原子彈並沒有增強美國統治者的自信力。相反，他們越來越膽戰心驚，風聲鶴唳，深怕俄國人竊取原子彈機密，深怕布爾什維克用原子彈滅掉「美帝國主義」。而種種跡象也表明，俄國人的威脅和美國人的恐懼並非沒有來由。一切甚至從美國成功試爆第一顆原子彈之前就開始了。
一九〇八年成立的美國司法部調查局，於一九二四年擴大為聯邦調查局（FBI）並任命埃德加·胡佛為局長之後，這局長職位二三十年就沒換過人。一九四五年五月二十二日，FBI決定對全國二百萬公務人員和與「曼哈頓工程」有關者逐一進行審查，從部長到郵遞員無一倖免。十多天之後的六月六日，美國國務院中國事務顧問謝偉思因涉嫌「泄漏原子彈機密」而首先被捕。繼任者林德·查爾斯，即在中國待了四分之一個世紀，二戰中被日本人關在戰俘營里近四年，長期擔任過齊魯大學校長的查路德牧師。
從一九四五年五月開始的五年中，FBI對一萬名「重點對象」審查的結果，九千零七十七人遭到指控，二千九百六十一人被傳訊，三百七十八人被解職。很多人因此失業或自殺。FBI甚至指控一些高官如財政部部長助理懷特是「共產黨諜報員」，副國務卿艾奇遜和商業部長華萊士捲入了「蘇聯間諜網」，還把總統的紅人希斯送進監獄判刑五年。FBI以「共產黨外圍組織」罪名讓大批社會團體上了黑名單，第一批就有九十多人；美國共產黨被宣布為「外國（即俄國）代理人」，其十二名全國委員會委員被捕，大規模的逮捕和審判幾乎徹底摧毀了美共……
連愛因斯坦也上了黑名單。FBI密報說，愛因斯坦從一九三七年開始一直是三十四個共產主義性質組織的成員、發起人或與之有聯繫，還是三個共產主義組織的名譽主席。調查還波及愛因斯坦的姐姐、繼女和秘書杜卡。特工公然闖入杜卡的侄子家「搜集證據」。FBI還企圖串通移民局把愛因斯坦「驅逐出境」，只是迫於愛因斯坦聲望太高，此舉未能如願。
有過反戰或反核武器傾向，參加過「科學家起義」和「良心與責任協會」的科學家們，無一例外全部受到調查。丁潔瓊最初就是這樣「涉案」的。此外，她早就認識謝偉思，始終拒絕加入美籍，還是整個「曼哈頓工程」中惟一的非英美國籍者——凡此種種使她的「問題」變得尤其突出。在FBI的強硬要求下，佩里將軍和基地特工部門不得不在「曼哈頓工程」結束後仍以各種手段將女科學家滯留在阿拉摩斯……
奧姆霍斯本來備受官方青睞。但是，跟丁潔瓊的「特殊關係」使他也遇到了麻煩。FBI認為他對女教授的眷戀不止是男女之情，而是另有隱情。果然，通過深入調查，發現奧姆霍斯早在一九三六年西班牙內戰時就反對過佛朗哥，支持過共和國；一九三七年斥巨資支助過反法西斯組織；早年在德國留學及後來回美國任教時都喜歡結交自由派知識分子和共產黨學生……在自由民主的美國，這些事本來不算什麼；但在白色恐怖的美國，就足以使奧姆霍斯淪為「間諜嫌疑」了。調查還發現他儘管苦苦眷戀著丁潔瓊，但對女科學家並不忠實，一直跟住在聖何塞的一個舊情人麥勒保持曖昧關係。男人的花心在美國很常見，問題是那個叫麥勒的女人跟蘇聯駐聖弗蘭西斯科副領事有聯繫……
使事態急劇惡化的當然是丁潔瓊打給凌雲竹教授的那個電話，還有她寫給蘇冠蘭的一百八十七封信。在FBI的黑名單上，凌雲竹一直是中國知識界的左派人物，甚至可能是中共秘密黨員，而丁潔瓊竟向他泄漏了那麼多美國的「最高機密」！FBI早就從「習慣性」地拆閱私人通信中知道女教授有一位故國戀人，但認為兩人的關係大體上並未超出男女之情範圍；問題在於丁潔瓊那批信件，儘管未曾投郵，卻已經構成很系統的核情報和國家政治情報;這種情報一旦形成，就有可能通過某種方式傳遞給敵國。信件還證實，奧姆霍斯企圖以「形成制衡」為由向美國的敵人提供原子彈機密，而丁潔瓊則是他的同謀——於是隨著女科學家的被捕，奧姆霍斯在華盛頓以「行政調查」為由被剝奪人身自由。在FBI動員下，許多人紛紛斥責和揭發他。艾倫·泰勒「挺身而出」憤怒控訴說：如果不是由於奧姆霍斯的壓制和刁難，他泰勒主持研究設計的美國第一顆氫彈「早在一九四七年就試爆成功了」！
