果然，徐海不久就率大隈、薩摩西島的真倭萬餘人分掠瓜洲、上海、慈溪等地，並集兵猛攻乍浦。
胡宗憲在塘棲立營，與巡撫阮鶚，互為犄角。懾於倭勢，他們也出迎擊敵。
阮鄂手下游擊將軍宗禮敢戰，率兵進攻徐海部倭寇，三戰三捷，可最後不幸中伏而死。倭寇乘勝機，包圍了身在桐鄉的阮鄂。
胡宗憲見情勢緊急，忙抽兵回撤杭州。同時，他派指揮夏正持王滶的書信勸降徐海。徐海見王滶手書，大驚：「怎麼，老船主（王直）也要歸降嗎？」
王直在倭寇和海盜中名氣巨大，加上徐海本人在陣中受傷，他心中頗動降意。
由於不知事情深淺，他也不敢立刻答應，推託說：「我們這批人三路進擊，我一個人說了不算，還有陳東、麻葉兩位。」
夏正依胡宗憲囑咐，騙徐海說：「陳東已經和我們有密約，現在就看您的意思了。」
徐海聞此言，立刻懷疑陳東與明軍早有秘密協議。
陳東方面，也聽說有明使入徐海大營密談，吃驚不小。由此，二人嫌猜日深。
在夏正勸說下，徐海遣使向胡宗憲謝罪，但索要大筆金銀「犒軍」。胡宗憲即刻施行，派人送銀送酒送肉，這可讓徐海喜出望外。於是，他馬上釋放二百多明軍俘虜，並從桐鄉撤圍。由此，明朝巡撫阮鄂才撿得一命。
徐海解圍後，回到大本營乍浦休養。
胡宗憲派人送信，勸說徐海：「徐大人已經內附大明，吳淞江倭寇賊盛，何不擊之立功！而且，那伙賊人財物有數百船，您可以率兵掠之以為軍資。」徐海缺心眼一樣，信以為然，很快就率軍逆擊昔日的「戰友」，斬首三十餘級。
而恰恰趁他出軍時，胡宗憲遣俞大猷乘間帶兵出發，放火燒毀了他的老巢乍浦附近停靠的許多大船。
徐海心驚，忙派其子徐洪為人質，向胡宗憲「孝敬」飛魚冠、堅甲、名劍以及金寶無數。胡宗憲投桃報李，回贈徐洪更多的金寶，還讓他捎話給徐海，爭取徐海能把陳東和麻葉兩個賊頭縛送明軍。
徐海見胡大人如此「仗義」，非常感激。他很快就把麻葉抓住，五花大綁送至胡宗憲門下。
胡宗憲非常有心計，他對麻葉親解其縛，許以大官，誘使他寫信給陳東，要對方下手除掉徐海。胡宗憲得麻葉親筆信後，送與陳東，賺得對方回信，卻又派人轉送徐海。
徐海見信大怒。同時，徐海的兩個美妾翠翹、綠珠也受胡大人派人收買，日夜不停對徐海講陳東要害他。枕邊風不得了，徐海立刻派人攜重寶送給陳東的主子、薩摩島主的弟弟。倭人見利忘義，看見金寶無數大喜，立刻讓人綁了陳東送與胡宗憲。
由此，陳東、麻葉二人在明軍監室中得以相會。
陳東、麻葉被逮，吃虧最大的其實是徐海。如果他真正事實上降附了明朝，自可無憂。但他並未得到赦令和官封，此時羽翼已失，勢單力難，很是尷尬。
徐海傻不拉嘰，自忖綁獻陳東、麻葉有功，對胡宗憲無絲毫防備。於是，雙方約定日期，徐海準備正式投降。
誰料，徐海投降心急，提前一日趕至杭州，把大部隊留在城外，他自己率日本海島酋長百餘人貫甲仗劍而入。當時趙文華和阮鶚都在，聞之心驚，怕徐海以降附為名賺城殺人，急勸胡宗憲拒絕對方。
這位胡大人臨危不懼，安慰趙文華勿懼，立刻派人開帳接見徐海。其實，徐海是真降。他入帳之後，率眾賊首叩首謝罪。胡宗憲離座，親自扶起除海，表示朝廷一定會「寬大處理」，希望他日後「戴罪立功」。
胡宗憲話這樣說，心裡很為難。徐海這種在沿海殺掠多年的巨寇，朝廷一直要他項上人頭，胡宗憲本人並無給予特赦的權力。
於是，胡總督先安排徐海手下近萬名降附的倭寇住下，在沈庄紮營。沈庄有河，把莊子分為東西兩部分。徐海手下降倭居西，胡宗憲的明軍居東，隔水相望。
晚間，安排妥當，胡宗憲喚來被軟禁的陳東，讓他寫密信給住在西庄徐海營中的老部下們，稱徐海與官軍合謀，晚上要盡殺倭寇以立功。
消息傳出，倭黨大懼，乘夜向徐海營帳喊殺而來。徐海當時正摟著兩個美妾做美夢，忽然驚醒，忙令其手下衛士拚命抵拒。賊人們互相殘殺，徐海本人大腿中槊，勉強支撐。
混戰間，明軍已把倭寇團團包圍。
凌晨，見自己營盤眾倭弟兄們死傷殆盡，明軍在周遭合圍喊殺，徐海知道自己上當受騙，絕望中投水自殺。
