扶郿戰役不僅打垮了胡馬聯盟，使關中地區全部解放，而且為解放全西北、支援西南戰場打下了堅實的基礎，創造了極為有利的條件。
扶郿戰役後，甘、青、寧的馬家軍，隴南的王治岐軍，西安綏署胡宗南的各軍，相互抱怨，吵成一片。
馬步芳抱怨胡宗南部聞風逃竄，事先沒有通知他們，幾乎使他們全部被殲滅。
王治岐埋怨西安綏署戰前一點情況都不給他們通報，結果他們3個師糊裡糊塗地開上來，又糊裡糊塗地被殲滅。
胡宗南則埋怨馬家軍撤的時候不通知西安綏署，結果解放軍由馬家軍的防區內插進來，把他的幾個精銳軍弄光了。胡宗南還埋怨王治岐對共軍那麼大的兵力把他們包圍了還不知道，影響了全盤計畫。
第18兵團司令李振抱怨裴昌會不及時接電話，貽誤了戰機；責備第90軍軍長，沒有得到他的命令，就擅自西撤。第38軍則埋怨李振在該軍戰鬥緊急的時候，不適時增援，反說第38軍兩個團叛變。
至於其他軍與軍、師與師，甚至團與團之間更是吵得不可開交。
一陣爭吵埋怨之後，胡宗南由南鄭到雙石鋪第5兵團司令部，追查戰事失敗的原因，並叫李振西同李振及綏署副參謀長沈策三人研究。
李振首先把失敗的責任推到裴昌會沒有及時接電話上，沈策也贊同李振的說法。李振西則另有高見，說：「失敗的主要原因，是我們對共軍的行動絲毫無所知，而共軍對我們的一切，卻了如指掌。直到第38軍軍部被共軍包圍，激戰了半天，第18兵團司令部還不相信，說是自相驚擾。特別像我們擺的『羊拉屎』的陣地，本難應付臨時發生的突然事變，在這種情況下，連我們在戰場上直接指揮作戰的人，都不知道怎樣處理才適當，就是裴昌會及時接了電話，也怎能作出適當的處理呢？」
因為沈策不同意李振西的說法，兩人吵得很兇。裴昌會還以為李振西會同胡宗南頂嘴，怕李振西吃虧，派李振西的侍從副官偷偷地告訴李振西少說話。
其時，胡宗南自始至終沒有說一句話，只在吃飯的中間，指示了第38軍、第65軍的整補辦法。胡宗南人接替第5兵團司令職。臨起身時，決定要裴昌會到後方休息去，另派胡宗南回南鄭時，又改變了主意，對裴昌會說：「好好的養病……」再也沒有提讓裴昌會到後方的事。可見胡宗南也深知，即使撤了一個裴昌會，也難挽敗局。
後來，國民黨軍的戰史在檢討這次戰役時認為：「關中會戰，主決戰方面由隴東沿涇水兩側指向於西安方面，打擊匪軍側背，立案頗佳。」「主決戰方面包含寧夏、隴東及第5（含隴南兵團）等兵團，但無統一指揮，不僅未能使打擊力量統合發揮，且諸馬只知擁兵自重，互相猜疑，各自為戰，於不願損耗各自兵力下，遇局部小挫而擅退，影響全局，功虧一簣。」「綏署對匪第18、第19兵團增援彭匪一事，以及該兩匪軍兵團之行動，均毫不知情。故西安綏署既不知寧夏及隴東兵團因小挫而退，又不明匪援軍之狀況，正如兵法所云：不知彼，不知己，每戰必敗。」（《國民革命軍戰役史》第5部第7冊）