巨金魚戰役歷時16天，晉冀魯豫野戰軍大踏步向敵占區縱深挺進，轉戰600餘里，在連續機動作戰中共殲滅國民黨正規軍3個半旅，加上偽軍和保安隊共計16000餘人，斃傷5500餘人。繳獲步槍7371支，輕重機槍755挺及大批彈藥和軍用物資。收復縣城9座，迫使已佔領濮陽、大名的國民黨軍回撤，又一次粉碎了國民黨軍打通平漢路的企圖，也支援了華東野戰軍的魯南作戰。
巨金魚戰役作為一個成功的戰例，已載入我軍的光榮史冊。劉伯承、鄧小平從戰場實際情況出發，在戰役中採取「批亢搗虛」「三變制敵」的戰法，充分顯示了我軍老一輩軍事家在作戰指揮上堅持實事求是、靈活用兵的鮮明特點和高超的指揮藝術。
1月30日劉鄧給軍委的報告，總結了巨金魚戰役的經驗。關於此次戰役的目的，劉鄧說：「在寬大機動中大量殲滅敵人，乃堅持主動權。我軍在北岸欲消滅王敬久集團未果，形成僵持。而蔣介石正欲以黃河放水隔我於北岸。故我毅然以3、6兩縱及7縱1個旅南下收復巨野、嘉祥、城武，進而收復魯西南，求得主動轉變戰略態勢。」「不管敵人如何攻陷濮（陽）、范（縣）、觀（城）、大名、南樂，威脅我後方，佯渡黃河逼我回顧，終不能不轉用其主力於隴海線，轉成被動。」
劉鄧指出：「攻敵所必救，消滅其救者；攻敵所必退，消滅其退者，是求得打運動戰殲滅敵人的好辦法。金鄉、魚台之蔣軍嫡系方先覺部，他一被打呼救之聲特別急而有效。88師之主力，甚至台灣初到徐州之70師140旅（無作戰經驗）趕來，張嵐峰和劉汝珍也趕來，但先後都被我們各個消滅了。」
戰役中不足的是「由於兵員不夠充足，及彈藥供應量之不足（我火力太弱未能攻下金鄉），曾影響到連續作戰與戰鬥解決。戰鬥進程不夠迅速與徹底。這是大軍大踏步機動作戰的極大苦事，當設法補救之。」（《劉伯承軍事文選》）