在阿里巴巴之前，互聯網流行的是三大模式：雅虎的門戶、亞馬遜的B2C以及eBay的C2C。馬雲則提出：「看得清的模式不一定是最好的模式，看不出怎麼賺錢的模式說不定最好。」於是，他打造出互聯網的第四種模式：針對中小企業的阿里巴巴B2B模式。在馬雲的「阿里帝國」中，誠信通、淘寶網、支付寶、雅虎中國以及阿里軟體等一系列產品，一直引領著互聯網的潮流。
阿里巴巴剛建立不久，就有一位青島商人需要在青島本地購買設備，苦於沒有信息來源，不得已之下才找到阿里巴巴。青島商人並沒費多大力氣，只是在阿里巴巴網站上發了一條求購信息，便很快解決了問題。還有一家東北企業利用網路，每年從網上搜集義烏、溫州企業的最新產品圖樣，接著從當地購回樣品照著生產，然後再到阿里巴巴上發布信息尋找買家。一年下來，他們90%的買家都來自阿里巴巴網站！
一傳十，十傳百，阿里巴巴網站在商業圈中聲名鵲起。馬雲在看到國內「大好形勢」的同時，也意識到阿里巴巴仍面臨著一個巨大的戰略選擇——國內電子商務尚不成熟，只有利用發達國家已深入人心的電子商務觀念，為外貿服務，才是真正獲得豐厚的利潤。於是，他在阿里巴巴上開設了一個專區——中國供應商，把中國大量的中小型出口加工企業的供貨信息，以會員形式免費向全球發布。
到2001年12月底，阿里巴巴「中國供應商」會員迅速達到100萬人，成為全球第一個達到此數目的B2B網站，並在當月實現贏利。阿里巴巴真正開始賺錢了！這是一個值得紀念的時刻，因為它向全世界宣告馬雲創建的電子商務B2B模式是正確、可行的。
阿里巴巴開始逐漸被業界認為是全球最優秀的B2B網站，國內外模仿阿里巴巴的網站大量出現，有的直接抄襲，甚至連那句「如有問題，請與阿里巴巴聯繫」也不做修改。
2004年2月17日，馬雲在北京宣布，阿里巴巴再獲8200萬美元的巨額戰略投資。這筆數額巨大的投資，也是中國互聯網業界迄今為止金額最大的一筆私募資金。此次投資人包括軟銀、富達創業投資部、GGV和TDF風險投資有限公司。
過去幾年當中，軟銀、富達和TDF風險投資有限公司始終是阿里巴巴的投資人，總部位於矽谷的GGV是才加入的投資人。這次私募由軟銀牽頭，私募後軟銀繼續保持阿里巴巴第二大股東的地位，最大的股東則是公司的管理層和員工。
馬雲接受上述投資，是因為他們的投資目的符合公司長久持續的發展戰略要求。馬雲說，中國電子商務的產業格局將有巨變！一個新的互聯網應用人群——「網商」將成為焦點，中國互聯網將由「網民」和「網友」時代轉入「網商」時代。作為「網商」的代言人，阿里巴巴有一個使命，要把互聯網帶入「網商」時代。
從2000年底，阿里巴巴的會員就以每日增長一兩千的速度發展，每天可收到3500條商品供求信息，700餘種商品信息按類別和國別分類。一個想買1000支羽毛球拍的美國人可以在阿里巴巴上找到十幾家中國供應商，了解他們不同的價格和合同條款；位於中國西藏和非洲迦納的用戶，可以在阿里巴巴網站上走到一起，成交一筆只有在互聯網時代才可想像的生意……
如今，阿里巴巴已經成為世界上規模最大的B2B企業，更是中國B2B行業的「王者」。
按營業收入計算，阿里巴巴佔據了國內50％以上的市場份額，第二位的環球資源只有20％。按註冊用戶計算，阿里巴巴更是無人能敵，高達2000多萬，而第二位的慧聰網只有300萬，營業收入不到阿里巴巴的1/10。其他的中小網站如中國化工網、中國服裝網等行業垂直網站更是難以望其項背。
在B2B領域，阿里巴巴基本上沒有競爭對手。難怪馬雲說，他用望遠鏡都找不到競爭對手，雖然狂妄倒也是事實。因為在B2B領域，參與者基本上都是企業，具有相對的穩定性，一旦認準一個平台就不會那麼容易轉換。
B2B網站的主要客戶是中小企業，習慣於享受互聯網的免費大餐，大部分的註冊者都不願意購買付費服務，國內大部分B2B網站都處於燒錢的狀態。B2B收入模式以會員費和廣告費為主，由於免費客戶也可以發布、搜索信息和使用一些基本的服務功能，出於成本考慮大部分中小企業選擇免費服務，付費會員比率一般只有10％左右。
