顯佑宮秘笈載：寧遠城下，汗王為紅夷大炮所傷。後又生癰於背，乃赴清河溫泉浴之。八月十一日，返瀋陽，欲共慶仲秋，大貝勒、大妃率眾迎聖駕於瀋陽西愛雞堡。是夜，大妃宿於艙中。子時許，汗王金瘡迸裂，駕崩於船中，享年六十有八。
努爾哈赤被抬進中軍大帳，渾身血肉模糊，代善、莽古爾泰嚇得真魂出竅，御醫們更是嚇得不知所措，給汗王擦拭傷口時手直發抖。汗王的前額、後背、左腿都在流血。臉色蒼白，氣息微弱，昏迷不醒。用了紅葯後血止住了，呼息漸漸增強，御醫這才鬆了口氣。
代善問道：「怎麼樣，父汗傷得重嗎？」
御醫道：「大貝勒，汗王傷得很重，但現在看還不至於危及性命，只要好好將養，就會慢慢好起來。」
「可父汗他怎麼一直昏迷不醒啊？」
御醫道：「一是叫大炮震的，二是從馬上掉下來摔的，不要緊，過一陣子就能醒過來。大帳中搞得暖和些，汗王年紀大了，這個當口可不能凍著。」
莽古爾泰氣得青筋暴跳：「他媽的這個袁蠻子，要叫我捉住你，非把你千刀萬剮不可。二哥，明天我再組織人馬攻城，我就不信一個小小的寧遠城咱們拿不下來？」
代善哭泣著：「五弟，算了，父汗都這樣了，還攻什麼城？等八弟回來再說吧。」
皇太極與阿敏率兩萬精兵，在寧遠城西北處埋伏下來，準備狠狠收拾一下前來增援的蒙古林丹汗。但寧遠那邊打了一天了，林丹汗的蒙古兵連個影都沒有。到中午時分，探子來報，林丹汗根本就沒動彈。皇太極笑道：「林丹汗正做著成吉思汗的白日夢，在大漠上坐山觀虎鬥，怎麼會輕易發兵援明？走，咱們撤，一同去打寧遠。」
行至半路，遇到了阿濟格。皇太極納悶：你不在父汗身邊，跑這來幹什麼？走至近前，見阿濟格神色不對：「出了什麼事？」皇太極問道。
阿濟格放聲大哭：「父汗……」
「父汗他怎麼了？」
「父汗……他被南蠻子的紅夷大炮炸傷了。」
皇太極聽罷腦袋轟地一下，就覺得天旋地轉，差點沒從馬上摔下來。親兵們急忙上前攙扶，皇太極停了一會：「傷哪了？傷得重嗎？」
阿濟格抽泣著：「我來時還昏迷不醒，二哥讓你快快返回。」
皇太極一句話也沒說，他兩腳一磕蹬，馬鞭一揚。「啪」地一聲，大白馬就像箭一樣地向前衝去。
到了大帳前沒等馬站穩，他便蹦了下來，直奔大帳中。這時汗王已經醒來了，皇太極看到父汗頭上纏著白布，白布上血跡斑斑，臉上毫無血色，雙唇緊咬著，看樣子是在強忍著巨痛。他跪在汗王的床邊，眼淚無聲地流了下來，輕輕地叫了聲：「父汗。」
努爾哈赤有氣無力地點了點頭。
御醫道：「請各位阿哥們出去吧，汗王現在最需要的是靜養。」
眾貝勒悄悄退了出來，皇太極牙齒咬得格格作響，恨不能立刻率兵踏平寧遠，他問道：「二哥，父汗怎麼受的傷？」
「八弟，真應了你那句話了，我們對寧遠城內部情況知之太少，袁蠻子不知從哪搞來一些大炮，厲害得很。一炮下去，咱們的人就倒下一大片，而且他們的大炮打得非常准，我們的將軍炮沒等靠前就被他們打啞巴了。將士們就是靠近了也躲不過去。我問咱們的炮手，他們說這叫平射，一般的炮手沒這兩下子，一定是受了特殊訓練。父汗見傷亡太重，又久攻不下，便親自督戰，剛上去不一會就被炸傷了。」
皇太極將眼淚擦乾，尋思了一會：「二哥，我看不是攻城的方法不對，以往我們都是這麼個攻法嘛。也不是弟兄們怕死沒往上沖，咱八旗兵沒有孬種。關鍵是袁蠻子有了新的守城火器。對這個東西咱們現在還不了解，如果強攻，照樣還得有傷亡。為了一個小小的寧遠城，咱們不值得。這仗不能再打下去了，先把父汗的傷治好再說。」
代善道：「我也是這個意思。」
莽爾泰眼珠子一瞪：「這也太便宜了袁蠻子。」
皇太極惡狠狠地發誓道：「五哥，我在這兒對天發誓，君子報仇，三年不晚，三年之內我定要叫這個南蠻子死無葬身之地，但眼下還不是報仇的時候。」
代善問道：「那咱們什麼時候撤？」
皇太極道；「要撤現在就撤，但就這麼撤也真太便宜了他。」他對身邊親兵道：「傳武納格和英俄爾岱來見。」
