在孔廟和國子監里，有西周石鼓、進士題名碑和十三經刻石三大石刻。
石鼓石鼓是西周宣王（一說為秦）文物，共10個，每個重約一噸，被譽為中國「石刻之祖」。唐出土於陝西鳳翔。北宋運汴京（今開封）。金陷汴京，運到燕京（今北京）。金亡元興，列在孔廟大成門內左右。（《欽定國子監志》卷六十一）明清依然。抗戰前夕，文物南遷，石鼓隨行。八年抗戰勝利，石鼓回到北京，現藏故宮博物院。現存大成門外石鼓，是乾隆朝複製品。還有清書法家張照書韓愈《石鼓歌》等石碑兩通。
進士題名碑明清科舉每三年舉行一次會試。明從永樂十三年（1415年）乙未科開始在北京舉行會試、殿試，到崇禎十六年（1643年）癸未科，共有77科，22649人在北京成為進士。清代共舉行會試、殿試114科，有26840人在北京成為進士。光緒九年（1883年），應會試考生16000餘人。會試考生年齡最小者16歲，最大者103歲。
北京元明清金榜題名者的姓名刻在石碑上，立於孔廟，這就是進士題名碑。明代則常將元代進士題名碑上的文字磨去，刻上當時進士的姓名，所以元代進士題名碑保存較少。孔廟內今存元明清進士題名碑198通，其中元碑3通，明碑77通，清碑118通，上面記載51624名進士的姓名、籍貫和名次，是一份珍貴的文化遺產。
蔣衡寫經蔣衡（1672—1743年），江蘇金壇人，初名衡，改名振生，字拙存，號湘帆。祖、父皆精書法，幼承家學，自小臨摹，尤工行楷，苦練有成。非歷磨鍊，難以大成。蔣衡科試不第，轉意遊學，浪跡江湖，尋師訪友，切磋書藝，足跡半海內。史書記載：「先生好遠遊，既不遇，遂東詣曲阜、謁孔林，至會稽，涉西江，歷嵩少，導荊楚，登黃鶴磯，過大庾嶺，升白鶴峰，訪東坡故宅，抵瓊海，觀扶桑日出，登雁門山，歷井陘，逾龍門，為終南嶽之游，浴驪山溫泉，登慈恩寺雁塔，縱觀碑洞金石遺刻，所至以筆墨自隨，賦詩作畫，或歌哭相雜，至不能自止。」（《國朝耆獻類征·蔣衡傳》初編，卷四百三十三）。
他在長安觀摩碑林時，痛覺唐代《開成石經》出於眾手，雜亂不齊，於是發願重寫「十三經」中國有刻石經的傳統，重要的有七次：第一次是《熹平石經》，東漢，收入七經，刻於46塊石碑上，20餘萬字。蔡邕以當時通行的隸書寫，「及碑始立，其觀視及摹寫者，乘日千餘輛，填塞街陌」。第二次是《正始石經》，三國魏正始年間（240—249年）刻成。第三次是《開成石經》，唐大和七年（833年）至開成二年（837年）立。五代雕版印刷第一部監本《九經》以此為底本，今存於西安碑林。第四次是《廣政石經》，後蜀廣政七年（944年）於成都開始鐫刻，後相延，直到宋，歷時百年，有千餘石。第五次是北宋《嘉祐石經》，今杭州尚存44枚殘石。有殘拓本流傳。第六次是南宋《紹興石經》，今杭州尚存44枚殘石。第七次是清朝《乾隆石經》，即蔣衡書寫的「十三經刻石」，存國子監。——《周易》《尚書》《毛詩》《周禮》《禮記》《儀禮》《春秋左傳》《春秋公羊傳》《春秋榖梁傳》《論語》《孟子》《孝經》和《爾雅》。決心下定，矢志不移。雍正四年（1726年）授英山教諭，自稱才疏，力辭不赴。他書成一半時，上司又催促就職，他仍以老病為由，上書求免，並抱病親到官衙求情，終於獲准。他在揚州瓊花觀即番釐（fān xī）觀（今揚州市文昌中路360號）專心寫經。當年瓊花觀內，亭台樓榭，軒坊花石，幾焚幾建，遺韻猶存。今揚州以瓊花為市花。蔣衡在揚州瓊花觀，青燈相伴，中正靈靜，握管不輟，篤志寫經。自雍正四年（1726年）至乾隆二年（1737年），「鍵戶十二年，寫十三經」（《清史稿·蔣衡傳》，卷五百三），62萬餘字，書寫工整，前無古人。乾隆中，進上，後乾隆帝命刻石國學，授衡國子監學正，終不出。大成垂名，常在身後。蔣衡所書「十三經」，身後五十年，乾隆帝命將蔣衡所書的「十三經」刻石，貞珉工竣，御制序文，立於太學，以垂萬世。
蔣衡書寫「十三經」的成功，得到三位貴人相助：
第一位是揚州富商馬日管。馬氏出資兩千金，將蔣衡手書「十三經」裝裱成三百冊，五十函冊。（《清史列傳》，卷七十一）這才有可能進獻給乾隆帝。
第二位是江南河道總督高斌。乾隆五年（1740年），高斌將蔣衡手書裝裱成冊的「十三經」正文，進呈乾隆帝。收藏在大內懋勤殿。《蔣衡書十三經墨跡》（七箱），三百冊，五十函，現藏台北故宮博物院。經該院林天人研究員測量示知：《蔣衡書十三經墨跡》本葉寬19厘米，高33厘米。另有拓本兩套，葉寬14.5厘米，高28厘米。清賞給蔣衡國子監學正（正八品）職銜，但終未出山。
第三位是乾隆帝。蔣衡手寫「十三經」進呈後，乾隆帝先要將其雕版印刷，但受阻未果。乾隆五十六年（1791年），命以蔣衡手書「十三經」為底本，刻石太學，定名「乾隆石經」。乾隆五十九年（1794年），石碑刻成，立於國子監東西六堂。全部石碑189通，加上告成表文「諭旨」碑1通，共190通，現藏於北京孔廟和國子監博物館。
蔣衡手書、乾隆刻石的「十三經刻石」即「乾隆石經」，其規模之宏大，楷法之工整，筆力之雄健，毅力之堅韌，學志之專一，價值之珍貴，國內僅有，世界無雙，從而成為中國，也成為世界文化藝術寶庫中的稀世珍品。1956年，將石經移至孔廟與國子監之間的夾道內專存。1981年在夾道上加蓋屋頂。2011年重修，遮擋風雨，恆溫恆濕，妥為保護。這是中國現存最完整的十三經刻石。
此外，今揚州大明寺東牆外「淮東第一觀」五個大字，為蔣衡手書。蔣衡死後葬於揚州大明寺外斜坡下，有《蔣衡書十三經墨跡》《拙存堂詩文集》《拙存堂臨古帖》《書法論》等傳世。
疾風知勁草，秋霜見柿紅。以李時勉、徐元夢、王懿榮、蔣衡等為代表的明清正氣士人，明志篤學，堅韌挺拔，功成而敗，敗而再成，學績卓越，風節高亮，一代楷模，後人景仰。