吳祿貞並不知道第二十鎮的將領會被瓦解。自率部離開灤州後，他即將隊伍集中在石家莊，一邊派人以「招撫」的名義與晉軍指揮官聯絡，一邊向清廷謊報軍情，說他已經大獲全勝，晉軍同意投降。
清廷信以為真，隨即降旨嘉獎，任命吳祿貞為山西巡撫。在明知吳祿貞不可靠的情況下，他們的意圖很明顯，就是希望用爵位引誘吳祿貞，促使其進攻太原，並在進攻的過程中與晉軍同歸於盡。
吳祿貞拎得門兒清。他不僅假模假式地電奏謝恩，還一本正經地提到，原有巡撫關防大印尚在太原，丟沒丟不知道，為了辦事情方便，他另外又刻了木質關印一顆，拿來先用著。
實際上，吳祿貞根本不把區區山西巡撫放在眼裡，他一心要進攻的也不是太原，而是北京，這麼說只是要迷惑朝廷而已。
經過暗中聯絡，吳祿貞決定與閻錫山舉行會晤。雙方的會晤地點初定於石家莊，不料就在大家準備動身的時候，閻錫山突然又變卦了，說：「石家莊我不能去，那是吳祿貞的防地，萬一有變，那可如何是好？」
會晤地點就此由石家莊改為娘子關。吳祿貞聽說閻錫山如此膽小，不由得哈哈大笑：「昔日關雲長敢單刀赴會，何以今天的閻百川（閻錫山的字）不敢來見盟友，豈地靈人傑耶？時移勢易耶？」
吳祿貞拿關雲長來作比，是因為這位《三國演義》里的名將也是山西人，與閻錫山是老鄉。會晤當天，閻錫山帶了大批警衛，吳祿貞則輕隨簡從，只有參謀等三人跟隨，看上去吳祿貞倒更像傳說中的關雲長。
當著閻錫山的面，吳祿貞滔滔不絕地講述了他的革命計畫，主張由他的第六鎮、張紹曾的第二十鎮、山西晉軍共同組成燕晉聯軍，分三路進攻北京。他還肯定地說，現在清軍大批南下，北京空虛，只要聯軍一抵北京城下，大業就可唾手而得。
閻錫山等人認為吳祿貞分析得很有道理，於是公推吳祿貞為燕晉聯軍總司令，閻錫山為副司令。按照計畫，三路燕晉聯軍將於11月8日同時發難，會師京城。為此，山西方面先撥了兩營兵供吳祿貞指揮，隨後又派出一旅作為後援。
如果吳祿貞的對手僅限於載灃、良弼甚至蔭昌，此時似乎早已勝券在握。可惜螳螂捕蟬，黃雀在後，他的計畫將註定要被那個更厲害的人所終結。
吳祿貞的第六鎮和第三鎮同為北洋老六鎮的骨幹，但當時第六鎮已有一協被抽調到湖北前線，吳祿貞手下只有一協，再加上不是由他直接掌握的第二十鎮，要想攻下北京，自忖還無十足把握。如今有了晉軍助力，情況就不同了，吳祿貞在行事方面也更加大膽。
這時正好有一列向湖北前線運送械彈的火車經過石家莊，吳祿貞下令予以截留。他同時給清廷發去一份電報，要求清軍撤出漢口，還說他的這一要求若不能被答應，他的部隊將「阻絕南北交通」，甚至切斷湖北前線部隊的後路。
吳祿貞以為他在山西的所為神不知鬼不覺，但實際上袁世凱和清廷都已偵悉。只是在收到這份措辭強烈，等於是在威脅和恫嚇的電報後，他們的反應不同——清廷大為恐慌，只得回電答應吳祿貞的要求，下令湖北的前敵部隊停止進攻。袁世凱則痛下決心，立即給段祺瑞發去密電，要他設法除掉吳祿貞。
袁世凱讓段祺瑞負責除掉吳祿貞，是因為段祺瑞曾為第六鎮統制，可以利用原來的舊部，然而隔了好幾年之後，第六鎮的人事狀況已有很大改變，段祺瑞對此也不清楚，當然更談不上有什麼把握。
捏著袁世凱的電報，段祺瑞頗感為難，他急忙找來徐樹錚等人商議。徐樹錚聽後，立即表示這件事可由他來操作，毫無問題。
從日本回國後，徐樹錚曾在第六鎮做過一段時間的隊官，對吳祿貞和第六鎮的現有情況比較熟悉。吳祿貞性情急躁，他一當上統制，就想把第六鎮的軍官全換成清一色的自己人。第十二協協統周符麟染上了吸食鴉片的惡習，吳祿貞便以周符麟「煙癮甚深，形同盜賊」為由，致函陸軍部，想撤掉周符麟，另以士官出身的心腹充任協統。
陸軍部收到函件後，認為僅憑吸食鴉片一條，撤職理由不夠充分，便未予批准，但吳祿貞仍下達手諭，將周符麟開缺了事。自古砸人飯碗如殺人父母，這樣一來，周符麟就與吳祿貞結下了深仇，平時喝醉酒後常常拔出腰間所佩之刀，對吳祿貞進行怒罵。
徐樹錚找來周符麟，把欲除掉吳祿貞的計畫跟對方一說，正中周符麟下懷，馬上答應組織刺殺行動，同時還提供了幾個殺手的名單。
經過再三考慮，徐樹錚決定行動以馬隊管帶馬步周為首。因為馬步周是江蘇銅山人，與蕭縣相鄰，和徐樹錚乃是小同鄉，二人關係很好，同時馬步周還是段祺瑞在保定陸軍軍官學堂的學生，有此雙重保險，可料定不致誤事。
段祺瑞聽完彙報，也覺得比較靠譜，便命令徐樹錚秘密布置。