行業贏利的艱難、阿里巴巴遙遙領先的優勢和良好的財務狀況，將使其他B2B網站難以撼動阿里巴巴的領先地位。
中國的中小企業數量持續增加，使用第三方B2B電子商務平台的仍不到三成，而這一比率呈現出快速提高的趨勢，也就是說未來將有更多的中小企業選擇這一服務。同時隨著互聯網的發展，收費服務將越來越為用戶所接受，更多高價值的B2B增值產品的出現也將使客戶更心甘情願地購買付費服務。阿里巴巴近年註冊和付費會員的高速成長說明了這一點，會員收費為阿里巴巴帶來了穩定的現金流。
阿里巴巴能成長為「B2B王者」，還有一個重要原因是中國日益成為世界製造中心和採購中心。中國擁有世界數量最龐大的產品供應者，蜂擁而至的世界各國採購者。這些企業大部分都是中小型企業，阿里巴巴為它們提供了高效而低成本的營銷渠道。
馬雲最先發現這一商機，並緊緊地把握住了機遇。「馬太效應」讓阿里巴巴的會員數量成倍增長，越來越多的市場份額被阿里巴巴佔據。
馬雲的日子開始好過起來，他開始向全球出擊，到世界各地去展示他的「絕世口才」。如今，商人們打開電腦，看到的界面是Windows；將來，他們看到的也許會是阿里巴巴！因為馬雲說：「他們需要的一切服務，阿里巴巴都將提供！」
阿里巴巴，不僅是B2B的王者，更要成為「貿易」的同義詞！
2002年3月，一雙緊握在一起的藍色小手標誌，出現在阿里巴巴中文網站部分會員的商鋪頁面上，它有一個響亮的名字：誠信通。
誠信通只是一個軟體，重要的是其無形的價值，它承載著誠信的記錄和評價。誠信通同時也是一種信用評價機制，它與其他信用評價機制相比有著很顯著的特點：政府部門、銀行和不少社會機構都有信用評價機制，但這些信用資料既沒有形成網路，也不公開。阿里巴巴對申請成為誠信通會員的客戶有嚴格的審核程序，企業的資料，除了它的資質，還包括它提供的別人對它的評價和其他會員對它的負面評價，阿里巴巴都會在網上公開，而且不會刪除。一個誠信通客戶想要了解另一客戶是很簡單的事。
做人要講誠信，個人的誠信越好，聲譽就越好。做企業就像做人，聲譽和誠信對企業的發展同樣重要。馬雲開始注重阿里巴巴網站上的企業是否誠信經營，他要打造中國企業的誠信，樹立阿里巴巴的誠信。
2001年年底，B2C網站My8848轟然倒塌，直接將網路信用推向崩潰的邊緣。這是中國互聯網環境變得浮躁的一個縮影，當時許多網路公司紛紛從免費網路服務轉向收費服務，單方面撕毀了之前承諾的免費協議。網路信用變得岌岌可危，中國電子商務在發展初期遭遇了誠信危機。
各電子商務公司降低門檻和擴大規模，魚龍混雜，平台上各客戶的品質和規模必然良莠不齊，甚至有不少企業會渾水摸魚，以次充好，影響了整個虛擬市場的大環境。因此，「誠信」被推到了台前，成為馬雲和阿里巴巴不得不馬上解決的難題。
馬雲在這樣的大背景下，開始了重塑網路信用之路。馬雲認為，在B2B領域，最終決定勝負的不是資金或技術，而是誠信。國內在線支付系統的不發達、郵政網路的滯後、誠信環境的缺失，使得安全支付成為電子商務發展的最大瓶頸。如果誠信體系不建設好的話，電子商務信息流仍是毫無價值的。
於是在2002年3月，馬雲和信用管理公司合作，啟動了「誠信通」計畫。該計畫主要通過第三方認證、證書及榮譽、阿里巴巴活動記錄、資信參考人、會員評價等5個方面，來審核申請誠信通服務的商家的誠信。該計畫實施的結果顯示，誠信通的會員成交率從47%提高到72%。這是首次用傳統手段，而非技術手段來解決網路商家之間的信任問題。
在阿里巴巴構建的商務平台上，誠信通檔案是誠信通會員必填的基本信息。它由4個部分組成，主要是用來展示會員的一些基本誠信情況，包括：A&V認證信息、阿里巴巴活動記錄、會員評價、證書及榮譽。
A&V認證信息包括公司註冊名稱、地址，申請人姓名、所在部門和職位，並同時需要出具相應的工商部門頒發的營業執照等。提供商業信息的企業，必須首先通過這個認證。
阿里巴巴活動記錄是指某一網商在經營過程中的信用表現，及其與阿里巴巴共同參與誠信體