雖然展開追擊，武田信玄的本隊和後備穴山信君隊仍然按兵不動，似乎是為了保持戰力。不久，信玄的本隊終於移師，穴山信君隊也跟隨在後。
來到追分，信玄令各隊點燈行進。
這是為了讓敵軍知道本隊和後備隊的存在。
二萬名武田軍投入追擊戰，另外還保存了一萬兵力。或許，這就是他想要誇示的。
到了小豆餅，後備穴山信君奉令兵分二隊，在本隊前方左右展開。
不久，穴山全體隊員接到命令：
「我軍不久便會撤退。讓撤退回來的部隊調到後備。」
信玄已經想妥了收兵之策。如果不好好收回前去追擊的武田軍，則極可能遭到敵人的反擊。故點燈明示本隊所在之地。
武田隊的燈火在三方原上一片光亮。從濱松城看去，武田軍似乎又展開攻擊；在追罷歸來的武田兵眼中，則如展臂迎子的母親懷抱。傷兵順著燈火，陸續歸隊。追擊隊似乎仍想追敵，無意撤回。
信玄在小豆餅和犀崖中間停下，讓主隊準備過夜。穴山信君隊則繼續前進，負責看守面對犀崖的地帶。
犀崖橋旁燃著熊熊營火。
下令撤退的洋槍隊，連續射擊五次。片刻後，又射五次，隔一陣子後，再射五次。槍聲在暗夜中回蕩。
追到濱松城附近的追擊隊，由於中途各自分散，無法緊追著德川軍進城。跟進城，需要二、三千人的部隊一次擁入，而後緊緊跟入。
黃昏時分，三方原之戰無法再進行。如果戰爭在早晨展開，武田軍必可一口氣攻下。但是，黑夜阻撓了一切。黑暗中，誤打誤撞地來到城下，當然無法進入城內。
在洋槍隊發出撤退信號的同時，追擊隊朝各地的營火退回。德川軍並無反撲的態勢。
各隊開始點名，照料傷患，準備晚餐。營火照耀下的首級，有時會發生竟是同伴首級的悲劇。
各隊放出步哨警戒。
「敵軍必定會派出小部隊趁夜偷襲，各隊要小心警戒。」
夜襲時尤其須謹防同伴在混亂中自相殘殺。
各隊一半睡覺，一半負責警戒。
事實上，在野風呼呼的原野上豈能安睡？士兵們輪流去取柴火，盡量在營火旁休息。有人拿出餅燒烤，也有的人不知從那裡弄來的鍋，放在火上，加水煮雜食來吃。
士兵的情緒依然激動，無暇閑聊當天的功績。只要遠處一有槍聲，便立即擺出警戒姿態。
夜襲確實如預料中出現，只是規模不大。德川軍的洋槍隊向在最前線的穴山信君隊射擊。穴山隊的步哨遭到襲擊，僅此而已。濱松城內一片混亂，還不到反撲的時候。剛遭敗績的他們必須思索如何防備即將於天明後來襲的武田隊。
約二千人沒有回城。萬一他們全部陣亡，則是四比一的狀況。目前實在無暇反撲。
根據《當代記》的記載，德川軍和平手泛秀軍共有千人被誅，其中有多少德川軍，則不得而知。
無法於當夜回濱松城的將士，在次日武田軍離開城下後，陸續歸來。由於武田軍的追擊行動快迅，許多人不及入城，逃往四方。
《松平記》記載道：上方浪人中河等人逃到掛川，家康的譜代家僕山田半一郎逃到岡崎。
家康本營中的大將榊原康政，也在中途和家康等人走散，和數名騎兵逃到濱松東方的西島過夜。
許多被武田軍逼散而被迫於某地過夜的德川軍，在天亮後陸續回城，人數不少。
濱松城內的婦女們炊煮粥食，慰勞歸來的將士。被誅者達千人，負傷者更是三倍以上。照顧工作十分繁重。
對德川軍而言，這是一場徹底的敗仗。經過這一仗德川家康對武田軍敬畏萬分。信玄死後，勝賴率大軍前來挑戰時，德川軍不敢單獨應戰，對決多日後，才聯合織田軍在設樂原與武田勝賴軍交戰。
信長在本能寺被殺時，德川家康正在堺港。家康逃脫明智光秀之手，回到岡崎之後，首先出兵甲斐國，目的在驅逐信長舊臣，奪回甲斐。對於殘存下來的武田信玄的舊臣則極力吸收，以增加自己的實力。
三方原的痛苦經驗，給家康一個很大的教訓。
《甲陽軍監》對三方原之戰做了下列記述。
馬場美濃守信春認為，年三十一的大將家康，是全日本繼越後上杉謙信之後的大將。細看三方原之戰中戰死的三河武士，無一人朝武田軍方向倒下，皆是俯向，而朝濱松城倒下的士兵，大多是仰向。論及高傲的武士精神，則非上杉謙信和德川家康莫屬。
