「嘰——咚！」13日一大早，拉貝在睡夢中被一聲巨響驚醒，隨即連續不斷的同樣響聲充斥在他的耳畔。
「有沒有人傷亡？」拉貝迅速穿上衣服，走下樓梯，奔跑到一層和院子里詢問。小客廳和院子內已經擠得滿滿的，絕對不是昨晚的200人。
「應該有300來人了！」傭人告訴他。「要統計出準確數字，一一統計起來。」拉貝命令傭人。
此刻的街頭，天上亂飛的炸彈如冰雹般傾瀉而下，四周的房屋已有多處在燃燒……孩子哭，大人叫，平民們紛紛向拉貝的院內拚命地湧來。
「你告訴他們再往前面走，就是安全區了。我這兒住不了多少的，他們必須到更加安全的地方去。」拉貝擔心他的院門什麼時候被潮水般湧來的難民擠塌了。
無處可逃的一對老年夫婦拉扯著七八個看樣子是他們兒孫的人，跪在拉貝面前請求進他的院子。「進吧！只許你們這一家進，其他的請往安全區那邊走！十來分鐘就可以到了，現在日本軍隊還沒有全部進城，你們應該有個更安全的地方。快往那邊去！」拉貝的身子貼在院門上，勸說著數以百計路經他院子的難民們，儘管他知道他的勸說並不十分有效。
「形勢不可預期，我要到委員會的總部去開會。」拉貝再次命令傭人，「什麼時候都不要開門。如果有日本軍人來，你們就把這面旗幟舉起來，這就行了。」他指指鋪在院子里的那面「納粹」國旗，好像這就是護身符，並且是唯一的。
「日本軍隊已經要全面進城了，眼下最嚴重的是大量傷員的出現，我們紅十字會成立的事情不能再等了，所以今天正式宣布成立……」耶魯大學畢業的傳教士馬吉先生在13日這一天是作為國際紅十字會南京分會主席來宣布上述消息的。他進而指出，未來的南京城內，將是救濟難民最緊迫的時期，一切可能出現的危急情況都存在，期待各理事會成員能夠發揮作用。
拉貝也被選為該組織的理事會成員。馬吉告訴拉貝，前一天他運送前線的中國傷員途經首都劇院的包紮中心時，一顆日本軍隊打過來的炸彈正好落在街頭，至少11人當場死亡。「後來我們路過金陵大學附近時，在華僑路見一處房屋也被日本炮彈擊中，起碼有20人被炸死，其中有七八個人是被炸彈的氣浪拋到街上摔死的。一對可憐的老夫婦哭得死去活來，他們33歲的兒子臉上被炸了一個洞，躺在那兒已經死去了。今天早上我向總部過來的路上，則看到更多的中國軍人被打死在工事里……安全區也未必安全。許多敗下陣來的中國軍人他們拿著槍，又不知幹什麼，有的就往安全區里躲，這讓進城的日本軍隊看見後麻煩就會更大。」馬吉提醒拉貝。
「這也是我最擔心的事。」拉貝一聽這話，臉色特別陰沉，「走吧，我們去安全區看看。」他叫上助手，驅車向他所擔心的地方駛去。
大街上，呼嘯的子彈和炸彈不時在頭頂上飛過。掛有紅十字會和德國國旗的車子，左閃右避著穿梭在大街小道上。在國民政府的外交部門口，橫七豎八的傷員躺滿一地，他們都在等待設在裡面的一所軍醫院的救治。
車至上海路段，一隊日本兵用槍攔住拉貝他們的汽車。一個懂德語的日本兵知道拉貝的身份後，勉強對他的車子放行，並且告訴他，他們的軍官也會馬上進城。「馬上繞開他們，抄小道走！」拉貝一面裝著與日本兵打招呼，一面悄聲告訴助手趕緊開車走小道。
「壞了！他們怎麼還拿著槍亂晃呀？」沿途，拉貝迎面遇上了3個分隊的中國士兵。他趕忙跳下車子，要求他們馬上放下武器。「否則遇上日本兵會把你們全部消滅的！快繳械吧！」拉貝喊道。
「為什麼繳械？我們不！我們要同小日本鬼子拼殺一陣！」士兵們不幹，儘管多數人聽了拉貝的話覺得有理。
「你們必須繳械，否則你們所有人的生命都不能保證！」拉貝說。
「你們的安全區不是安全嗎？讓我們進去吧！」士兵們圍住拉貝，一個個用乞求的目光看著這位洋人。
拉貝掃了一遍這些可憐的中國軍人，直著大嗓門說：「安全區不為軍隊提供庇護，尤其是你們現在這個樣。我必須保證對平民的安全負責。」
這話不知起了什麼魔力，士兵們立即紛紛扔下武器，有的則像變戲法似的把軍裝脫下扔到旁邊的水溝或垃圾堆里，然後嚷嚷著請求拉貝放他們進安全區。
「那麼你們就往前走，到外交部和最高法院去！」拉貝只好這樣說。
