當日夜晚，龍江燕王中軍帳內。
京城已經全部落入燕軍手中。但此時朱棣臉上卻絲毫沒有興奮之色。他緊鎖著眉頭，在帳內不停地來回踱步，有時又心不在焉地望著京城的方向，似乎在等待著什麼消息。和他一樣，金忠、紀綱也是心神不寧，一副憂心忡忡之態。
下午，高煦已帶人進入紫禁城，並迅速將奉天殿的大火撲滅。但接下來，一個令朱棣大驚失色的事情發生了！高煦他們搜遍內宮，愣是沒發現建文的影子！消息傳來，朱棣當即下令，大搜皇城，活要見人，死要見屍！一個下午過去，皇城內被翻了個底朝天，可就是沒找到建文。這下朱棣覺得事態嚴重。別人找不到倒也罷了，建文要是不見蹤影，那麻煩可就大了。而且，不光是建文本人，就連太子朱文奎和馬皇后也沒見著，只找到一個嗷嗷待哺的二皇子朱文圭。為著這個事兒，朱棣連晚飯都沒吃，一直在金川門等消息，但直到天色全黑仍一無所獲。無奈之下，朱棣只得先返回龍江，留下高煦和朱能等一班人繼續搜查。
「殿下！」見朱棣一臉愁容，金忠出言勸慰道，「奉天殿不是找到一具死屍么？依臣看，那很有可能就是皇上！想來皇上是走投無路，只好闔宮自焚了！」
「難說啊！」朱棣嘆口氣道，「三保他們審問宮裡內官，說是大火之前，有人看見一女子到了奉天殿，遠遠瞧去似是馬皇后！」
就在下午，丘福從被燒得一塌糊塗的奉天殿中扒到了一具被燒焦的屍體。當時屍體已經全身焦爛，身上衣飾也都燒光了，故判斷不出死者身份。若內官之言屬實，那這具屍體很有可能就是馬皇后，而非建文。
「應該不會！」金忠略一沉吟，當即搖頭道，「以常理度之，若是皇后娘娘一個人自焚，那地點應在後宮，最有可能的地方便是坤寧宮。古往今來，哪有皇后獨自在外廷正殿自焚的？她去奉天殿，那只有一個理由，便是皇上召他前去，全家自焚！既如此，奉天殿內最少也應有兩具屍體，這明顯與丘福他們所發現不符！所以，依臣看來，奉天殿中屍體必是皇上的。奉天殿乃國家重地。既然京師告破，皇上無路可走，那他完全有可能獨自在此殿自焚。這等死法，也符合天子的身份！」
金忠分析的很有道理，朱棣聽了心頭稍寬。
朱棣倒不怕建文自盡。若建文真的選擇自盡，他反而是求之不得。畢竟，朱棣是打著靖難、清君側的旗號起兵的。若真把一個活蹦亂掉的建文擺在面前，那他還真得傻眼：要是廢了建文，那豈不是自打嘴巴？豈不是自己承認起兵是為了篡位？可要是不廢，難不成他還真學什麼周公輔成王，繼續把這個活寶大侄兒供在皇帝寶座上？
其實，眼下朱棣最擔心的，便是這位皇帝侄兒逃了出去！如今京師雖破，但天下並未完全歸附：近處，鳳陽孫岳、淮安梅殷，都還屯著兵馬，盛庸也正在江淮一帶召集潰卒，一副死戰不休的架勢。遠處，江南各省並未經歷戰事，他們會不會衷心歸附自己，現在亦未可知。若建文真逃了出去，再找個地方重舉大旗，那以他正牌子大明天子的身份，沒準兒頃刻間又能聚起百萬大軍。若不幸出現這種局面，那這場靖難之役的最後結局還真不好說。
正當朱棣心情稍放鬆些時，紀綱忽然又說話了：「金長史之言固有道理，但卻也存著疑點！」
「什麼疑點？」朱棣的心又提了起來，忙出言問道。
「疑點有二！」紀綱伸出兩根手指頭道，「其一，若奉天殿死的真是皇上，那皇后娘娘去哪了？太子又去哪了？皇后一介女流，太子也不過七歲。沒有皇上，這一對母子想憑自己之力逃出宮去，實是難於登天！而且當時宮外到處是我軍將士，他們又能逃到哪？其二，臣推斷，皇上逃脫，而馬皇后在奉天殿自盡，倒也不是不可能！皇后這一死，正好可以混淆視聽，讓殿下以為皇上舉火自焚了，從而保護皇上平安逃走，此為李代桃僵之計也！太子的失蹤，也可印證此點。他也有可能被皇上帶走。至於二皇子，他畢竟不是儲君，且年紀太小，喜歡哭鬧，逃亡路中無法照料，且易露出馬腳。故倉促之間，皇上只能將其拋下，以保自己和太子無恙！」
紀綱不愧是老謀深算，此番推斷同樣合情合理，且比金忠之議還略高那麼一籌。這下朱棣的心又開始怦怦直跳起來。
「王爺，狗兒回來了！」就在帳中諸人忐忑不安時，黃儼在帳外輕輕稟道。
「哦？」朱棣忙說道，「快叫他進來！」
