關於瞻對如何善後，鹿傳霖先後上奏十數次，力主改土歸流，設立漢官。並具體提議將瞻對改設為「瞻對直隸廳」，同時，在章谷土司和朱倭土司地設立屯官兩員。
此時，清廷又擔心在中央政府與噶廈政府關係已經相當緊張的情形下，瞻對改土歸流勢必將使局面進一步惡化。「三瞻雖已全克，或收回內屬，或賞還達賴，均於大局頗形窒礙，實屬勢處兩難。……倘達賴因此觖望，諸事掣肘，將來印藏勘界一事，更難著手，是收回一說，談何容易」。但是賞還達賴，清廷也不甘心，「又恐藏番生心，威脅鄰境各土司，以致入藏路阻，將來駝只無人供應如何入藏？」
此時新任駐藏大臣文海尚未到達任所，清廷命令駐藏幫辦大臣訥欽說服達賴，讓藏方退出瞻對，由清廷給予賞銀，也就是付清原來所欠征瞻軍費，但藏方堅決不同意。
於是，瞻對戰勝後，善後事宜卻成為一件懸案，久拖不決。
鹿傳霖再奏文催促，上面就不耐煩了：「總之，保川固要，保藏尤要，籌善後，設流官，此保川之計，非保藏之計也。」
鹿傳霖只好耐住性子，等待清廷決斷。等了一年多，清廷還是舉棋不定，難下決斷。
駐藏幫辦大臣訥欽，雖不能說服達賴喇嘛放棄瞻對，但還是支持鹿傳霖的主張，專門上了一折，說「瞻對撤歸川屬無可疑慮」。時在光緒二十三年九月。此後不到一月時間，清朝中央專門管理蒙藏事務的理藩院報告，達賴喇嘛派人到京遊說，請求代為上奏，「懇求賞還瞻對」。
此間周萬順所領征瞻對清軍，「先派攻剿之四營，弁勇既多傷亡，亦甚疲乏，關外嚴寒，軍士思歸」，而瞻對地面「瞻民歡欣聽命，從前逃亡者多已歸來，惟紛紛控訴番官之凶暴苛斂，民不聊生，求歸內屬」。在此情形下，鹿傳霖以為瞻對地面並不需要留下太多兵力，便奏請把先到瞻對四營撤回，臨時委任張繼為瞻對彈壓委員，統帶後來進援瞻對的四營清軍，留三營「駐紮瞻對，籌辦善後。韓國秀一營駐紮道塢，兼顧章谷、朱倭善後」。
等待清廷決斷之時，德格土司派人來到瞻對，向瞻對彈壓委員張繼陳述冤情。
當地史料說，「切麥打比多吉在位期間，與下屬頭人發生矛盾，不能行使土司職權，曾請求四川總督派喬姓統領帶兵剿辦」。
《清代藏事輯要》載有鹿傳霖當時上達清廷的奏報，因為記於當時，應該更為確切：「查該宣慰司側旺多爾濟羅追彭錯克，其婦本西藏之女，生子昂翁降白仁青，向與瞻對番官對堆多吉交通，因而婦禁其夫而別居，子廢其父而自立……苛虐土民，一如對堆多吉所為。」也就是說，清廷冊封的老土司，已被由瞻對藏官支持的妻子和兒子奪位，失去土司大權了。清軍瞻對戰勝後，老土司又聽說藏官死於察木多，於是「該老土司迭次派人赴瞻彈壓委員張繼行營訴陳冤苦，而所部頭人等亦均紛紛詣營懇求」。
又查《德格土司世系》，前去告狀的應該是德格第十九代土司切麥打比多吉。十一歲時，他和其母被貢布郎加擄到瞻對南面扣為人質多年，貢布郎加兵敗後，才被藏軍解救回德格復職。切麥打比多吉被擄往瞻對的時間是1852年，派人到瞻對彈壓委員處告狀應是1897年。也就是說，這一年，切麥打比多吉才五十六歲。如此壯年，就被其妻、其子奪了大權，心裡自是不甘。
鹿傳霖接報，命令張繼前往「相機妥辦」。
「張繼即率師深入險阻，土民牛酒迎勞，因宣布朝廷恩惠，復感激涕零。惟小土司昂翁降白仁青，梗頑如故，尚欲奮其螳臂，糾謀抗拒，不意張繼已派營據其腹心。」光緒二十三年四月十一日，「該員輕騎馳抵土寨，遂將其母子一併縛獲」。
鹿傳霖早有在川屬土司地面改土歸流的設想，此時見德格土司家族因爭權內訌，正好藉機把德格土司地面也納入改土歸流的範疇。隨即上奏：「該老土司自揣衰病之軀，情甘乞退。請將悍妻逆子盡法懲辦，謹率全部獻地歸誠，並將印信賦稅冊籍等項呈繳。」這到底是事實，還是鹿傳霖為實現自己抱負而杜撰的一面之詞，已經難以考證。或者他保川固藏心切，虛構老土司情願獻土繳印，自廢為民的事實也未可知。但他看川藏大勢卻清楚明晰，一定要將川康地區北部各土司改土歸流，也確實是從國家利益著想。「打箭爐關外諸土司，以德格為最大……袤延於川藏之交，南北五百餘里，壤接西寧，東西兩千餘里，界連三十九族，乃茶商入藏之北路，路途較捷而地勢極要，又據金沙江上游，若扼險設防，則邊疆愈固。」「該老土司獻地歸誠，自應俯從所請，由川揀派文武，改設流官，措置周詳，深有裨益於全局。現在朱倭、章谷兩土司亦系改設屯員，辦理已有規模，與此事同一律，而壤地之廣大，邊防之吃重，尤為過之。」
清廷也同意：「德格小土司昂翁降白仁青母子，恣行不義，業經委員張繼擒獲押解爐廳收禁，該老土司頭目人等獻地歸誠，現擬改流設官。」