明軍此次不費功夫，大獲全勝，連日本大隅島主的弟弟辛五郎也被活捉，只有少數殘敵奔遁舟山。胡宗憲即刻命俞大猷追擊，雪夜焚其柵壘，倭寇盡被燒死。
「兩浙倭漸平。
嘉靖帝大悅，行告廟禮，凌遲麻葉、陳東、徐洪、辛五郎等賊頭，詔命加胡宗憲右都御史，賜金幣獎賞。
說句實在話，胡宗憲計謀雖好，卻不太厚道了些。怎麼說徐海也是降附，殺降不祥，不知胡總督是否知道此說。
徐海、陳東等人解決掉，下一個目標就是倭寇大頭目王直了嘉靖三十六年（1557年），聽說「老戰友」徐海等人皆死，王直頓起兔死狐悲之感，攜手下三千多百戰倭寇乘船至寧波岑港，大掠四境，然後撤回海上觀望。
雖如此，由於先前蔣洲等人做「工作」，王直殺人不多，只是想顯示一下自己的「實力」，增加與明朝談判砝碼。
胡宗憲派人通知蔣洲，蔣洲轉告王直，說：「如果王公您降附，朝廷會委任您都督一職」。蔣洲不知胡總督這是一計，與王直歃血為盟。
老王異常激動，奮言道：「我當為朝廷肅清海波，贖家庭性命！」他先派手下賊頭毛海峰、葉碧川隨蔣洲出發，自己隨後率大部隊跟進。
但是，蔣洲幾個人到杭州後，王直遲遲不來。明朝官員紛紛稱疑，覺得王直使詐，很可能是乘間再發攻襲。於是，明廷巡按御史王本固下令把蔣洲抓入監獄，嚴審他是否通倭賣國。
蔣洲又冤又氣，辯稱：「王直肯定要投降，他違期不至，很可能因海上風大。」
蔣洲說的不錯。王直所乘大舟剛行一天，正遇海上颶風，一行人幾乎喪命。
他只得派人折回重發一船新船，故而遲來。
王直此來，又在寧港岑港靠停。浙江一帶居民聽聞倭寇船隻上百艘數千人靠泊岑港，大驚大駭，傳言紛紛。
朝廷諸臣聞之，也都私下認為胡宗憲引狼入室，必釀東南大禍。
王直遠來，忽然發現明軍在岸上不遠處盛陳軍容，森然壁壘。對此，他非常不高興，派義子王滶上岸質問胡宗憲：「我等奉詔而來，專為息兵安境，不料您胡大人嚴禁舟船出海，又擺大軍嚴加戒備，不是要哄騙我吧！」
胡宗憲心中焦急如焚，但有巡按御史王本固等人一旁伺察，他不敢行事太過，只得派人回覆王直，表示朝廷「萬分歡迎」他歸順。同時，他讓被軟禁的王直親兒子寫信給他爹，勸王直馬上上岸投誠。
王直接信苦笑，複信只幾個字：「吾兒何其愚也！汝父在，朝廷厚汝；父來，闔門死矣！」但是，事已至此，王直畢竟要和明廷談判，就要求蔣洲登船或明軍派一有身份的人來已軍中當人質。蔣洲本人來不了，他被巡按御史關在牢里，正大刑伺侯拷問著。於是，胡宗憲就派一直與倭寇打交道周旋的指揮夏正手持偽造的朝廷赦免王直的批奏去見王滶（其實他確實寫了奏疏，只是還未獲批准）。
王滶不知是假，回去興沖沖轉告王直。老王很高興，慶幸自己劫掠殺伐大半生，終於在「祖國」有正當身份了。興奮之情，無異於賴昌星回國當地委書記。
王直深信不疑之餘，把部伍安排妥當，便大大咧咧上岸，身邊僅帶數名隨從。
聚觀百姓很好奇，見老王半大老頭子氣宇軒昂，一身華麗的明服，而他身邊侍從，個個是腦袋禿幾塊的倭寇髮型（其中有華人有倭人），非常惹眼。
胡宗憲熱情得不得了，待王直以賓禮，在杭州挑一處豪宅安置老王住下，又派衛兵又派轎夫，和接待外國領導差不多。
事情發展到這個地步，胡宗憲本意確實是想朝廷赦免王直，以倭寇擊倭寇，自可肅清沿海大患。疏上，明廷的言官王國禎等人力持不可，稱王直是倭寇元兇，絕不可赦。
本來，胡宗憲還要上疏抗辯，但當他聽說朝內不少人聲稱他本人接受王直大筆賄賂，故而力爭赦免這個海盜頭子的大罪。宦海沉浮多年，胡宗憲驚出一身冷汗，忙撤回原先的疏奏，改稱王直罪大惡極，應立即正法。
王直錦衣玉食多日，在杭州大宅子翹首期待朝廷的任命。平時，他還細細研究海圖，準備隨時以「都督」身份出海殺捕「倭寇」。一日，忽聽門首喧嘩，王直以為有任職詔命，忙衣冠一新，出門迎接。豈料，來人並非老鄉胡宗憲，而是巡接御史王本固帶著許多衙役兇巴巴到來。未及開口，王直被差人們一頓亂揍打翻