狗兒躡手躡腳地跑了進來。不待他說話，朱棣先急急問道：「怎麼樣？宮裡可再有發現？」朱棣回龍江前，派狗兒和馬和一起，在宮裡整理各類物事。見他連夜跑回來，朱棣以為有了什麼新情況。
「王爺！」狗兒神情很是沉重，「奴婢剛才到女官尚寶司清查寶璽，發現竟少了三方！」
「什麼？」朱棣失色叫道，「少了哪三方？」洪武年間朱元璋共鑄了十七方寶璽，外加建文三年鑄成的「凝神之寶」，一共應是十八方。寶璽是天子權力的象徵，皇帝下發各類詔旨必用相應寶璽著印。此物遺失，頓讓朱棣覺得不妙。
「回王爺話，少的是『皇帝奉天之寶』、『制誥之寶』、『敕命之寶』。」
朱棣心中「咯噔」一下，臉色也隨即變得十分蒼白。「皇帝奉天之寶」乃唐宋傳璽，祭祀時用，於十七方寶璽中排位第一；而『制誥之寶』和『敕命之寶』是頒發詔旨和敕旨所用，亦是十分重要。它們的丟失，再和建文的下落不明聯繫起來，愈發讓在場之人感到心驚。
「會不會……是宮中混亂時，下人們把它偷走了？」金忠吞吞吐吐地問道。不過從其猶豫的神色中可知，他本人對這個想法也頗不自信。
「不可能！」朱棣想都不想就答道，「此物乃邦國重器，宮人偷它們也換不到錢財，且一旦暴露，還會引火燒身，株連九族！宮中值錢東西多得是，誰會不要命拿這個？」
金忠不說話了。此時所有人心中都明白，既然下人不拿，那拿的便只有主人了。而這個主人，很有可能就是建文。這三方寶璽，便是建文逃出京城後的身份證明！便是他號令天下的最好憑證！有了它們，建文便可發出讓天下文武無法質疑的皇帝詔旨，從而重新召集兵馬，與他朱棣再決雌雄！
事情發展到這一步已經比較清楚了：儘管建文的下落仍然存疑，但從眼下掌握的情況看，建文出逃的可能性，比他在奉天殿自焚要很大上幾分！
「他若真逃了，又是如何逃出去的呢？」朱棣皺著眉頭喃喃道。
燕兵一進城便直撲皇宮，當時便發現內城宮門緊鎖。從金川門到皇城，高煦頂多也就用了不到兩炷香的工夫，建文這麼快就能反應過來？這麼快就能易服出宮？這期間，建文至少得安排皇后到奉天殿舉火自焚，再拿上三方寶璽，並且帶上太子。這麼多事情，外加出宮出城，他兩炷香工夫就完成了？朱棣怎麼也想不明白，建文是如何做到這般神速的。
「使長！」就當朱棣仍在費力想像建文脫逃的過程時，一旁的紀綱打斷他道，「眼下不是猜測皇上死活的時候，使長您必須要有所動作！」
「做何動作？」紀綱的話把朱棣從冥思苦想中拉了回來。他微微一愕，隨即問道。
「防備皇上東山再起！」紀綱嗓音深沉地說道，「縱然皇上生死不明，咱們也得往最壞方面想，預先做好準備。否則若皇上真還活著，咱們很有可能措手不及！」
朱棣一下反應過來。紀綱說得對，防範於未然，在當前的形勢下，顯得尤為重要。
「你覺得本王該怎麼做？」恢複常態後，朱棣立刻打起精神，目光炯炯有神地射向紀綱道。
「首先，馬上派兵，守住沿江各渡口，堵住北上之道。」紀綱似早有準備，當即侃侃而談道，「眼下朝廷所剩兵馬，唯江淮最多。鳳陽孫岳、淮安梅殷、乃至盛庸和仍在山東的鐵鉉，這幾個人手上仍有部伍，且素來忠於皇上。皇上若想東山再起，最大的可能便是去投奔他們。」
「不錯！」紀綱話音方落，金忠便附和道，「除了北上，還得防備皇上溯江向西。湖廣的楚王、四川的蜀王，甚至雲南的沐晟，他們先前可都是支持朝廷的。皇上也有可能去找他們。」
「兩位卿家說得有理！」金忠話音一落，朱棣立刻出言贊同。隨即，他將狗兒招到跟前輕言數語，狗兒一點頭，然後一溜煙兒向外跑去。
「其次是什麼？」打發完狗兒，朱棣又回過頭對紀綱道。
「其次便是給皇上發喪！」
「什麼？」朱棣一時沒反應過來，略為奇怪地問道，「眼下他生死不明，咱們就這麼發喪，豈不冒失？萬一他沒死，又在哪個地方冒了出來，那咱們豈不是鬧了個大笑話？」
「回殿下！」紀綱一臉正容道，「這絕不是冒失，而是必須之舉！殿下您想，皇上若沒死，那殿下接下來該如何自處？是登基自立呢？還是繼續搜尋皇上呢？還有，若陛下萬一冒了出來，號召天下兵馬勤王，那殿下該如何