蔡濟民把詹大悲等人送走，又回到咨議局二樓繼續開會，研究黎元洪不肯就都督職，軍務緊急，如何處置？正議論時，突然，從咨議局對面，「啪、啪」射來一排子彈，窗玻璃被打碎，樓下院中喧鬧聲、驚叫聲、吹哨集合聲響成一片。眾人大喊：「旗兵來了，趕快迎戰。」
負責保衛咨議局的測繪學堂學生軍，立即持槍衝出咨議局，隔馬路向對面射擊。蔡濟民宣布會議暫停，準備戰鬥。為安全起見，派李作棟帶領黎元洪從後院去蛇山躲避。
黎元洪聽槍響便惶恐萬狀，李作棟帶他逃上蛇山。蛇山崎嶇蜿蜒，亂石磊磊，黎元洪深一腳、淺一腳，只嫌腿長短了，身子長得胖了。幸虧有李作棟在旁攙扶，來到蛇山樹叢歇下。李作棟道：「三十標管帶郜宸翔率旗兵偷襲，已經派兵迎戰。」
黎元洪則上氣不接下氣，話也說不出來，心口怦怦亂跳。槍聲時密時疏，大約過了半個多時辰，太陽落山時才平息下來。鄧玉麟從山後小路找來，說道：「都督請回，百餘名旗兵已被陸軍中學和測繪學堂學生軍擊退。」
黎元洪返回咨議局，鄧玉麟帶領黎元洪在咨議局走廊內走了一圈，以安人心。黎元洪心想：這咨議局太不安全，必須設法離開。
因此，回到小屋便向鄧玉麟道：「請向主事人轉達，我今晚必須回家看看，有事可在舍下找我。」
鄧玉麟答應轉達。
經過一場虛驚，革命黨人繼續開會。現在第一個議題是黎元洪要求回家，如何答覆？眾人頗為作難，既不好硬性不準，又怕他一去不返；如果逃走後與瑞澂、張彪合流，對革命更加不利。商量半天，決定派馬榮帶隊，配合學生軍二十餘人，護送黎元洪回家，夜間站崗守衛，嚴防黎元洪逃遁。
此時天色已晚，二十餘人護送黎元洪回公館。途經蛇山頂時，黎元洪停下腳步，遠望劉家廟江面船影幢幢，燈光閃閃，便向學生軍說道：「那不是商船，那是軍艦，要趕快命令炮兵射擊。」
眾人聽後高興，忽覺得黎元洪站到革命軍一邊來了。
黎元洪回到公館，家中人歡天喜地。吳夫人抱著未滿百日的麒麟兒給他看，說道：「剛才還兒哭爺，爺回來，兒就不哭了。外面確是你出的布告？」
黎元洪坐到藤椅上，遞眼色說道：「不說這個。」
如夫人黎本危端茶進來，低聲道：「老爺平安？！」
黎元洪道：「平安。家中不必為我擔心，你們擔心也無用。我今晚到協司令部歇息。你們明天收拾好，準備去上海。」
黎元洪故意放高聲音說，讓院內的革命軍都聽得清楚。二位夫人面面相覷，不敢再問。
黎元洪回到院心，把去協司令部休息的話又向馬榮說了一遍。
馬榮只好臨時分工，留下六人保護公館家眷，其餘跟隨到協司令部。到協司令部後，又怕再有旗兵夜襲，馬榮派人去咨議局報告協司令部兵力單薄，恐致不測，請示如何辦理。
已是夜晚十時，黨人還在開會。接獲報告後十分緊張，唯一辦法只有再增派十名學生軍，並轉告馬榮，無論如何，今晚謹防黎元洪逃遁。然後，黨人又繼續開會。
由於黎元洪不肯就職，黨人商定組織謀略處，以處理軍事方面重要事件。由蔡濟民、鄧玉麟、張廷輔（已出獄）、王憲章、吳兆麟等十五人組成。共推蔡濟民為召集人。謀略處在都督府辦公，並議決：
（一）都督府（亦稱鄂軍政府）設武昌咨議局。
（二）廢除宣統年號，改為黃帝紀元四千六百零九年。
（三）用都督黎元洪名義布告地方及通電全國。
（四）革命軍旗為十八星旗。
（五）軍政府暫設機關四部：參謀部、軍務部、政務部、外交部。
（六）設立招賢館。
會議開至半夜始散，再分途找人辦理起草宣言、通電等各類文稿。軍隊黨人對這類筆墨事不熟悉，只有求助原咨議局立憲派及各報館編輯、記者等幫忙。
這晚，吳兆麟和張振武在黎元洪的空房中過夜。起義前，張振武被任命為理財部副部長，但他素有投筆從戎之志，恨無機緣。起義成功後，他離開黃鶴樓小學堂，來到軍政府插手辦理軍務。這張振武傲物氣高，喜歡慷慨陳詞，和吳兆麟原不相識，談及黎元洪態度頑固時，張振武大發議論道：「這次革命，雖將武昌全城佔領，而清朝文武大員大都潛逃，未殺一個，革命軍未免寬容過分。既革命，非將清廷餘孽大殺一次不可；否則，將來必成國家之禍，革命亦有名無實。依我意見，黎元洪既不贊成革命，又不受同志抬舉，放他出去，又恐害人。好在現僅以黎名義發一布告，對外通電尚未擬就發出，莫如乘此將黎元洪斬首示眾，以揚革命聲威，使一般清臣漢奸聞風喪膽，實為直截了當。昨晚首義，總指揮既是吳先生，就以吳先生為湖北都督，名正言順。先生如肯相從，兄弟即向黨人保薦。」
