七月，燕京接連下了幾場罕見的暴雨，流經京城的高梁河、永定河等幾條河流水位暴漲，直接影響到京城百姓的生命安全，張文謙、郭守敬等人帶領五萬民工日夜奮戰和堅守在防汛工地，真金更是每日前往工地視察，絲毫不敢鬆懈。
適逢帝師八思巴還京，為京城百姓計，八思巴在京城外的法源寺舉行了一場盛大的法事，冒雨參加誦經的僧侶和信眾達數萬之眾。當日，暴雨驟停，天空中飄起小雨。
次日，雨過天晴。忽必烈詢問天災徵候，八思巴推算後回答：恐雲南局勢有變。忽必烈忙遣使往雲南打探消息。近一段時間，他未接到來自雲南的任何訊息，心裡也有些疑惑。使者離去又轉回，帶回了一個手持金批令牌、風塵僕僕的女子。
女子正是清風。
忽必烈直到這時才知曉雲南境內發生的變故。忽哥赤性本仁柔，赴雲南伊始便處處受到都元帥寶合丁的牽制，忽哥赤不願與寶合丁發生衝突，故百般忍讓。忽哥赤的委屈，清風絲毫不知曉，因為忽哥赤從不對她講一切不愉快的事情。
平素，清風足不出戶，只是在王府相夫教子。九公主出嫁後，清風發現自己又身懷有孕，心中更加想念親人，遂派可靠的家將將兩歲的兒子確吉送回燕京，也好讓他見見從未見過面的祖汗和外祖父。
忽哥赤的過分善良助長了寶合丁的野心。寶合丁深知，雲南山高地遠，在這裡建立自己的獨立王國不成問題。他首先利用美色拉攏和控制了六部尚書闊闊帶，繼而又與一些心懷異志的部落首領達成秘密協議，約定待他取得對雲南的絕對統治權後，他將允許這些部落首領繼續擁有昔日權勢，不稱臣，不納貢，依然各自為政。
一切安排妥當，寶合丁在元帥府擺下宴席，派人去請忽哥赤。
這天，王府的後花園剛剛建成，忽哥赤正與清風游賞「望卿山」和「清風亭」，兩人還商議就在「清風亭」吃晚飯，聽說寶合丁有請，忽哥赤雖不想去，但考慮到寶合丁難得這樣殷勤，如果拒絕，寶合丁一定覺得面上無光，因此勉強答應赴宴。
臨別，忽哥赤囑咐清風先睡，他一定早去早回。
清風卻睡不著，她一直在府中走來走去，等候丈夫歸來。不知為什麼，她總有種不祥的預感。
天色越來越晚，清風走出王府，在門口徘徊。突然，黑暗中出現了一個身影，借著門頂燈籠微弱的光線，清風認出了來人正是跟忽哥赤一起到元帥府赴宴的侍衛。
侍衛顧不得施禮，一把將清風推回府中。「王妃，出事了！」他聲音急促沙啞地說道。
「王爺呢？」清風一陣眩暈。
「王爺他……」侍衛的聲音哽了一下，又匆忙地接下去說道，「寶合丁和闊闊帶早有圖謀，他們給王爺的酒里下了毒。我去接王爺時，看見元帥府的人架著王爺正往客房走，他們告訴我說王爺醉了，他們要扶王爺回客房休息。我不放心，就跟著他們走。幸虧王爺這時神志還清醒，當我服侍王爺躺下時，他乘人不注意，將我的手指伸進他的嘴裡，他嘴裡的肉已經全都爛了，我頓時明白了一切。可當時我只能裝作一無所知的樣子，借口去給王爺備轎，好帶王爺回府，這才逃出了元帥府。王妃，寶合丁和闊闊帶他們不會善罷甘休的，他們一定會來清洗王府，殺光所有的人。我們的人太少，不是他們的對手，您一定要快逃，回燕京，向大汗求調大軍，為王爺報仇！」
侍衛的話音未落，就聽到府外人叫馬嘶，刀槍並舉。侍衛帶著家將拚死抵著府門，只為清風多爭取一些時間。侍女保護著清風從後花園向後山逃去。寶合丁人多勢眾，很快追至後山。為了小姐，侍女奮不顧身引開了追兵，清風才得以逃入深山之中，暫時躲開了寶合丁的追殺。
寶合丁派人圍山不撤，清風在山中躲了整整十天。山中缺衣少食，丈夫含冤而死，這一切都讓清風苦不堪言。悲憤的心境中，她流產了。當她昏迷不醒之時，幸好一位上山採藥的苗醫發現並救了她。正直的苗醫了解到清風的處境後，冒著生命危險將清風送出雲南邊境……
忽必烈被兒子的慘死激怒了，他更後悔自己所託非人，害了兒子。他當即調遣大軍赴雲南平叛，哮喘病已經十分嚴重的兀良合台堅決要求執掌帥印。這位蒙古名將，多少年轉戰雲南境內，對雲南的每座大山、每條河流都瞭若指掌，這一次，他要再披戰袍，激濁揚清，為女婿報仇。
清風也隨大軍出發。真金擔心清風的身體吃不消，勸她留下來，清風拒絕了他的好意。她對真金說：「在雲南，有忽哥赤為我修建的『望卿山』和『清風亭』，忽哥赤曾對我說，『望卿山』是他，『清風亭』是我，『望卿山』與『清風亭』相伴，永不分離。如今，忽哥赤已與雲南的山山水水融為一體，他留在那片土地，而我，喜歡呼吸著那裡的空氣，感覺他的存在。無論如何，我一定要為忽哥赤、為王府所有死去的人報仇。過去是我錯了，我做著雲南王的王妃卻從來沒有將雲南當成我的家，可是，那裡的百姓卻無私地幫助了我。以後，我所能回報他們的，就是與他們同呼吸共命運，就是和他們一道，將雲南建成美麗祥和的地方。燕王，請你和闊闊真嫂子幫我照顧好確吉，等到雲南平定之後，我再回來接他。」
真金了解了清風的心愿，便不再相勸。
大軍翌日出發，迅速向雲南方向開進。寶合丁萬萬沒想到自己有備而戰，卻還是難抵兀良合台兵鋒，最終落了個兵敗被擒的結果。闊闊帶原本是受寶合丁脅迫，寶合丁既敗，他明知自己犯下不赦之罪，悔之莫及，留下一封懺悔書，在尚書府服毒自盡。
忽哥赤的屍體被寶合丁的手下乘夜丟於元帥府後的山澗之中，已不知被激流衝到哪裡。清風只能在山澗旁命人剖出寶合丁的心臟，血祭她的丈夫和所有罹難的王府人員。
兀良合台暫時留下來，等待忽必烈汗委任新的雲南王及官員到任，此前，他必須坐鎮王府，以儘快恢複雲南境內的秩序。
十一月初，雲南全境平定的消息傳來，落落公主在燕京戒台寺削髮出家，法號「妙嚴」。死者已矣，生者又遠離凡塵，忽必烈驀覺自己同時失去了一雙兒女。