紹興二十五年（1155年），宋高宗在秦府轉了一圈，聞聽秦檜去世，不由得長出了一口氣，對楊沂中曰：「朕免得膝褲帶匕首」（《南宋雜事詩注》）。宋高宗與秦檜這兩位聯袂主演議和大劇的君臣，表面上和諧，實則暗流涌動。金國因把南宋宰相任免權寫進了合約里，所以秦檜「挾虜勢以要君」，對宋高宗多有威脅，君臣兩人形成了相互威懾、相互牽制、相互利用的關係。
政客之間的結盟是為了共同的利益目標，這裡面沒有絲毫的信任可言。宋高宗褲子里揣著匕首，一直提防秦檜，可見對秦檜多麼不信任。秦檜有了強硬的後台，在南宋官場中可以用「為所欲為」來形容，貪污斂財、結黨營私、打擊政敵、殘害忠良等，可以毫不誇張地說就差廢皇帝了。大領導與「二把手」之間的關係何以發展到了白熱化？沒有無緣無故的恨與愛，矛盾當然是一點一點積少成多。
朱熹在《戊午讜議序》中提到秦檜「開門受賄，富敵於國，外國珍寶，死猶及門」。在別的官員那裡貪污斂財還得藏著掖著點兒，秦檜不需要廢話，公開斂財。《建炎以來系年要錄》記載：「監司、帥守到闕，例要珍寶，必數萬頃乃得差遣」、「臘月生日，州縣獻香送物為壽，歲數十萬」，達到了富可敵國的地步，秦檜的家產甚至遠遠超過了宋高宗。導致朝廷財政危機，國庫一點剩餘都沒有。秦檜還覺得不過癮，下令增稅，結果一定是「民力重困，飢死者眾」。錢多得花不完，搞得養子秦很是頭疼，每天無所事事，終日以融化金銀、打造酒器為樂（《宋稗類鈔》）。財富的來源在於秦檜權傾朝野，這個「二把手」絕對不簡單。秦檜弄死岳飛後，有了矯詔（假託或假傳皇帝詔書，或者篡改皇帝的詔令）的司法權力，《宋史·刑法志》載：「飛與舜陟死，檜權愈熾，屢興大獄以中異己者。名曰詔獄，實非詔旨也。其後所謂詔獄，紛紛類此，故不備錄雲。」
有了國家機器，想要整誰，往裡一扔萬事大吉。權勢之盛，到了加九錫（九錫是九種禮器，是天子賜給諸侯、大臣有殊勛者的九種器用之物，是最高禮遇的表示）的地步，已然威脅到了皇位。誠然，皇帝對他不信任，秦檜對屬下也不信任，大家逢場作戲罷了，為了共同利益暫時結盟，沒幾個真心交朋友的。
秦檜為人陰險機警，遇到政客攻擊，並不與之鬥嘴，沉默一陣後在關鍵地方說出關鍵的幾個字，足以置人死地。只要看見他嚼齒動腮，像馬吃草似的，就證明他要殺人了（《三朝北盟會編》）。當時江蘇震澤有個叫王蘋的，博學有名，特賜進士出身。他兒子時年十四歲，對天下大事已然有所了解。閑著沒事兒的時候小王在紙上寫道「可斬秦檜以謝天下」。被僕人撿到了，以此勒索。老王沒答應，僕人就把他們告了。
秦檜的耳目聞聽，捅到了太師府。誹謗朝廷大員，按罪當斬，秦檜念小王年幼無知，把他扔進了監獄，直到秦檜死後才放出來（《四朝聞見錄》）。對一個孩子尚且不放過，何況其他政敵。再如《史》記載，紹興十五年四月，宋高宗賜給秦檜一座宅邸、銀絹萬匹，並在新家賜宴。宴會上有教坊優伶演話劇，調節情緒。有一參軍前來為秦檜歌功頌德，參軍剛坐在椅子上，髮髻上的環子掉了。扮演太師的演員就問，此何環？參軍答曰，二勝環。扮演太師的演員拍拍腦袋說，你坐太師椅上，錢絹例物賞賜不斷，此「環」怎麼掉在腦後？此言一出，滿座失色，分明影射秦檜屈己求和，不顧「二聖」還朝。秦檜忿然大怒，後果極為嚴重。次日，這幾位演員到閻王爺那裡排練去了。
秦檜打擊政敵通常不擇手段，不達目的決不罷休，譬如逼死前宰相趙鼎。秦檜的人遍布朝廷，致使宋高宗對其無可奈何。屬下黨羽掛了號的主要有十個人，時人稱為「十客」：王會親客、郭知運逐客、吳益嬌客、朱希真上客、曾該食客、曹冠閑客、唐伯可狎客，還有莊客、詞客、惡客，各管一攤。發生了什麼事件，秦太師府有相應的人員去處理，保證程序不亂，形成了有組織、有分工的高效工作團隊。
當時趙鼎早已下野多年，編管在潮州。潮州地方官徐璋念前宰相趙鼎是位忠臣，就給他修了一座房子。徐璋去世後，繼任者翁子龍是秦檜的爪牙，想方設法找趙鼎碴子。誣告徐璋挪用公款十一萬為趙鼎蓋房，大理寺立案。徐璋早已去世，死無對證。趙鼎得知消息對兒子說，我若不死不知要連累多少人，遂絕食而亡。
