楊漣只休息了一天，服了幾帖葯，自己覺得精神體力都恢複了，第二天就取消了告假，回到朝班去。
他的心中有一股勃發之氣在支持著他，使他的生命力變得超乎常人的健旺，很輕易的戰勝了病魔；而緊接著，喜事也來了——他的官職升遷為兵科都給事中。
這是擁立新君的「功臣」中第一個陞官的，他連連謙稱不敢當，再三推辭，但畢竟詔命已出，哪有因他的謙辭就收回的呢？三辭之後，他便改成了叩首謝恩，莊嚴肅穆的接受了新職。
左光斗第一個來向他道賀，寒暄、致了賀意之後，左光斗立刻語重心長的向他說出內心深處的期盼：「年兄這番高升，是開了一個大好的頭；接下來，新朝新政，還將陸續有一番人事上的變動——時機大好，我輩東林中人，好好的掌握住這波變動的機會，則又將有一番大作為了！」
楊漣對這話極有同感，立刻回應——他先是謙稱了一句：「愚弟其實是『拋磚引玉』啊！」
接著立刻暢言：「自葉閣老去職，東林之人久難左右政局，現在，果然有機會了！」
方從哲的無能早已令人不滿，雖然在這次的擁立新主的事情上一反鄉愿常態的出了許多力，但是，「形勢比人強」，新君登極後展開新政，勢必要撤換內閣首輔了。
繼位者如系東林中人，甚或葉向高重新入閣，那麼，「東林執政」的時代將要到來了；而能影響內閣首輔的人選的，目前，居第一份量的人就是楊漣！
楊漣雖因年輕、資歷不足，自己還未達入閣的資格，但以「紅丸」、「移宮」兩案之後，聲名大噪，天下皆知，成為朝中名臣——左光斗猶且分析：「先帝曾特召年兄進宮面聖，是有『顧命』之實，於今上又為擁立第一功臣——如今，年兄在萬歲爺跟前說話的份量早已經超過了內閣首輔——」
他甚至斷言，楊漣這次的升遷，只是「先期」之舉，接下來，勢必還會有「連升三級」的情形；而楊漣在朝中的份量越重，對東林就越有利！
美好的希望，光明的遠景，都已經來到眼前了！
於是，兩人索性仔細的計畫了起來，逐一的細數「應該」出任要職的東林人士：葉向高、鄒元標、趙南星、高攀龍——也開始遙想著，當這些正人君子們執掌大權之後，將如何的推動著政治改革，使已處在衰敗狀態的大明王朝得到新生——
而在內閣首輔的人事發生異動前，遼東的人事有如首當其衝般的率先發生了異動，而且目標集中——異動的其實只有一個人，那就是熊廷弼。
熊廷弼原本與東林有隙，雙方的恩怨早在萬曆三十九年就結下了。
那年，熊廷弼任南直隸提學御史；江南向為文風鼎盛之地，文士最受禮遇，但也因地方過度重視文士而形成強悍的士風，受學的生員成為天之驕子，常以些微小事群起抗爭，或包圍官府，或焚燒縉紳房屋，不時有案例呈報朝廷；熊廷弼在上任之前，已對這種惡風有所耳聞，苦思改善之道，上任之後，採取他在遼東任官時的一貫的雷厲風行的方式壓制江南文士，雖然減少了生員抗爭的事情，卻導致了多人的怨恨。
接著，他大力改革江南教育變遷的種種流弊，結果是結下了更多的仇怨。
原來，依制，提學官三年一任，任內要舉行兩種考試，一種是歲考，另一種是科考；歲考以六等試諸生優劣，科考亦按成績的優劣分為六等，第一、二等受賞，取得參加鄉試的資格，稱為科舉生員，置於末等者，則喪失參加鄉試的資格，無疑與功名絕緣了；因此，全國的讀書人既因前途操在「考試成績」中，讀書的目的也就是為了考試，所讀的書竟全系應試的八股範文；心懷理想的熊廷弼當然不認同這種世俗流弊，大力改革，以矯文風，每試必要求士子書寫經論四篇，未交者不予列入一、二等；這麼一來，又斷送了許多人的前途。
而且，他為矯弊，打擊地方惡勢力，在任上大力提拔寒微之士，黜退鄉紳津要子弟，尤其以東林子弟為多。
在他看來，東林子弟大都是仰仗父兄的庇蔭，嬌生慣養，沽名釣譽，而不潛心用功讀書，甚至不受教、不虛心處世——他必須裁抑。
歲試的時候，他索性將東林領袖顧憲成的長子顧與渟置於末等，使顧與渟絕了科舉之路。——這無異於公然向顧憲成挑戰，後果也就可想而知的了。
而今，東林得勢了——
無須東林諸人暗示什麼，朝廷中自然有人搶先一步出面彈劾熊廷弼，更何況，不贊成熊廷弼的遼東政策的，也確實大有人在。
