失色。但總以幼主易欺，遇有異己，必加排斥。宗黨卞闡，亡奔歷陽，亮遣人往索，蘇峻匿闡不與，去使只好回報，亮益恨峻。適後趙將軍石聰，進攻壽春，豫州刺史祖約，正在壽春駐守，見三十五回。聞後趙兵至，亟向建康乞援。亮前已忌約，竟不發兵。人可棄，地亦可棄么？聰進寇阜陵，建康大震。幸蘇峻遣將韓晃，領兵邀截，方得擊退聰兵。亮欲作塗塘，以遏胡寇。塗即滁河，在壽春東，若就河築塘，便將壽春隔開。祖約聞報大恚道：「這明明是欲棄我呢。」遂與蘇峻，密謀抗命，互通往來。庾亮以峻、約勾連，必為禍亂，擬下詔征峻入朝。司徒王導勸阻道：「峻好猜疑，必不肯奉詔，不若姑示包容，待後再議。」亮不以為然，召集群臣向眾揚言道：「蘇峻狼子野心，終必作亂，今日頒詔征峻，就使彼不順命，為禍尚淺，若再經年月，勢且益大，不可複製。譬如漢朝七國，削亦反，不削亦反哩。」語非不是，但知彼不知己，如何制勝？大眾聞言，莫敢駁議。獨卞壺接入道：「峻外擁強兵，逼近京邑，一旦有變，朝發夕至，現在都下空虛，還請審慎為是。」亮不肯從。壺知亮必敗，乃與江州刺史溫嶠書，略云：
元規 召峻意定，懷此於邑。溫生足下，奈此事何？壺今所慮，是國之大事，峻已出狂意而召之，是更速其禍也，必縱毒螫以召朝廷。朝廷威力，即桓桓稱盛，接鋒履刃，尚未知能否擒逆。王公亦同此情。壺與之力爭，終不見信，本出足下以為外援，而今更恨足下在外，不得相與共諫，如何如何？幸足下教之！
嶠得書後，即作書諫亮，亮終不聽。峻已得消息，遣司馬何仍入都，與亮婉商道：「討賊外任，遠近惟命，若欲峻內輔，實不相宜，請俯允通融，幸勿固執！」亮仍然不許，遣回何仍，召北中郎將郭默為後將軍，領屯騎校尉，命司徒右長史庾冰，為吳國內史，嚴兵戒備。於是下詔征峻為大司農，加官散騎常侍，令峻弟逸代領部曲。峻復上表道：「昔明皇帝親執臣手，使臣北討胡虜，今中原未靖，臣何敢自安？乞補青州界一荒郡，俾臣得效鷹犬微勞，不勝萬幸！」這一篇表文，呈遞建康，亮置諸不理，但促峻即日入都。觀峻兩次請求，尚非決意叛國；何物庾亮，必欲激成巨變？峻整裝將發，欲行又止。參軍任讓入語道：「將軍求處荒郡，尚不見許，事勢至此，恐無生路，不如勒兵自守，還可求全。」阜陵令匡術，亦阻峻入朝，峻遂不應詔，私自徵兵。
溫嶠聞變，便致書與亮，願率眾入衛京師。亮復嶠書道：「我憂西陲，且過歷陽，足下幸勿越雷池一步，免我西憂。」嶠乃罷議。亮尚遣使諭峻，示無他意。峻語朝使道：「台下說我欲反，我怎得再活哩？我寧山頭望廷尉，不能廷尉望山頭。從前國家，危如累卵，非我不濟。狡兔既死，獵狗應烹，我已自分一死，不過我無端遭枉，死也要死得明白呢。」朝使見話不投機，自然東歸。峻即遣參軍徐會，馳赴壽春，推祖約為盟主，共討庾亮。約不禁大喜，從子智、衍，又贊成約旨，便擬發兵助峻。