【●壬申之亂】
孝德天皇有兩個年號：大化和白雉，其後的齊明和天智兩朝天皇都沒有改元。671年十月，天智天皇重病卧床，大海人皇子以出家為天皇祈禱為名，避禍南走吉野。十二月，天智天皇病歿，臨終前傳位於大友皇子，並囑咐左大臣蘇我赤兄、右大臣中臣金，以及御史大夫蘇我果安、巨勢人和紀大人共同輔佐大友皇子。
當時大海人皇子還在吉野山中流浪，身邊只有二十餘名舍人、十餘名女官，以及妻子菟野皇女和菟野之子草壁、忍壁而已，如果大友皇子及時派兵追殺，甚至只要派出幾名刺客，就能取了大海人皇子的項上人頭。然而大友皇子懾於叔父的威名，不敢遽發追兵，只是徵募兵馬，鞏固城防，防止大海人皇子回京來奪取天皇之位。
大海人皇子在吉野的群山中逃亡了整整六個月，看到朝廷並無值得擔心的舉措，這才定下神來，遣人回歸自己在美濃的領地召集部屬，準備發難。而以高市皇子為首的許多皇族和地方氏族也都紛紛來投，迅速膨脹到數萬大軍。天智天皇晚年向守舊派低頭，使得許多中小氏族大為不滿，他們無不寄希望於大海人皇子，希望他掌權以後，可以掃除天智朝的弊端，繼續推進改革，清除壓在自己頭上的傳統大氏族勢力。
一個社會越有流動性，就越有蓬勃朝氣，奴隸制等級太過森嚴了，同為統治階級，大族不亡，小族根本沒有冒頭的日子，封建社會同樣等級森嚴，但統治階級內部的升降變動卻有所鬆動，這就給了很多冒險家以可趁之機。至於百姓們，也大多希望可以徹底擺脫部民即奴隸的命運，農奴或佃農活的也很慘，然而總有渺茫的機會積聚財富，人身安全也較有保障。兩害相權取其輕，百姓們也紛紛傾向於改革派的大海人皇子。
大海人皇子聚攏東方各國軍隊，進至美濃的重要關口不破關，大友皇子發兵前來迎戰。戰役首先在關原爆發（請記住這一戰略要地，近千年後，又有一場決定全日本命運的戰役在此地展開），東軍旗開得勝，然後分兵兩路，一路直接西進，一路南下伊勢、大和後再北征，打算合圍位於近江國的京城。大友皇子雖非失道，卻極寡助，接戰後節節敗退。最終雙方在京城附近的瀨田川展開決戰，只見到處都是打著紅旗、圍著紅袖標的大海人側的軍隊，鼓聲震天，矢下如雨，大友側軍隊很快就被擊潰了。大友皇子自縊而死，五位顧命重臣自裁其一，旋即被處死一人、流放二人、赦免一人。大海人皇子得意洋洋地進入已經變成一片殘垣瓦礫的京城。
大海人皇子下令在大和營建新的都城和宮殿，是為飛鳥凈御原宮。次年（673年）二月，他正式登基，史稱天武天皇，立菟野皇女為皇后。大友皇子因為戰敗自殺，被廢除了天皇名號，直到一千兩百餘年後的明治時期，才追謚其為弘文天皇。
估計在天武天皇時代，倭國在對外交往的時候，開始正式稱自己為「日本」。《舊唐書》中說：「日本國者，倭國之別種也。以其國在日邊，故以日本為名。或曰：倭國自惡其名不雅，改為日本。或云：日本舊小國，並倭國之地。其人入朝者，多自矜大，不以實對，故中國疑焉。」《新唐書》將此事記載於「咸亨元年，（倭國）遣使賀平高麗」之後，唐高宗咸亨元年是公元679年，也即天智天皇去世的前一年。
天武天皇在位十三年，鞏固並推進了大化改新的成果，他首先重新設定中央貴族和地方豪族的氏姓等級，分為八種，即：真人、朝臣、宿禰、忌寸、道師、臣、連和稻置八種，同時下詔，廢除天智天皇時代所恢複的氏上私有部民制度，並將賜予諸王、諸臣和寺院的「山澤島浦、林野池湖」全部收歸國有。為了加強天皇集權，天武天皇甚至多年不任命大臣，別說太政大臣了，連左大臣、右大臣和內大臣也全不任命，地方國司等官員也大都委以中下等氏姓。
天武天皇十年（681年，以天智天皇去世的次年也即天武天皇正式登基的前一年為元年）二月，開始編纂《飛鳥凈御原律令》，這是日本歷史上第二部成文法典。同月，立草壁皇子為東宮。
草壁皇子是菟野皇后之子，不僅能力平平，並且體弱多病。其實貴族們所仰望的皇子是大津皇子，其母大田皇女是菟野皇后的姐姐，兩人並為天智天皇的同母姐妹，也就是說，是天武天皇的異母姐妹。然而菟野皇后當年帶著兒子跟隨丈夫在吉野山中流浪，同甘共苦，最為得寵，得以受封皇后，草壁皇子當然也就子以母貴了。
