日軍侵華的整個過程，特別是像無辜地戮殺中國百姓這樣的事，當時的日本軍方和政府有相當嚴格的紀律，也就是說，不經軍方和官方審查，絕對不能將在中國的所作所為——指殺人放火的事隨便講給家人和親友聽，更不能寫文章。在日本侵略者宣告投降後，日方對所有回國的將士都有最為嚴格的審查措施，在戰場上的「日記」、「筆記」等見諸文字的東西一律禁止帶回，一旦發現是要受嚴懲的。因此現在想從日方獲取這方面的第一手史料非常不易。然而，即使這樣，我們仍然還是獲得了一些零零碎碎的日本老兵們當時留下的「日記」等。戰後曾經有一段時間——包括現在，一些對戰爭有反省意識的日本老兵們，隨著年齡的不斷增長，加之越來越悔恨戰爭，陸續有人開始寫回憶文章，這使得當年日軍在中國包括南京大屠殺時的罪行有了更加真切的反映。另有一些愛好和平的反戰人士，如松岡環女士等更是自己行動起來，親自找日本老兵調查核實其在華時的罪行，故而筆者有機會獲取一部分日本老兵自己寫的反映他們在華時強姦和輪姦中國婦女的材料。
一個男人強姦或參與輪姦女人，在世界上任何一個國家都是要受到嚴懲的，但幾乎沒有一個強姦和輪姦過女人的男人會主動把這樣的事說出來。戰爭中強姦和輪姦女人應該說不是只發生在日本軍隊里，但日本軍隊在中國特別是在佔領南京時期對婦女的傷害，是特別殘忍和可憎的。日本官兵自己也承認：幾乎沒有人乾淨過。強姦和輪姦女人就像「吃飯」一樣，是他們「必須」和「隨手可得」的事。
有事沒事，「找花姑娘」；「征糧」、「徵發」的主要目的也是「找花姑娘」；白天黑夜「找花姑娘」……當兵的「找花姑娘」、當官的「找花姑娘」，在南京淪陷的日子裡，日本兵所做的最「來勁」的事基本就是這一樁。
「這場戰爭最糟糕的不是被燒掉的建築和被摧毀的家園，雖然那也很糟糕，而是男人永遠不會再回來，而婦女終生都要伴隨強姦帶給她們的身心痛苦和傷害。我幾乎不知道男人被帶走殺害和婦女在恐怖中倖存下來變成驚弓之鳥，哪件事更令人悲傷。」美國人米爾斯在寫給他妻子的信中這樣形容他所看到的日軍給南京百姓留下的最悲慘的情形。
「搞女人的事，是不會隨便寫在日記里的。」一位日本老兵的後裔這樣對筆者說。儘管如此，筆者還是在極其有限的日本老兵的「日記」里找到一些這方面的東西。如原侵華日軍第16師團第33聯隊第1大隊的田中士兵寫過的《田中日記》中就這樣記述過：
1月20日
分隊的人終於帶女人來了。她哭著說：「家裡有嬰兒，讓我回去吧。」我們雖然沒有父母的慈愛心，但覺得她很可憐。某某、某某傢伙做了「好事」。
1月22日
又有姑娘被拉進來了。吵鬧了一個晚上睡不著覺。
下面是日本老兵在20世紀90年代前後接受調查訪問時所自述的在南京強姦、輪姦中國婦女的原始材料——
秋山源治：
想要飯吃，就用性來換
我們在難民區也發現了姑娘。姑娘的徵發，剛開始是闖進房子里搜查，一旦發現女的就幹了。
攻陷後過了10到15天，我去了難民區。到了那裡，我就說「剩飯跟×交換」。當時我是連鍋端著去的，所以就說跟這個交換。跟女人，你就說「飯、飯、性交」或者「×，交換」。這麼一來，女人就說把那剩飯給她。（很多人逃走了）房子哪裡都空著，所以我說一聲「走吧」，就幹了。那時候局勢已經穩定下來很多了。
鬼頭久二：
發現女的便就地強姦
掃蕩的時候是挨家挨戶進行搜查，如發現女孩子，當場就給強姦了。女孩子們大概都躲在床下或窗帘後邊。被發現的時候，不知是害怕還是什麼原因，反正沒有反抗。因為沒有受到憲兵隊的阻止，所以可以隨便干，沒有限制。女人們臉上都塗著墨水之類。想不起來自己強姦了多少女人，只有一件事有印象，那是抓到逃跑的母女倆時，母親說女兒還小，所以求我們只對自己來，我說了句「笨蛋」，把母親推開了。乾的時候是兩三個人一起干。乾的時候當然覺得不好，也想過，如果日本被佔領，自己的女兒或者是女人被強姦該怎麼辦。但是，當時是自己也不知道自己什麼時候死，所以趁還活著的時候干自己想乾的事情，這跟天皇的命令什麼的沒有關係。這成了理所當然的事。我在南京當然有過強姦的經歷，並且是不分場所，有很多空房子，就在空房子里的床上干。平時也拿著米去向母親要女兒。還有，有的女人是自己從難民區走出來，用自己的身子換大米。米是我們自己吃的大米，一回給裝滿一隻襪子的量［相當於5合（日本的計量單位，1合約0.18升）］。不是在南京城，而是在南京郊外，如果被憲兵隊抓住的話比較麻煩，所以就殺死了女人。我是只在掃蕩時進城的，也殺過人。