最後一段的記述，出自《甲陽軍監》作者小幡景憲之筆，主要在說明：
（德川軍之陣亡者，無一見背於敵軍。）
德川家康和上杉謙信皆被尊奉為日本第一大將，而三河武士精神尤被視為日本之最。歌頌德川家康的書籍，大多在德川時代的太平盛世出版，自然成為暢銷書。
小幡景憲誇張的記述，經常被其他出版物引用，甚至有不少這樣的俗書：
（武田信玄見三河武士無一人背向而死，心存恐懼，便下令停止攻擊，退至刑部。）
就連史書中，也有不少類似這樣的書籍。
《甲陽軍監》把三河武士形容成武士之最，但是相對的，《當代記》中則記載家康的譜代家僕山田半一郎逃到岡崎。山田半一郎僅是逃亡者的代表，實際人數自然是無從計算。
戰敗時的逃脫行為，乃人之常情。但是，德川旗下的夏目次郎左衛門和青山又四郎、中根正昭等人的為主公犧牲，確是真人真事。《甲陽軍監》中提到的武士精神，所指的應該是這些人吧！
在三方原上戰死的德川名將（中隊長、小隊長級），有青山又四郎、中根正昭、夏目次郎左衛門、鳥居忠廣、本多忠真和米津政信等人。分隊長級的人數更是可觀，在此無法一一贅述。大將（大隊長）級的戰死者，只有平手泛秀一人。
武田軍方面當然也有傷亡，但是沒有記錄，可能是因為損失不大。
夜，逐漸泛白。武田軍整理各隊隊伍，掃蕩附近殘敵。說是掃蕩殘敵，其實是想捕捉無法動彈的傷兵。武田兵充分運用僅有的一刻（二小時），搜索三方原一帶。
在一刻內，捕得數十人，大多是傷兵，有些人在被帶往武田營地的路上斷了氣。
被捕的傷兵受到照顧和飲食供應。
這時候，武田營內充滿了生氣。因為，統帥武田信玄就要檢視首級了。其實，捕獲的首級有上千個，自然無法在信玄面前一一展示。
在三方原之戰中領導軍團的大將，諸如山縣昌景、小山田信茂、馬場信春、武田勝賴、內藤昌豐等人，負責檢視首級。較有名氣的首級，才會被帶到武田信玄面前。
在檢視首級的現場，除了親武田的三河山家三方眾之外，還有俘虜以證人的身分參加。
在互報姓名下戰死的人，有姓名可登記。在混亂中取得的首級，若無第三者的證言，便無法辨明究竟是誰的首級。這時，就需要俘虜的證言。
大多數的首級，是在追擊戰中獲得，而其中又有不少是在二、三人圍攻一個敵人的狀況下獲得，爭功之事也隨之產生。在這種情況下，一般而言，功勞是由最先舉槍（或下手）的人所有。但是，黑暗中的追擊戰，很難分出究竟是誰下的手。在三人圍攻一敵時，誰都堅持自己是最先出槍的人，不肯相讓。三人所言均屬實，黑暗中，看不到他人之舉，只能相信自己的感覺。
爭功之事，暫時擱置，先談在首級冊上記下被殺的敵人姓名，以及立功者的姓名。
慨然讓功者，也是大有人在。這種人雖然被嗤為毫無慾望，但仍能若無其事地表示：戰爭還在繼續，仍有機會可以立功。
立大功者，在被記下功勛時，興奮得滿頰通紅。想到即將得到的恩賞，不覺陶然。
約五十個首級以及立功者，被帶到武田信玄面前。
山縣昌景在信玄身邊對首級和立功者加以說明。
信玄頻頻點頭，並向立功者稱讚道：
「了不起。」
「不愧是個武士。」
被誇讚的人感到全身發熱，趕忙行禮，久久不敢起身。在武田兵的心中，信玄有如神只。能直接被神誇耀，是莫大的光榮。
高間雄齋悄然。昨夜他已經知道那不是德川家康的首級，但總希望是榊原康政、本多康重、石川數正或酒井忠次等家老級的首級。可是，經俘虜證明後，才知道那是夏目次郎左衛門的首級。高間雄齋頓時像泄了氣的皮球。
信玄對高間雄齋說道：
「雖然不是家康公的首級，但是此人自報家康之名，則無異是砍下家康的首級。如此之功，才是不凡。」
被這麼稱讚，雄齋反而退縮了。
此後，高間雄齋有了一個渾名，即是偽首雄齋。對他而言，那不是件光榮的事。
檢視首級時，探子陸續回來，向