做事果斷的天武天皇在繼承人問題上卻猶豫不決，就在封草壁皇子為東宮的兩年後，他又允許大津皇子參與朝政，無疑掀起了新的類似大海人和大友之間的派系鬥爭。不過好在草壁皇子有個心狠手辣的母親，朱鳥元年（686年七月二十日新設年號）九月，天武天皇駕崩，屍骨未寒，菟野皇后就臨朝稱制，然後誣陷大津皇子謀反，將其及其同黨30餘人悉數逮捕。十月，大津皇子被迫自殺，寫下辭世詩一首：「金鳥臨西舍，鼓聲催短命，泉路無賓主，此夕離家行。」
【●《大寶律令》的頒布】
天武天皇的靈柩一直停了兩年零三個月，直到菟野皇后利用種種手段把朝臣都掌控到自己手裡了，才於688年十一月正式安葬其夫。皇后費盡心機，清除了草壁皇子登基的種種障礙，才剛鬆了一口氣，可惜草壁皇子身體太差，還沒來得及戴上至尊之冠，就在次年四月嗚呼哀哉了。草壁皇子的兒子輕皇子時年七歲，不堪繼承大統，菟野皇后沒有辦法，只好於690年四月自己坐上了天皇寶座——為她的親孫子先佔著地方。
菟野皇后就是持統女帝，她在位期間，重用高市皇子和丹比真人島，繼續丈夫未竟的改革事業，689年頒布了22卷的《飛鳥凈御原令》。她還頗有文化，善吟漢詩，京都附近因此產生了模仿唐風、以佛教為主要內容的「白鳳文化」。
697年二月，立十五歲的輕皇子為東宮，當年八月，持統女帝讓位給輕皇子，就是文武天皇。文武天皇五年（701年）三月，定年號為「大寶」，年號制度從此確定下來。當年就是大寶元年，八月份完成了《大寶律令》的編纂，次年十月分發諸國，全面實施。
《大寶律令》是日本律令製法典的重要代表之一，它分為律6卷和令11卷，律大致相當於刑法，令則是民、訴訟、行政諸法的統合，其基礎為唐律，結合日本實際情況作了修訂和增補。這份律令的領導編纂者是刑部親王，但主要動手的則是藤原不比等、粟田真人、下毛野古麻呂等十八人，大多是遣唐使或大陸移民的後裔。
藤原不比等是中臣鐮足之子，可以說是龐大的藤原家族的開山始祖。不比等年僅十歲，老爹鐮足就去世了，可以說少年失怙，藤原家族交到他手上的時候，不過只有煊赫的名聲而已。但他自小勤奮好學，加上天武、持統二帝感念中臣鐮足之功，對其關懷有加，689年，任其為判事職，使其正式開始了輝煌的政治生涯。
草壁皇子也和藤原不比等交好，臨終前授以佩刀，要他竭誠輔佐自己的兒子輕皇子，也就是後來的文武天皇。在文武朝，不比等升任正三位大納言，其後又升任第二位右大臣，接近了人臣的頂峰。
日本中世官制在《大寶律令》中成型，中央官模仿唐朝的三省六部制，設置二官八省一台和五衛府。二官為主管祭祀的神祗官及最高行政機關太政官，太政主官為太政大臣，輔官為左、右和內大臣，其下還有大、中、少三級納言等官，統轄中務、式部、治部、民部、刑部、大藏、宮內八省；一台為司監察的彈正台；五衛府指警衛宮廷的衛門府、左右衛士府和左右兵衛府。最初正一位太政大臣僅授予皇族，並且經常由東宮兼任，總攝朝政，作為人臣，最高是左大臣，其次為右大臣，都為正二位——相當於我國的正二品官銜。
因為日本的官員品級也模仿中國，設一到九位，每位分正、從兩級（九位則分大初位和小初位），三位以下各級還分上、下（中國的九品制，是五品以下分上、下）。四位以上（含）官員可以參加朝議，稱殿上人，四位以下則稱殿下人。
《大寶律令》再度確定班田制，為了便於實施，也模仿唐朝建立戶籍制度。不過唐朝一戶平均為四到五人，是真正意義上的家庭，而日本的戶也稱為「鄉戶」，平均在二十人上下，不僅數輩同居，甚至引入相當多不具有血緣關係的成員，好象一個個小的「氏」或者「部」，這也是奴隸制殘餘仍廣泛存在的重要證據。
《大寶律令》還規定了全國的軍事機構，中央設五衛府，地方上由各國國司掌控數個軍團，此外在九州設太宰府管轄下的防人司，以防外國入侵，陸奧設鎮守府，防備蝦夷——所謂蝦夷，一說即指阿伊努人，是東北部地區的土著居民，另說是開化較晚的大和族的一個分支。
《大寶律令》規定了新的身份制度，全部日本人都被劃分為良民和賤民兩個等級。所謂良民，也稱公民，包括皇族、貴族和廣大自由平民，也包括半自由的農奴；而賤民則指改新以後仍未被解放