譙國內史桓宣語智道：「本因強胡未滅，將戮力致討，奈何反還抗帝室呢？使君欲為雄霸，何不助國討峻，自顯威名？今乃與峻同反，怎得久存？」智視為迂談，鼻作嗤聲。宣更求見約，又以閉門羹相待，乃與約斷絕，不通往來。約遂遣兄子祖沛、逖之子。內史祖渙、女婿淮南太守許柳，率兵會峻。逖妻許氏，即許柳姊，固諫不從。姊為約嫂，弟為約婿，亦覺名義不合。峻既得約兵，因即發難，當有警報傳入建康，有詔命尚書令卞壺，領右衛將軍，會稽內史王舒，行揚州刺史事，吳興太守虞潭，督三吳諸郡軍事，整繕行伍，籌備出師。尚書右丞孔坦，司徒司馬陶回，司徒屬下有司馬。共至王導前獻議道：「峻已倡亂，必將東來，今請乘峻未至，急斷阜陵，守江西、當塗諸口，阻住叛兵，以逸待勞，一戰可決。若峻遲回不發，我亦可往攻歷陽，否則我尚未往，彼已先來，人心一動，便不能與戰了。」導極口稱善，轉告庾亮。亮不知兵法，躊躇未決。才閱兩日，果得姑孰緊報，峻將韓晃、張健等，掩入姑孰，所有鹽米，盡被取去。亮嘆悔無及，乃頒詔戒嚴，自督征討諸軍事，授右衛將軍趙胤為冠軍將軍，兼歷陽太守，使與左將軍司馬流，出守慈湖，另派前射聲校尉劉超，為左衛將軍，侍中褚翜，典征討軍事，並使弟庾翼，白衣從戎，領數百人戍石頭。
宣城內史桓彝，擬起兵赴難，長史裨惠謂：「郡兵寡弱，山民易擾，不如靜守待時。」彝厲色道：「汝獨不聞古語么？見無禮於君者，若鷹鸇逐鳥雀。見《春秋左傳》。今社稷危迫，君主受困，難道尚坐視不成？」說畢，即調集數千人馬，進屯蕪湖。峻將韓晃，乘他初至，便掩殺過去。究竟宣城兵弱，敵不過歷陽銳卒，戰不多時，竟致敗退。韓晃就進攻宣城，彝退保廣德，晃縱兵四掠，飽載而還。徐州刺史郗鑒，表請入衛，有詔令他備御北寇，不必移兵。時已殘冬，雨雪載塗，彼此未便行軍，因得相持過年。
未幾，為咸和三年正月，江州刺史溫嶠，出屯尋陽，遣督護王愆期，西陽太守鄧岳，即前文之鄧岳，遇赦復官。鄱陽太守紀睦為前鋒，進次直瀆。荊州刺史陶侃，也遣督護龔登，率兵會嶠，聽嶠驅遣。蘇峻恐日久兵集，屢促韓晃等進攻慈湖。慈湖守將司馬流，素來懦弱，未戰先怯但請濟師。庾亮再撥侍中鍾雅，為驍騎將軍，督領水師，前往助流，不防流為韓晃所襲，猝被摧陷，竟至敗死。趙胤亦拒戰失利，慈湖被奪，單剩鍾雅一支舟軍，如何濟事，沒奈何撥棹退回。蘇峻徑率祖渙、許柳等，擁眾二萬人，自橫江東渡，直登牛渚，進至蔣陵覆舟山。台軍節節敗退，警報與雪片相似，庾亮未免惶急。陶回覆入獻計道：「石頭設有重戍，峻必不敢直下。回料他必出間道，當從小丹陽步行前來，若用伏兵邀擊，定可擒峻。峻既受擒，祖約等自無能為了。」亮謂峻必直向石頭，不從回言。嗣聞峻果出小丹陽，夜迷失道，部伍盡亂，亮又自悔失機，縱峻得入，愚而好自用，烖必及身。都中大懼，吏民相率潛奔，朝臣亦各遣