先是與熊廷弼有夙怨的吏科給事中姚宗文一面在朝中毀謗，一面上疏彈劾，批評他只堅守不出擊、進攻、收復失土的政策是「養敵」。
接著，兵部主事劉國縉因為原來主張募遼人為兵，募得一萬七千多人，不久卻逃亡過半而被熊廷弼奏報朝廷，也銜怨在心，開始報復；他本為姚宗文的座師，兩人結合在一起，攻擊熊廷弼的力量越發的大了。
而後，御史顧慥跟著彈劾熊廷弼出關踰年，毫無建樹；馮三元則彈劾熊廷弼無謀者八，欺君者三，如不罷廢，遼必不保；接著，張修德再彈劾他破壞遼陽；給事中魏應嘉也跟進——熊廷弼先是抗疏自辯，但是，不利於他的彈劾，一而再，再而三的涌到，他無力招架了，只得上疏自求罷斥，並且繳還尚方寶劍。
於是，朝廷改以袁應泰出任遼東經略。
而一聽到這個消息，皇太極脫口就衝出一句話來：「父汗真是料事如神——」
他向代善說：「什麼事，都逃不出父汗的掌握，別說是眼前看得見的、聽得見的，父汗都一清二楚，就連遠在明朝的事，父汗都能早個許多日子就料准了——」
他心生崇敬，於是滔滔不絕的說了一大段話；而才因不久前發生的一樁變故，導致心中不自在的代善聽了，並不接腔，而是淡淡的一笑帶了過去；讓原本神情中帶著光芒，語氣中帶著興奮的皇太極只好慢慢的收斂起興頭，換個話題來說了。
而這僅是表面上的情景，兩人內心中的聲音根本是另外一種——
代善的心裡先是冷冷一哼：「父汗料事如神，明察秋毫——你這不是指著和尚罵禿嗎？」
他才因努爾哈赤的「料事如神，明察秋毫」的超能力所發現的細微之事而獲罪——那一天，努爾哈赤突然發出一個命令，說，大福晉富察·袞代竊藏金帛，勒令離棄。命令上只有這一樁事，而且絲毫沒有提起他來，但是，他心裡有數，又深恐努爾哈赤過些時日便將懲處他，因而寢食不安了許久，好長的一段日子都不敢設想自己的生死，每夜都在惶恐中憂懼，不知道天亮以後，努爾哈赤會不會斷然下令處死自己。
那段日子裡，他不斷的想起自己的同母長兄褚英來，褚英死因成謎，人都道是為努爾哈赤親自下令處死，而那時母親已經亡故，他與身邊的每一個人、乃至每一個兄弟姐妹都不敢開口問句為什麼——
許多天過去後，他才開始稍稍放下心來——離棄了富察·袞代之後，努爾哈赤似乎有意要儘速淡化這件事似的，再也不曾開口說出過任何一個字，見到他時，眼光和態度也一如往常，彷佛什麼事也不曾發生過；他暗叫一聲險，項上的人頭總算保住了。
又過了許多天之後，他才敢偷偷的派出心腹手下去打聽事情的全部真相。
回報的消息卻只限於表面：
早在三月間，努爾哈赤的庶妃德因澤就曾偷偷的檢舉富察·袞代的行為說：「大福晉兩次備佳肴送給大貝勒，大貝勒受而食之。一次備佳肴送給四貝勒，四貝勒受而未食。大福晉曾一天兩、三次派人去大貝勒處，大約商議要事——大福晉且曾有兩、三次深夜出宮院！」
而努爾哈赤倒也沒有立刻採信，他派出扈爾漢、額爾德尼、雅遜和莽阿圖四名大臣詳細調查；調查的報告為何，只有努爾哈赤本人和這四名大臣知道；而努爾哈赤在聽完報告後，沒有作出任何的表示。
但是，不久，新的告發又進入了努爾哈赤的耳中：「諸貝勒、王公大臣集會商議國事時，大福晉飾金佩珠、錦緞妝扮，藉口有事而來，竟公然傾視大貝勒——」
這次，努爾哈赤才作出了處置——
一份簡單的說明，卻聽得代善混身直冒冷汗，一面仔細的尋思：「我對德因澤庶妃，一向客客氣氣的，從來沒有過不愉快的事，她怎麼會在父汗面前中傷我呢？即便她妒忌袞代，也無須牽連上我呀！更何況，妒忌袞代並無必要，袞代早已失寵，目前最受父汗寵愛的是阿巴亥，論妒忌，該去中傷阿巴亥才是啊！」
而他的心腹手下卻似為他解疑似的提醒他：「會不會是有人指使庶妃，讓她在大汗面前搬弄口舌？」
接著又一路的推論下去：「這個指使人，也許真正要對付的人是大貝勒您——目下，大汗年事已高，心中正在思謀傳位人選；大貝勒您現為諸貝勒之長，又向以『寬厚』得人心，是最有希望的繼位人選，因而成為這人的眼中釘！」