「為什麼讓我們到那兒去？」士兵們不知拉貝指的兩個地方已經變成了難民區，所以一聽說到「最高法院」便緊張起來，直到拉貝解釋清楚後才放心地往前走。
在鐵道部門口，拉貝又遇上了同樣的中國軍人，有400多人。他又以同樣的方式勸說他們先放下武器。但有一名軍官不同意，認為洋人的「餿點子」有損中國軍人的形象，只見這位軍官騎在馬上，突然端起手中的卡賓槍，向四處猛烈掃射，末後說：「我們決不投降！」
拉貝覺得無奈，又無法阻攔這樣的軍人。「但，你們若要進我們的安全區，就必須繳械，否則我絕不會同意你們進去！」僵持幾分鐘後，多數士兵表示服從拉貝的建議，將手中的槍械扔在地上，然後向安全區逃去。
「後來的事實證明，是我把他們害了！」拉貝不曾想到，他苦心勸說中國士兵和軍官們繳械的結果是，讓日本兵在過後的日子裡輕而易舉地將這些赤手空拳的中國軍人們統統地抓起來，活活地槍斃了。這是後幾天里發生在南京大屠殺里的主要一幕，它十分慘烈。
「我們別無選擇！如果安全區的邊上發生巷戰，那麼逃跑的中國士兵毫無疑問會撤進安全區，這樣安全區就不是一個非軍事化的區域了。它即使不被日本人摧毀，也會遭到日本人的猛烈射擊。因此我們一直希望這些完全解除武裝的中國士兵除了被日本人當作戰俘之外，不會有其他危險。」拉貝在當天的日記里這樣解釋自己堅持這樣做的理由。
「把他的槍也給我解除了！」拉貝悄悄命令同行的哈茨先生對那位騎在馬上的軍官實施繳械行動。那個軍官開始不從，後來竟然被哈茨制服了。「希望先生能理解，我們不能因為你一個人的意志而犧牲幾百位你的士兵。」拉貝對這位不服氣的軍官說，「其實這也是保護了你！」
「去你媽的！你能保護我？」軍官很生氣地回敬拉貝。
拉貝確實無法回答和給這位軍官提供任何保證。日本人能聽他拉貝的？「但你要進我的安全區，我的話就是命令。」拉貝並不含糊。
那軍官不再固執了，和他的士兵快步向安全區內撤。
安全區各個地方都出現了前所未有的難民潮——不是數以百計、千計的概念了！是數以萬計！
如此巨大的人潮，中間夾帶著數以萬計的是敗下陣的中國軍人，這讓拉貝傷透腦筋：不讓他們進，就等於間接殺害他們——日本軍人絕對不會客氣。如果讓這些中國軍人進，等於讓日本人有了侵犯和破壞安全區的理由。
「你們應該多派些人像施佩林先生那樣守在大門口！」拉貝看著手持毛瑟槍、眼珠盯著每一位進出安全區的人的施佩林，對委員會成員們說。
「這是不可能的事，拉貝先生。」韓湘琳向拉貝建議，「應該馬上在我們的安全區門口各處貼上布告，告訴想進來的人一些規矩。」
「很對，馬上去辦。」拉貝於是立即讓秘書和助手們行動起來，這也就有了日本軍隊進入南京城後他簽發的第一份文件——《致難民收容所難民的重要通知》：
1. 緊急呼籲所有的人儘可能不要在街上逗留。
2. 在最危險的時候，建議躲在房子里或不會被看見的地方為好。
3. 我們提請注意，難民區專為難民設立。我們不得不遺憾地指出，難民區無權為中國士兵提供保護。
4. 如果日本人來難民區檢查或巡視，必須予以通行，不得向他們實施任何抵抗。
這位「南京好人」——後來南京人一直這樣稱拉貝，他期待沒有任何戰爭防範意識的市民們千萬不要輕易在日本軍隊進城時上街或到居室之外的地方「逗留」， 以防不測。
果不其然。這一天，家住評事街的孫仲芳，聽說日本人要進城了，便與幾位女伴上街看熱鬧，哪知突然聽到有人大喊「鬼子來了」！幾個人抬頭一看，四面城樓上站著的都是持槍的日本人。「叭叭」「叭叭……」子彈立即呼嘯而來。孫仲芳命大，在一片哭喊聲中，她跑回了家。22歲的她，在母親勸說下，抱起不到兩歲的兒子「小狗子」，與哥哥隨潰敗的部隊輾轉到了安徽，這期間她與哥哥及「小狗子」走散。為了生活，孫仲芳第二次嫁人，丈夫是國民黨士兵黃世清。孫的首任丈夫是南京市的警察，沒能逃出日本人的魔掌，母親也慘遭日本兵的姦汙，不久便去世了。抗戰後，孫仲芳與丈夫一起回廣西老家農村，一住就是50年。丈夫黃世清去世後，孫仲芳又嫁