與秦檜合作幹掉岳飛的万俟，時任御史中丞，事成後升至參知政事。好景不長，兩人翻了臉。原因在於万俟出使金國歸來，秦檜面授機宜讓他借金人口要挾宋高宗，嚇唬嚇唬領導，以此進一步鞏固求和政策。哪知万俟沒理他，秦檜怒了，很快御史中丞李文會彈劾副相万俟貪贓枉法。
万俟一看弄不過秦相公，只好要求下地方工作，一輩子也沒翻身。秦檜以貪污之名義打擊政敵屢試不爽，並且還用這招在內部團隊中走馬換將。朝中大事小情由秦檜說了算，參知政事、樞密使之類的宰執官員空缺，總這麼空著大領導會有意見，於是秦檜用自己的黨羽填充，通常期限很短，輪換非常快。如把余堯弼扶上相位，很快被巫伋狀告下野。巫伋是秦檜同鄉，在樞密院事兼參知政事做得時間稍為長一點。紹興二十二年，秦檜在辦公室問他家鄉有什麼新聞，巫伋小心謹慎不知如何對答，半晌才說聽說有個術士會算命。秦檜隨口問道，他沒算算你什麼時候能轉正嗎？巫伋滿頭大汗，知道自己在政府的日子到頭了，次日被御史彈劾下野。
秦檜在打擊政敵、人事任免、興文字獄等諸多方面將「嘴皮子」、「筆杆子」、「鐵爪子」一一落到實處，所有威脅到他的人或者他感到有潛在威脅的人一律消滅，口訣即是穩、准、狠，外加權、詭、詐，掌握這「六字訣」，不僅官位坐得穩、坐得牢，還能夠逢凶化吉，安全到家。
關於人事這塊兒，秦檜身上有個經典案例，讓兒子秦當上了狀元。料想權傾朝野的宰相扶植兒子，也就一句話的事兒，如果那樣他就不是秦檜。宋代考試比較公平嚴謹，有彌封、謄錄等技術升級，作弊有一定難度。秦檜聰明地避開了這一技術難關。秦檜把主考官叫到了家裡說有事相商，僕人說相公太忙，大人您先在書房稍等片刻。主考官就在書房等待，左等右等不見秦檜來。耐不住寂寞的主考官看到桌子上有篇文章，看了一遍，秦檜還沒來，再看一遍。從上午一直到下午，秦相公始終沒有出現。主考官看了那篇文章一小天，幾乎能背下來。
最後僕人說相公有事走了，您先回吧！考官帶著疑問回去了，以為人家相公日理萬機的，沒工夫搭理他。過些時日，科舉開始了。主考官意外發現了那篇文章，所有的疑問迎刃而解，原來秦相公在這兒等著呢！當日他在太師府看到的文章與該考生的一字不差，但凡長腦袋的都明白什麼意思。這名考生一定與秦檜有著急切、密切的關係，遂選為進士第一名，唱名秦。
秦檜為什麼要這麼做？以他的勢力其實說一句話就行，原因在於秦檜也有所顧忌，畢竟上面有個大領導在，讓人抓不到把柄才有安全感，愈是權勢熏天的人愈缺乏安全感，會想方設法地保護自己。《四朝聞見錄》記載了一則故事說明了這一問題。秦檜夫人王氏應吳皇后之邀，進宮赴宴，席間上了一種青魚，吳皇后就問王氏吃沒吃過這種魚。王氏心直口快說當然吃過，我家有好幾百條呢！個頭都比這個大，明天給你送來幾尾。妯娌之間話家常而已，沒什麼可說的，隨便聊。可是皇帝的媳婦與宰相的媳婦聊天其中必然摻雜政治因素，說不定哪句話就點燃了火藥桶。例如明代開國大將徐達傳說被賜死，原因在於徐達夫人說錯了一句話。她經常進宮跟皇后馬大腳嘮嗑，閑聊中說了一句你家房子使用面積真大啊！朱元璋聽後心想：敢情你想搬進來住呀！於是乎派人給正在生病的徐達吃了忌物河鵝，不久毒發身亡（徐禎卿著《翦勝野聞》記載，史料存疑）。
王氏回去把這件事告訴了老公，秦檜當即怒斥她口無遮攔，連忙與智囊團商量對策。吳皇后背後的人是宋高宗，秦府竟然有皇家貢品，並且數量非常之多，讓大領導怎麼看？最後秦檜拿了數十條大魚當作青魚送了過去，吳皇后見了笑著說，我道哪裡有許多青魚，原來夫人認錯了。
臨死前宋高宗去看望他，秦檜奄奄一息，說不出話來，唯有淚流滿面。宋高宗看著看著眼淚流了下來，親自拿手帕給秦相公拭淚。出了房間宋高宗長出了一口氣，秦檜終於要死了。跟出來的秦說，我接父親班當宰相怎麼樣？宋高宗臉色一沉，這事兒跟你沒關係。秦檜一死，宋高宗開始大肆清除黨羽（《三朝北盟會編》）。岳飛、韓世忠、張俊、劉光世、秦檜等文、武「二把手」當得提心弔膽，反觀「一把手」也幹得膽戰心驚。
總之一句話，都不容易！