「捷代號作戰」本質上雖為防禦計畫，但從日軍大本營到南方軍，所持的仍是要一口咬死美軍，從而將菲律賓變成「最後決戰」戰場的想法。寺內甚至認為，光憑菲律賓的陸基飛機，就能在美軍登岸前擊沉大部分美艦。
當然也有人對此提出不同意見，比如第14軍司令官黑田重德中將就主張實施縱深布防，他還曾多次告誡寺內：「說空話並不能擊沉美國軍艦，把我們的飛機與他們的相比，這點更是明顯。」
寺內哪能聽得進半點兒逆耳之言，他當即削了黑田的職務，給出的表面理由是黑田「花在打高爾夫球、看書和私事上的時間，比履行公職的時間還多」。
從這時候起，山下奉文大將奉命接替黑田，指揮菲律賓各島地面部隊。
兩年前，山下在馬來新加坡一役中聲名大震，但這位「馬來之虎」只是被調到中國東北，擔任了滿洲第一方面軍司令官。有功不得封賞，對山下而言自然是個不小的打擊。官方的說法，是山下口無遮攔惹了禍，他居然在一次集會上公開聲稱，被日軍佔領的馬來亞及蘇門答臘等地都已是日本的領土。
有些話，自己知道是一回事，說出來是另一回事。那時，日本政府正到處宣傳，說在把英美逐出東亞後，他們要支援和協助東南亞各國獨立，以步入所謂的「大東亞共榮圈」，而山下的講話等於承認了日本是在發動侵略戰爭。
然而，事情的真相又往往遠比表象要複雜得多。按照山下的戰功，要麼不升，要升就得擔任陸相或至少與之相等的職位，而東條當時正集首相、陸相於一身，此君的氣量跟寺內差不多，都只有芝麻綠豆大小，如何肯輕易讓賢？
另外，山下本身還有把柄被人抓在手裡，那就是他有年輕時參加過「皇道派」的「劣跡」。東條當政期間，日軍大本營「統制派」當道，東條本身就是「統制派」骨幹，而「統制派」與「皇道派」過去曾是對立的兩個軍閥派系，山下一旦回東京出任要職，就會被認為代表了「皇道派」的東山再起。
馬來新加坡戰役之前，率領精兵的山下猶如穿著一身名牌，贏得這一戰役後，他自己瞬間也變成了名牌，一旦期許得不到滿足，心理落差之大可想而知。可是正所謂人在屋檐下，不得不低頭，山下再憤懣不平也無濟於事，他只好自我解嘲，稱之所以會被平調到中國東北，緣於自己是一塊「壓制蘇聯的大石頭」。
馬來新加坡戰役，可算是日本陸軍在東南亞作戰取得戰績的頂峰，之後便開始走下坡路，山下的部隊不斷被抽往南方去填坑，然後一去不回。
內心受傷的山下似乎也不願去南方了，特別是如願晉陞大將之後。一位軍官曾經問他：「閣下，南邊怎麼樣？不是有些可疑嗎？」山下回答道：「有什麼可疑？我們的眼睛用不著朝著南邊啊！」說完，他用下巴指了指北面：「我們朝著這邊就行了！」
山下樂意的，恐怕還是上調東京，出任陸相什麼的，再次一點兒，賴在東北也不錯，可是送到他手中的指示電令，卻是要他重返南方第一線。
南方現在是什麼樣的情形，山下比誰都清楚。眼看瀕臨絕境了，你們這時候才想起我，要用我，早幹什麼去了？
奉命動身之前，山下對他的作戰參謀說，他深恐菲律賓戰役「將是又一次湊川之戰」。湊川之戰是日本歷史上有名的戰役，被日本人奉為英雄的楠木正成就在這次戰役中兵敗自殺。山下說這番話，表明他已意識到，菲律賓戰役將是一場沒有打勝希望的戰役。
想當年攻下新加坡時，山下是何等不可一世和驕橫殘暴。為了對華僑的抗日行動進行報復，他和辻政信曾共同下令，用麻袋分裝幾萬華僑，用大型船隻駛至遠海，然後全部推入海中淹死。此時預感到末路將至，這個不可一世的劊子手居然也走上了傷感婉約派路線，在長春關東軍為他舉行的餞行會上，他忍不住失聲痛哭起來。
到菲律賓報到之前，要經過東京，但大本營只允許山下在東京停留兩天。
這一系列安排都是新任參謀總長梅津美治郎大將做出的。在派系劃分上，東條是「老統制派」，梅津是「新統制派」，反正都跟「皇道派」不是一條線上的。
繞來繞去還是繞不開派系這個「原罪」。山下的小暴脾氣終於發作起來，他紅著眼叫喊道：「簡直是胡說八道！我在這回的戰爭中頭一次踏上東京的土地，這次也下決心不想再回來第二次了。只兩天，磋商、告辭不是都來不及了嗎？」
經過一番交涉，出發日期順延了四天，山下的臉色這才稍有緩和。在最後一天離家時，他給家人留下了一張字幅：「如果時機到來，要飛回舊巢，燕子呀！」
1944年10月6日傍晚，山下乘機到達馬尼拉北郊的克拉克機場。隔天他向寺內報到，與寺內僅僅會談十分鐘後，他便走出了南方軍總司令部：「講話太多，就無法打仗了。」
山下急匆匆地要進入狀態，但實際上已經有人給他擺好了棋局，他要做的，不過是奉命行事而已。
越俎代庖的這個人，便是調他來的寺內。寺內不光是撤了黑田的職，就連黑田班子里的那些幕僚也撤了個乾淨，撤完以後，南方軍總司令部就直接代替第14軍決定了菲律賓的作戰思路。
菲律賓雖有多達7100個島嶼，但面積超過1000平方英里的島只有11個，其中最大的是棉蘭老島和呂宋島，兩個島加起來，佔到菲律賓陸地總面積的三分之二以上。相比之下，萊特島只是個小弟，其面積僅相當於棉蘭老島的1/13。
不過這說的只是地理概念，回到軍事上，萊特島的地位就不一樣了，它是菲律賓群島的心臟，而且海灣寬廣，便於美軍登陸。
南方軍總司令部的一眾參謀比較來比較去，還是確定不了應該在哪裡「決戰」，是棉蘭老島、呂宋島，還是萊特島。一個參謀最後提出，乾脆，不要再悶在屋子裡打啞謎了，把軍隊分散到菲律賓南部的各個島上去，美軍要麼不來，來了就分別迎戰。
寺內按此意見上報，參謀本部一看，分散了還怎麼「決戰」？一定要集中兵力！
雖然不能準確預言美軍的計畫，自家的情況總是知道的。呂宋島的道路最好，也最易於防守，於是寺內決定把大部分陸軍兵力都集中在呂宋島，如果美軍向呂宋島以外的菲律賓各島，包括萊特島，發動進攻，將主要從海、空進行迎擊，換句話說，呂宋島以外的活兒將主要交給海軍。