從這些事情來看，我認為南京大屠殺是有過的，我認為是幹了壞事。
井戶直次郎：
掃蕩時的主要興趣是強姦
（強姦）是所到之處都有。這是少不了的事情。在所到之處都目睹過扛著女人和強姦婦女的場面，連老太太也抓。強姦後就給殺死了。殘酷極了。
陷落後過了兩天，到下關進行徵發的時候，在民宅徵發過米和食物，那時也徵發女人。打開屋裡的衣箱蓋時，發現裡邊藏著年輕的媳婦。因為是纏足，所以逃不快，就抓住了，就地扒掉衣服強姦。因為只穿了一條褲子，裡邊沒有穿內褲，所以馬上就可以幹了。幹完後，對方雖然說了「不要」，但還是對準胸口開槍殺死了。這是一種默契。如果以後憲兵隊來了，事情敗露的話要算作罪行的，所以給殺掉了。大家都知道這個道理，所以幹完就殺掉了。
過了好長時間，治安有所好轉，憲兵隊讓部隊所有的士兵排成一排，把受到強姦的婦女帶過來，讓她們指出是誰幹的。跟平時不一樣，這次不算有罪，只是被罵了一句「不要再幹了」。不算有罪，也不算別的什麼，只是挨罵而已。我們隨心所欲地作惡，10個人里竟然有9個人干過強姦，還自吹自擂引以為豪呢。
大部分的部隊都帶著稱為慰安婦的30多名婦女一起行動。幾乎都是朝鮮的婦女。我們的部隊也設置過慰安所。不是設在中隊，而是設在野田部隊的聯隊里。在南京（駐屯地）的光華門附近也設置了慰安所。
對城裡女人藏身的地方也是了如指掌。年輕的、年紀大一點的都干過。幹完後如被發現的話會惹來麻煩，所以就給殺掉了。不管是進南京之前，還是進南京之後，強姦婦女可以說是任你隨便干，干多少都無所謂。還有的人自吹「幹了70歲的老太婆，腰都變輕了」。在城裡也有很多婦女被留下來了，幾乎都藏在洞裡邊。即使設立了慰安所，也沒有減少強姦事件。慰安所的婦女都是朝鮮人，分為軍官用和一般用。費用大概是1日元或2日元。一般士兵的工資是8日元左右，我因為是伍長，所以有15日元左右。我們的分隊還算好的，別的部隊更是亂來。分隊的士兵們幾乎都經歷過（強姦）。如果去城裡乾的話可以「白乾」的。
還去過只收容女人的難民區（估計是金陵女子大學吧）。在屋裡指手畫腳地任意挑選，並且當場就幹了。跟我同一個部隊的，忘了是誰，在強姦的時候，被中國的敗兵打了頭部。從那以後強姦時，都會有人給你放哨的。是不分晝夜地乾的。一般是以一個分隊為單位行動。可能去過十幾次。幾乎所有的分隊都是這樣。同夥相互說「給我盯這邊」、「給我盯那邊」，乾的時候也不顧慮旁邊有沒有人。說什麼「結束了嗎？這回該我了……」就是這樣的情況。
士兵是一邊說「死了，死了」，一邊把女人帶出來。女的也害怕被殺，所以立刻答應了。臉上雖然塗著鍋底的灰，但是馬上可以看出來的。每天凈抓女人，雖然也害怕，但有意思的事情更多。
東征雄：
即使餓著肚子，看到女人就來精神了
……當時我25歲。從神戶港出航，叫「利根川丸」的船上裝載著1000人左右的士兵到達了南京。從那兒開始，參加了大別山和漢口戰役。在我前面的士兵都參加過南京進攻戰。聽說過9師團的殺人，是讓支那人往棧橋上跑，他們從後面開槍打死的。
在支那，根據隊長的命令，為了給國內來的人壯膽，用刺刀刺死過捆綁著的支那俘虜。支那人「呀」地發出了叫聲。第一次是在安陸戰役時乾的，在討伐中也放火、徵發，干盡了壞事，都是跟先來的士兵學的。闖入老百姓的家裡，只要見到好一點的東西，不管是什麼全部都偷回來。在支那是就地徵發，所以任你想幹什麼就可以幹什麼，偷什麼都可以。
大家都把領章（所屬的部隊不同，領章的顏色也不同）摘掉後去搶東西。肚子雖然餓得受不了，但只要看見女的就立刻來了精神，一把就把女人給抓起來了。……部隊里的所有人都干，就算默認吧