雖然發現了奧姆霍斯和丁潔瓊的「犯罪企圖」，但畢竟只是「企圖」。沒有相應的犯罪事實，也沒有造成任何實際犯罪後果。無法證明他們確實向俄國人提供了原子彈機密。這案子一拖三年，也把奧姆霍斯和丁潔瓊關押了三年。然而三年之後事態突生劇變：一九四九年八月二十九日凌晨四點蘇聯成功試爆了代號「鐵克瓦（南瓜）」的第一顆原子彈！情報表明，「鐵克瓦」簡直就是美國第一顆原子彈的翻版。
「鐵克瓦」無疑是從美國「偷」去的。但接下去的調查證實，蘇聯「偷」去的不是作為原料的鈾或鈈，而是原子彈的爆炸原理和全部生產工藝流程。
這就更可怕了！美國政府大為震驚。但從一九四五年六月至一九四九年八月沒有人身自由的丁潔瓊和奧姆霍斯，至少在這三年中是不可能出賣機密的；所有證據加在一起，也還不能證明是他們向俄國人出賣了機密。於是日曆就得往前翻，對「原子間諜」的調查範圍必須擴大，理應更加「白色」，更加「恐怖」！
丁潔瓊就是在這種背景下，於蘇聯第一顆原子彈成功試爆後第十二天被從紐約州圖姆斯監獄轉押到FBI下轄的「愛麗絲花園」。小島古木參天，環境幽雅。被軟禁在這裡的人們必須有「身份」，互不相識，沒有逃跑的企圖或可能。被軟禁者在兩個以上時，要保證他們相互不能接觸，為此配置的特工也多些。他們的處境比較寬鬆，生活待遇比較好；每人獨住一棟平房或小樓，這些房屋彼此隔離，「放風」時間當然也是隔開的。他們可以看報紙刊物，但不能收聽無線電廣播，不能看電視。因為近半年來只有丁潔瓊一名被軟禁者，她的自由度更大些，可以在所住屋子的院落內外走動，有時也可以到全島隨意散步。島上的幾名女特工，都為她一人「服務」。
胡佛好像比美國總統更忠誠於美國。連歷任總統都成了他的監視對象。他以各種方式利用各種場合對總統進行正言厲色的批評瞥告，以竊聽、跟蹤和拍照等手段狠抓總統在政治品質和私生活等方面的把柄。而偏偏歷任美國總統都有那麼多「把柄」可抓，於是都對胡佛畏之如虎，不得不對他畢恭畢敬，裝得言聽計從。在胡佛的壓力下，杜魯門總統於一九四七年三月頒布法令，強迫政府僱員和原子能工作者一律履行「忠誠宣誓」，由警察特務對他們實施全面的監督和調查；這一年還成立了權力極大的美國中央情報局（CIA），白色恐怖甚囂塵上，籠罩全國。
但原子彈的泄密證明這一切還遠遠不夠！於是參議員麥卡錫跳了出來。
一九五〇年二月，麥卡錫在西弗吉尼亞州惠林市發表演說，無中生有地宣稱有二百零五名共產黨人滲入到國務院，引起轟動。從一九五〇年五月開始加強對俄國「原子間諜」的偵查和逮捕。一九五〇年六月朝鮮戰爭爆發，國際形勢緊張，使麥卡錫更有了加劇白色恐怖的「理由」。一九五一年，「麥卡錫主義」逆流愈演愈烈。在聯邦調查局和中央情報局積極配合下，開明人士或哪怕只是有點個性的科學家受到大規模迫害。一九五二年底，麥卡錫出任參議院政府事務委員會下屬的常設調查小組委員會主席，發起了查找「共產黨顛覆者」運動，舉行了上百場聽證會，對五百多名「可疑者」進行了一系列傳訊……
胡佛與麥卡錫的聯手大獲成功。一方面是大批無辜者遭到迫害，一方面確實有很多蘇聯間諜被揭露，大量事實怵目驚心！譬如一九四五年四月底至五月上旬在阿拉摩斯召開的那個「秘密的、劃時代的和非常重要的」學術會議，參加會議的克羅斯·莫耶博士幾乎是剛散會就把會議內容交給了蘇聯外交官——而這位莫耶是根據羅斯福丘吉爾協議派往美國參加「曼哈頓工程」的二十八名英國科學家之一。調查還發現莫耶竟然是個德國共產黨員，當初是為逃避納粹迫害而輾轉到了英國的；他成功地隱瞞了共產黨員身份，取得了英國國籍，進入英國核研究的最高機構並成就卓著——正是這最後一點使奧姆霍斯指名讓莫耶參加「曼哈頓工程」並擔負了重要職責的，也是這一點使奧姆霍斯又蒙「污點」；調查還發現在阿拉摩斯期間丁潔瓊跟莫耶「過從甚密」，這一點加重了女科學家的嫌疑……
克羅斯·莫耶還給俄國人提供了X基地用擴散法生產鈾235的技術資料——問題是莫耶本人並未到過X基地。多次訪問過X基地並詳細了解擴散法生產流程的是丁潔瓊！
莫耶在很長一段時間內多次向俄國人提供情報。其內容有鈾彈和鈈彈的研製進展，相關的數學演算和設計圖紙，鈈彈內爆裝置模型草圖，兩座反應堆和一處鈈化學廠的資料，空氣冷卻和水冷卻兩種鈾反應堆的對照分析資料，建造節省原材料的同位素