1911年10月31日晚，袁世凱乘專車南下督師。抵達信陽站時，他召見了駐信陽的高級將領，接見完畢，又特地把段祺瑞留在車中密談。
在與段祺瑞的談話中，袁世凱重申了「北方比南方重要」的觀點，認為南方革命軍只是一些烏合之眾，清廷失盡人心，大勢已去，同樣不足為慮，要說麻煩，就麻煩在掌握軍隊而且膽敢「造反」的張紹曾等人身上。
此時南方戰事吃緊，倘若分兵北上征討，不但無取勝把握，還要冒顧此失彼的風險。鑒於參加「兵諫」的不少將領都曾是段祺瑞的學生，張紹曾等也未真正投向革命軍，袁世凱決定攻心為上，派段祺瑞北上進行「安撫」。
袁世凱的擔心不是多餘的。張紹曾並非袁氏一黨，他對清廷任命袁世凱為內閣總理大臣一節很是不滿，又發表通電錶示臨時政府須由國會制定憲法選舉產生，清廷這樣的任命方式不合憲法。
看到妥協沒能起到應有的作用，載灃、良弼只得再派吳祿貞前往灤州做說服、疏通工作。
吳祿貞是中國留學日本的第一期士官生，同時在舊學方面也頗有根底。回國後他曾在東北幫辦延吉邊務，與日本政府進行交涉，因此早早就在軍政界嶄露頭角，並擁有較好的聲譽。
吳祿貞恃才傲物，但與良弼有著不錯的個人交情，這就為他的仕途開了綠燈。經過良弼極力向載灃、蔭昌推薦，並親自出面保奏，吳祿貞迎來了與張紹曾等人一樣的機遇，得以出任第六鎮統制。
派吳祿貞去灤州，是因為吳祿貞與張紹曾、藍天蔚是好友，三人在日本留學時即志趣相投，人稱「士官三傑」。可是載灃、良弼也許做夢都不會想到，吳祿貞也是當初灤州秋操發難計畫的參與者之一，而且他的思想比張、藍更為激進，張、藍要的只是改良，他卻恨不得立馬把清廷掀個底朝天。
吳祿貞到了灤州，不但沒有勸張紹曾息事寧人，而且還鼓動他乘清軍南征，合力進攻北京。
張紹曾手下的協統之一潘渠楹此前已被袁世凱收買，袁世凱向他許諾，只要「兵諫」平息，即讓他代替張紹曾做第二十鎮統制。一聽吳、張可能要聯兵攻打北京，潘渠楹趕緊把消息透露給了袁世凱。
包括袁世凱、蔭昌在內，清廷內部的一些高層人物本來就已經對吳祿貞產生了懷疑。原因是吳祿貞自當了統制之後，在部隊人事方面與陸軍部時有齟齬，給北京的函件也常常表現得態度傲慢、盛氣凌人，但凡提一個條件，你同意還好說，若不同意，不滿之情馬上就在奏章中直接流露出來。試問，哪一個統制會這麼囂張呢？
武昌起義後，吳祿貞來京，曾向蔭昌自告奮勇要「南下平亂」，說自己是湖北人，如果讓他去湖北，一定可以過江勸諭革命軍解甲投降。
蔭昌哪敢答應。等吳祿貞一走，他就對隨員說：「吳祿貞若到前方，必靠不住，當遇機除之，以絕後患。」
蔭昌說是這麼說，但在無憑無據的情況下也不敢冒失。現在潘渠楹的告密坐實了大家的猜疑，袁世凱立即授意軍諮局發出兩道命令：一是把灤州附近鐵路上的列車全部調進北京，斷絕第二十鎮進軍北京的交通工具；二是將吳祿貞從灤州調開，命其帶兵入晉平亂。
吳祿貞何等乖覺，一收到電令就知道他與張紹曾之間的密謀已經暴露，於是一不做，二不休，建議張紹曾聯合晉軍攻打北京。
「造反」本非張紹曾所願，他在這件事上一直猶豫不決，但到此地步，也只得勉強答應下來。就在張紹曾著手準備的時候，段祺瑞已經趕到北京，並向參加「兵諫」的將領逐一發去公開或秘密的電報。在這些電報中，他以同僚和師長的身份，勸將領們以國家利益為重，停止「兵諫」，服從袁世凱。與此同時，段祺瑞還派徐樹錚等親信幕僚前往自己任職的部隊聯絡和疏導。
參加「兵諫」的將領背景和想法不一，在段祺瑞的勸說下很快就出現了分化。第三鎮代理統制盧永祥原為段祺瑞的舊部，段祺瑞一發話，他就表示聽從勸告，服從調遣。第三鎮是北洋六鎮的精銳，人數、裝備都不在第二十鎮之下，盧永祥的態度轉變對第二十鎮造成了極大震動。
第二十鎮一共有兩個協統，潘渠楹不用說，早就是袁世凱的人了；另一個協統伍祥楨見勢不妙，也不再堅持要與朝廷對著干。其他中下級軍官不是段的舊部，就是段的門生，更是紛紛動搖。張紹曾處於被架空的狀態，就算他想「造反」都有心無力了。