四平失守之後，毛澤東命令林彪：「長春衛戍部隊應立即開始布置守城作戰，準備獨立堅守一個月，不靠主力援助，現時我主力則將在敵人兩側及遠後方行動。」毛澤東不是不知道大平原上的長春不利防守，也不是不知道我軍已消耗很大，疲憊不堪。這種考慮仍是從當時國共兩黨正在進行的談判這個大局出發的。
就在四平之戰之前不久的4月下旬，蘇軍已完全撤回蘇聯，東北的接收問題已不存在，存在的只是國共雙方如何劃分在東北所佔地域的問題，雙方如果再打，當然就是純粹的內戰。周恩來多次向馬歇爾和蔣介石談判東北的停火問題。這時中原並未怎麼打，馬歇爾還想暫時把內戰控制下來，所以也勸蔣介石停火。他甚至表示，如果再不停火，他就退出調處回美國。這時，中國民主同盟提出了一個折中方案，就是共產黨的軍隊退出長春，國民黨軍隊也不進入長春，在這種情況下再行談判全面停火。可是蔣介石非但不停火，反而在四平大打一仗。這時，毛澤東估計在我方和美方的壓力下，停火有一定可能。如果我們能守住長春，就可能在停火時多佔有一片地區，就可以在談判中用退出長春來交換其他條件。
但是，事態的發展出乎毛澤東的預料。杜聿明在攻下四平之後，就命令部隊繼續前進，直指長春。杜聿明的考慮是，一則共產黨發動群眾、擴充隊伍的速度很快，如果不很快攻佔長春，東北民主聯軍很快就會有強大的兵力來守衛長春；二則東北最大的水電站小豐滿電站就在長春附近，如不控制在手，整個東北包括瀋陽在內用電就無法保證。本來這時蔣介石是沒有命令杜聿明立即進攻長春的，在瀋陽督促戰事的國民黨軍隊總參謀長白崇禧也認為打長春把握不大，但杜聿明認為有把握，從而說服了白崇禧，這才指揮著軍隊向北推進。是不是完全有把握，杜聿明心中並不是真正有底。可就在這時，出現了一個突發事件——我軍在東北解放戰爭期間出現的最嚴重的一次叛徒事件，即王繼芳的叛變。
王繼芳是一個參加過長征的老幹部，這時擔任東北民主聯軍總部的作戰科長。5月19日，當我軍撤出四平之際，他叛變革命，當了叛徒。
由於他原來所擔任的重要職務，了解我軍大量的機密，故而他的叛變給我軍的行動造成了十分嚴重的後果（王繼芳叛變後進了軍統特務系統，四川解放後在重慶被捕，被送到當時第四野戰軍總部所在地武漢市槍斃）。
杜聿明從王繼芳那裡得知了我軍各部減員的情況和已經決定向北撤的部署之後，下定了向北進攻的決心，命令新六軍等部以汽車坦克急速向長春一線推進，並宣布首先進入長春的部隊賞東北流通券100萬元。
這時我軍主力都已投入到四平之戰，長春的兵力不多。在四平之戰後，我軍主力消耗很大，有的部隊在激戰中已經分散，在向長春轉移時，天上有敵軍飛機的轟炸，地上有敵軍機械化部隊不時的攻擊，速度不可能快。長春周圍是一馬平川，無險可守，兵力少了是無法守住的。
根據這種實際情況，東北局為了保存實力，避免無價值的犧牲，做出了退出長春的決定。
1946年5月23日，國民黨軍隊佔領長春。杜聿明本想繼續向北進攻拿下哈爾濱，但他卻在松花江南岸停了下來，讓我軍得以沿松花江為界暫獲休整。杜聿明所以會停下來，是由於以下兩方面的原因。
第一，蔣介石為一時的勝利沖昏了頭腦，就在國民黨軍隊進入長春的那一天，他偕同夫人宋美齡，在白崇禧等大員的陪同下，飛到瀋陽視察，30日又飛往長春視察。他一來，大小頭目都得陪同或等候召喚，各路軍事行動只得一概停止。
第二，為了緩解北滿方面的壓力，中央軍委和東北民主聯軍總部命令我南滿地區部隊在本溪地區尋機殲敵。我遼東軍區部隊在蕭華的指揮下從5月15日開始行動，發起了鞍海戰役。5月22日，我四縱收復鞍山。
在我方的軍事壓力和政治爭取下，海城守軍在潘朔端師長帶領下於5月30日宣布起義。6月3日，我軍又攻佔了大石橋。整個鞍海戰役共殲敵3300餘人，爭取起義2700餘人。特別是潘朔端的起義是東北第一次整師起義，也是東北戰場上我軍第一次吃掉一個整師的戰例，對東北戰場戰局影響很大。
由於國民黨軍隊已經佔領了長春，控制了大半個東北。所以，蔣介石於6月3日飛返南京之後第三天，在和馬歇爾商議之後，宣布停戰15天，以便在下一步的談判中取得主動，在全國人民面前撈取政治資本。
同時也是為了休整部隊，準備更大的進攻。
停戰期間，國共代表又進行和談。種種情況表明，和談進入了關鍵時期。如果這次和談破裂，國共兩黨之間的和談很可能徹底破裂，內戰將全面拉開。6月18日，蔣介石通過馬歇爾向中共代表團提出《東北整軍及中共軍隊在關內外劃地駐留之方案》，他要佔領包括哈爾濱在內的大部分地區，我黨只能在佳木斯和齊齊哈爾地區活動。我黨當然不可能接受這種條件。不能和平解決問題，就得準備大打。1946年6月19日，中共中央就向全黨發出了準備大打的指示。6月22日，又給東北局專門發出了類似的指示。6月24日，林彪給中共中央發了一份長電，報告東北如果要大打將會遇到的困難，認為「目前能爭取和平為有利」，為此，可以「作暫時的一定限度的讓步」。6月25日，中央給林彪本人發出了「國民黨一切布置是打，暫時無和平希望」，「全國大打」，「全靠自力更生」的指示。
中央的估計是正確的。6月26日，蔣介石就開始全面進攻我中原解放區，全面內戰爆發。7月2日，周恩來和蔣介石進行會談，毫無結果。
國共兩党進行了大半年的和平談判從此停止，此後再也沒有進行過正式會談。雖然周恩來仍在國統區與各界人士進行聯絡，做各方面的統戰工作，還與美方多次討論過停戰問題，但國共和談實際上已經徹底破裂（周恩來等在11月19日返回延安，參加軍事調停處執行部的葉劍英等人則一直到1947年2月21日才回到延安），全面內戰已不可避免。
全面內戰開始後，從全國來看，由原來的「關外大打，關內小打」，變為「關外小打，關內大打」，因為蔣介石把內戰的重點放在中原、陝北和山東。東北地區大致保持了以松花江為界的對峙局面。由此，我東北局把主要力量放到了根據地建設上來。