吳兆麟駭異萬分，說道：「此事萬萬不可，兄弟資望太淺。即以湖北軍隊而論，各地均未響應，而帶兵官佐居我上者，決不肯相從；與我同級的，也必不悅服。欲收新軍全體官兵來歸之效，非借黎元洪資望不可。至於外省，如聞革命軍領袖是一小小隊官，豈不貽笑大方。我們欲革命速成，借黎名義號召天下，一則可使各省同情，二則使外人不敢輕視。切切勿懷二心。」
張振武不以為然，說道：「吳先生主張，未必盡然。以外國而論，法國拿破崙以中尉出身，而為歐洲盟主。只看才略，不在資望，中外都是如此。」
吳兆麟道：「中國歷史習慣，向以成敗論英雄，最講資格。兄弟官卑職小，決不能負此重任。如再談此事，兄弟只有一走而已。」
如此，張振武便也不好再說。
黎元洪在協司令部過夜，黎明起床盥洗後，忽見公館老媽子和危氏貼身丫環梅香送來食盒，被革命軍攔住盤問。這正是黎本危所出妙計，只因黎元洪昨日回家，行動說話多有蹊蹺，放心不下，故清早便派人送食盒來以便探聽動靜。
丫環梅香端上一瓷罐冰糖燉白木耳、一果匣蛋糕點心，出門站著。黎元洪吃完，丫環進門拾掇餐具時問道：「太太請問大人，中午吃什麼？」
黎元洪正躊躇，馬榮卻進門說道：「軍政府派人送信來，請都督即回咨議局。」
黎元洪搖搖頭，梅香只好怏怏而退。黎元洪本想在協司令部自在一下，現在只好回咨議局去。出協司令部大門時，黎元洪看到老媽子和丫環梅香遠遠站在牆角處昂頭瞭望。黎元洪心慌意亂，在大隊人員護送下，匆匆低頭走過。
黎元洪在協司令部歇息一夜，天明又被押回咨議局，重新交給學生軍看守。他心中很不自在，但又不敢說半個不字，只好端坐在小屋的木椅上。謀略處諸人為試探黎元洪態度，特派「智多星」吳兆麟持防務命令向黎元洪做報告，看他反映如何？
吳兆麟持公文篋，進門報告道：「軍政府接到報告：駐漢陽的第四十二標一營反正，佔領漢陽兵工廠，舉隊官宋錫全為管帶。駐漢口第四十二標一營反正，管帶逃走。綜計在武漢的新軍，除第四十二標三營，因駐京漢路沿線無法聯絡，張彪殘部在劉家廟外，其餘各部均已站在革命軍一邊。」
然後，吳兆麟把防務命令送到桌前，繼續報告：「武昌防禦亦漸鞏固，所有以前老兵，都按指定地點歸隊。舊有官長雖已離開，提拔一批中、下級軍官和排長擔任長官，官兵熟悉，容易接近，指揮上不致發生困難。命令是用『都督黎』名義發出的，更使軍中增加信心，都樂於完成任務。」
黎元洪聽過報告，看了一眼防務命令，也未加可否，只說一句：「由你看著辦吧！」
吳兆麟回謀略處介紹黎元洪的態度，眾人議論道：「這是半推半就。」
「他不公開反對就好，趕快把電報拍出。」
於是，以黎元洪名義擬就的各類電文送往武昌電報局，單只八月二十一日發出的電文多達十餘種。電文宣稱：「蓋元洪今日之舉，是合十八行省諸英雄倡此義舉……」
「元洪今日所痛苦者，念諸英雄皆懷經世之才，此時正可同扶漢族以救同胞」，又「元洪不德，謬膺推舉，為中華民國軍政府鄂軍都督」。電文中「本軍政府首舉義旗」、「本都督誓師宣志」等等，更連篇累牘。而凡此種種，黎元洪則聞所未聞，一概不知。
軍政府最擔心的是漢口方面英、俄、德、法、日五國租界的駐漢領事館的態度。租界本據商約而設，實則兵艦進出長江，停泊漢口江面，又有巡捕房、領事裁判權等，形成國中之國，干涉中國內政早已習以為常。胡瑛由武昌出獄後，被公推為外交部長，帶照會渡江，去各國駐漢領事館遞送照會。胡瑛是大名鼎鼎革命黨人，各國領事欣然接受，以便從照會中分析判斷，自有另外打算。
此時，武漢三鎮雖已光復，清兵南下之說甚囂塵上，軍事形勢仍然緊張。據各部隊上報，武漢三鎮兵力不過三千餘人，僅此