1999年9月5日，美國國務院亞太副助卿謝淑麗在一個中國大陸旅美學人研討會上，發表了一篇名為「中國永續發展之挑戰」的講演，建議中國政府對台政策改變「一國兩制」的說詞，而以「一國三制」顯示更大的彈性，以此告訴台灣，台灣與香港是不一樣的。在她看來，大陸必須在兩岸議題上真正具有「政治家的創意」「胡蘿蔔的分量和大棒相當」，這樣才能對台灣提供統一的誘因。她還要求中國大陸應放寬對台灣加入國際經濟和科技組織的干預，以解決台灣問題。
謝淑麗還說，「大陸不動武絕對是最重要的要素」，使用武力有其災難性及毀滅性，對大陸或台灣而言都是一樣。大陸政策受到抵制時應該要問問何以台灣會這樣，「不能完全都怪罪李登輝一個人，大陸詆毀李登輝時，並不知道他的政策形成擁有充分支持，這些政策在台灣廣泛受到民意支持」。
多位大陸人士在會場上慷慨激昂地表示，台灣是中國領土不可分割的一部分，即使流血也不惜要以武力統一台灣，並質疑謝淑麗說李登輝是基於民意，如果大陸90%民意主張打台灣，美國是不是也該尊重大陸人民的民意？
謝淑麗以「舉例」方式提出的「一國三制」說法，台灣認為已牽涉兩岸對話的實質議題，有違美方過去不介入對話議題的立場。據稱，台灣當局曾向柯林頓政府表達對謝淑麗「一國三制」的不滿，美方則向台灣澄清，該說法不代表美方政策，僅是以舉例方式，說明大陸處理台灣問題應更具創意。
針對謝淑麗的「建議」，余克禮認為，這表明謝淑麗和美國政府一樣不了解「一國兩制」。
在此前的1997年，余克禮在《人民日報》發表了《歷史的使命·時代的要求》一文，詳細解讀了「一國兩制」的核心問題。他認為，實現祖國完全統一最現實、合理、切實可行、對各方都有積極意義的模式，就是鄧小平提出的「一國兩制」的科學構想。以「一國兩制」構想作為推進祖國和平統一大業的基本方針，中國政府先後同英國和葡萄牙政府談判，成功地解決了歷史遺留下來的香港、澳門問題。香港順利回歸祖國，標誌著「一國兩制」構想的巨大成功。香港繼續維持長期的繁榮穩定，將用事實進一步雄辯地證明「一國兩制」方針的正確性和現實的可行性，是解決台灣問題、實現祖國完全統一的最佳模式。台灣當局應以中華民族的整體利益為重，從維護台灣同胞的切身利益出發，切實認真思考以「一國兩制」模式實現祖國完全統一的問題。
在余克禮看來，「一國兩制」規劃的關鍵是：兩岸統一後，台灣將如同香港、澳門一樣，繼續保留其資本主義制度，經濟、社會制度及生活方式保持不變，但大陸則繼續實行社會主義制度。台灣與香港都屬資本主義制度，是同一回事。但在「一國兩制」之下，台灣的自治程度將高於香港，包括：香港不能有軍隊，但台灣允許保有自己的軍隊及地方性防務；大陸不派任何行政人員管理台灣事務，而是由台灣當地人員進行管理。
余克禮後來在接受美國克萊蒙研究所亞洲研究中心主任湯本訪談時說，最重要的是多數台灣民眾對什麼是「一國兩制」沒有真正了解。台灣當局將「一國兩制」污名化了。從蔣經國開始，到李登輝、陳水扁，對「一國兩制」進行歪曲、抹黑，使台灣民眾根本不知道「一國兩制」的真正含義是什麼。
他多次訪問台灣，聽到的是很多台灣民眾以為「一國兩制」就是中國大陸分掉台灣人民的財產，是統戰陰謀，是大陸要吞併台灣。他說，假若真是這樣，他也不贊成這樣的「一國兩制」。
事實上，「一國兩制」就是維護現狀，台灣一切不會改變。香港的「一國兩制」，按照通俗的話說就是「馬照跑，舞照跳」，台灣的「一國兩制」，則是「股票照炒，選舉照搞」，一切生活方式不變。台灣還可省下很多軍費及其他搞實質外交經費，用來提高老百姓的福利，開展基本建設，會使台灣經濟更好。
余克禮最初是研究香港問題的。香港回歸前，他所接觸到的香港學者很多人都不接受「一國兩制」，1998年後，他多次去香港，當年反對「一國兩制」的學者態度都變了，都贊成「一國兩制」。他認為，兩岸要走向和平統一，只有「一國兩制」。兩岸人民和全球華人都反對用非和平的方式，都反對你吃掉我或我吃掉你，我們希望用和平的方式解決兩岸問題。香港的發展就是例子。1997年香港回歸後，在金融風暴中，在最近與大陸的貿易中，都得到了祖國大陸的支持。兩岸統一後，台灣遇到了困難，大陸同樣會伸出援助之手。
回到謝淑麗有關「一國三制」的說法。余克禮認為，台灣問題之所以遲遲不能解決，與美國不無關係。台灣問題的出現，實際上也有美國的因素。為了其現實利益和戰略利益，美國總是用各種方式插手台灣問題，如向台灣兜售軍火，以台灣來牽制中國的發展等等。美國的這個政策還會繼續延續下去。
在他看來，台灣的一些人設法「傍」著美國、遠離祖國大陸，這真是中國人的不幸。中國歷經外強侵略、半殖民統治、國內分裂割據等種種災難，可有人還是醒不過來，寧願給西方當幫凶，而不願做自己的主人。但俗話說，蒼蠅不叮無縫的雞蛋。有些人，特別是那些「台獨」分子，動不動就擺出一副「悲情」，可憐兮兮地乞求美國的「幫助」，企盼美國插手台灣問題，沒有一點做人的尊嚴。實際上，你沒有民族自尊，西方人也會看不起你的。你可能為得到一次過境落地簽證而興奮不已，可你只不過是人家謀求利益的工具，這真夠可憐的！
余克禮研判，隨著兩岸交流的擴大和密切，隨著中國國力的增強，美國干預的著力點會越來越少，終究會無法插手台灣問題，就像英國最終從香港完全退出去一樣。
但就當前的形勢，余克禮認為，無論美國方面提出何種建議，中國仍然堅持台灣問題為中國內政，不允許外力插手。他說，外國關心並促進兩岸統一，中國表示歡迎；但如果想干涉內政則絕對不允許，這是中國一貫的立場與態度，謝淑麗也不能例外。