二人跪拜後，皇太極吩咐道：「據寧遠城四十餘里的大海中有一孤島，叫覺華島，明軍的糧草都屯在那兒，你二人率五千精兵，偷襲覺華島，燒了他的糧草，一粒糧食也不給他們留。」
皇太極轉身對代善道：「二哥，你率隊伍先走，我和五哥殿後。我們撤退時，盡量顯得慌亂些，給袁蠻子造成錯覺，以掩護武納格的偷襲行動。」
他又吩咐阿濟格：「你速將邢道長請到瀋陽城，越快越好。」
八旗兵從未受過這樣的重創，以往也有傷亡，但最終都是打了勝仗。勝利之後，或多或少都有所獲。如戰俘、婦女、財物等，可這次是兩手空空。清點一下，死了一千餘人，受傷的卻高達四千多，更為嚴重的是最高統帥負了重傷。紅夷大炮實在是太厲害了，傷胳膊斷腿的，未傷的抬著傷的，傷的在擔架上呻吟著，未傷的痛哭流涕。莽古爾泰心裡本來就憋著一肚子氣，叫這些人一哭更是煩躁，氣得他大罵：「爹個鳥，哭什麼，再哭看老子宰了你。」
因為怕汗王顛著，隊伍走得很慢，直到第十天下午，才到達瀋陽。邢道聽說汗王負傷，迅速趕到了瀋陽。汗王被抬進寢宮，立即開始救治。薩滿們在院中驅邪，邢道長在床前發外氣，為汗王散淤血，御醫們煎藥，代善則領著眾兄弟，阿巴亥領著眾妃子，到堂子中為汗王祈禱，祈求祖宗及各位神靈保佑。
汗王真是福大命大造化大，被大炮炸傷，又從馬上摔出兩丈多遠，一般人怕早就嗚呼哀哉了，可他竟奇蹟般地好了起來。尤其是聽說武納格和英俄爾岱燒了覺華島上的糧草，心裡算是得到了些安慰，這也是此戰的一大收穫。
一個月後的一個早上，他對大妃道：「扶朕起來，整天這麼躺著，非把人躺死不可。」大妃服侍他穿上了衣服，他站在地上，像是自言自語，又像是在問大妃：「你說這次怎麼就打敗了呢？朕還像從前一樣的攻城啊。從前南朝也有火器嘛。」
大妃對軍事上的事，絲毫不懂，不敢瞎說，但汗王在問，她又不得不回答：「汗王，臣妾聽眾貝勒說，這次南朝的火器和以前的不一樣，威力大多了。」
「不對，若是像打遼陽那樣，也把他的火藥庫點了，他還用什麼紅夷大炮？要是諜工裡應外合，賺開城門，要是……悔不聽八阿哥之言，以致有今日之敗。」他忽然想起，當初，八阿哥不是說張秉一之父在佟養性手下研製火器嗎？進行到什麼程度了？他一個人走出了宮，來到了東廂房皇太極的辦公處。
皇太極這些天就住在寢宮外的東廂房中處理公務，不敢離開半步。他正埋頭看一份漢官的奏章，聽見親兵們道：拜見汗王，他頭一抬，大吃一驚：「父汗，你怎麼出來了？邢道長臨行前，再三囑咐一定要靜養。」
汗王道：「朕覺得好多了，總這麼躺著，好人也躺出病來了。八阿哥，朕問你，張秉一父子研製火器一事搞得怎麼樣了，一晃好幾年了吧？」
「回父汗，近幾年來，進行過好多次試驗，要想增加威力就必須多裝火藥，可火藥一裝多，炮膛就爆裂，張秉一的父親炸死在了試驗現場。」
汗王嘆了口氣：「張秉一幹什麼呢？」
「現在在李永芳手下任游擊。」
汗王露出了一絲微笑：「好嘛，也當了大將了。張秉一功勞很大，不能虧待了他，這次打寧遠，要是有他作內應就好了。」
汗王低著頭陷入沉思，耳邊彷彿又響起了紅夷大炮那驚天動地的爆炸聲，他背著手走到窗前：「研究火器之事不能中斷，傳朕旨意，佟養性不要帶兵了，讓他專門負責研究火器，他朋友多，點子也多，把張秉一抽調出來，做他的助手，一定要造出咱們自己的大炮。」汗王看著自己這個愛子，發現皇太極眼眶發黑，臉龐削瘦了許多。這麼重的擔子壓在他身上，難為兒子了。突然，他覺得有好多話要跟皇太極說，他揮揮手，親兵們都退了出去。
「八阿哥，朕這回摸著閻王爺的鼻子了，算是撿了一條命。但朕六十八了，恐怕以後再也不能上陣殺敵了。」說著汗王頓覺無限傷感。
「父汗，勝敗乃兵家常事，何必為寧遠小挫如此傷感。」
汗王一拍案子：「朕一生攻無不克，戰無不勝，沒曾想敗在了一個小南蠻子手下！」
皇太極寬慰道：「不，父汗，不是敗在他的手下，是因為南蠻子用了紅夷大炮。」
「八阿哥，你不用安慰朕，朕心裡明白，朕這次是犯了輕敵的錯誤。倘若也能像打瀋陽，打遼陽那樣精心籌劃，拿下寧遠城當不在