世界盃失利的痛苦只有慢慢去咀嚼，而足球不會因為一個人一個球隊的痛苦而停止其運轉的腳步。從世界盃歸來後，巴喬並沒有得到大多的時間去洗卻世界盃帶來的身心疲憊，他必須馬上振作精神，為新的俱樂部備戰新賽季的義大利甲級聯賽。而這一次，他選擇了重返來蘭。不過他加盟的並非他的老東家AC米蘭，而是它的同城兄弟國際米蘭。他轉會國際米蘭在去法國世界盃之前就已經基本敲定了。可以這樣說，這次加盟國際米蘭算得上是赴三年前的約了。1995年夏，當尤文日斯排擠巴喬之時，國際米蘭俱樂部的老闆莫拉蒂就曾向巴喬發出了邀請，希望巴喬來為國際米蘭的復興而奮鬥。巴喬後來雖去了米蘭，但卻不是去國際米蘭，而是去AC米蘭，這多少有些讓莫拉蒂臉上無光。
由於巴喬加盟博洛尼亞後表現非常出色，一掃在AC米蘭的頹氣，成為了球隊的核心，因此，在1998年的1月，莫拉蒂就暗中展開了一些攻勢。不過後來由於爆出了巴喬與博洛尼亞隊主教練烏利維埃里鬧矛盾的「罷賽事件」，莫拉蒂又暫停了與巴喬的接觸，因為他不想給人留下乘人之危的印象。而且當時巴喬還處於猶豫之中，他當時接到了國際米蘭隊主帥西蒙尼力邀他加盟的電話，巴喬在電話里對這位熱情的主教練說：「我很願意立刻就到國際米蘭去，但我知道許許多多博洛尼亞的球迷從我到博洛尼亞一開始就給了我極大的支持和信任，現在我要是離開他們，他們會把我當成叛徒，請你理解我現在的心情。」西蒙尼並不了解巴喬的為人原則，他以為巴喬與博洛尼亞隊主教練鬧矛盾，就是力邀巴喬早日加盟國際隊的最好時機，可巴喬是一位非常講情義的人，他不會在球隊最需要他的時候突然離去。 那段時期，西蒙尼教練從不放過一切可以和巴喬見面的機會，他幾乎每周都要不斷與巴喬通電話。西蒙尼是一位歷經許多挫折的老教練，他先後執教過熱那亞隊、布雷西亞隊、比薩隊、拉齊奧隊、恩波利隊、科聖察隊、卡拉那隊、克雷莫納隊、那不勒斯隊，可是很少取得成功，他總是不停地被球隊解職，扮演一個可憐的角色。現在執教國際米蘭同樣面臨巨大壓力，成績稍有不好，球迷們就轟他下課，他非常希望巴喬能早日到來以助球隊取得聯賽冠軍，在他的執教生涯中，連一次冠軍都還沒有得過，因此他的心情如此急迫是可以理解的。但心急吃不了熱豆腐，巴喬不可能在賽季還沒有結束就離開博洛尼亞。後來，巴喬與烏利維埃里冰釋前嫌，巴喬在聯賽上的表現也愈加出色。國際米蘭只好等到賽季快結束時再次坐下來與博洛尼亞俱樂部商討巴喬轉會一事。 國際米蘭再次想到引進巴喬是有其原因的。自從「外星人」羅納爾多加盟國際米蘭以來，國際米蘭的成績確實有很大提高，在1997-1998賽季的積分榜上一度領先於群雄。但是，球隊總讓人感到還缺一點什麼，羅納爾多還缺一位好的傳球隊員與他進行配合。國際米蘭現有球員法國人德約卡夫由於該賽季狀態不佳，引起了球迷和教練的不滿。莫拉蒂看中了巴喬出色的組織進攻的能力，他迫切希望引進巴喬來與羅納爾多配合，進一步加強球隊的實力。
1997-1998賽季的聯賽終於結束了，整個義大利的球迷們都把注意力集中在法國世界盃賽上，而關於球員的轉會，也只有羅伯特·巴喬的去向才能引起公眾的關注。巴喬本人確實希望到國際米蘭去開拓自己的新天地。從巴喬個人來看，以下這些原因是他決定去國際米蘭的關鍵：首先，國際米蘭是義大利三個超一流俱樂部之一，在義大利球迷心中有舉足輕重的影響，國際米蘭隊已取得了下賽季參加歐洲冠軍杯附加賽的資格，這項大賽是巴喬渴望參加的。他自知自己可能已沒有機會再去參加世界盃賽了，代表強隊去參加歐洲三大杯賽并力爭獲得冠軍就成了他未來足球生涯新的夢想。其次，國際米蘭俱樂部的老闆莫拉蒂一直對巴喬情有獨鍾，多次表示國際米蘭歡迎巴喬的到來，巴喬對莫拉蒂的賞識心存感激，他深知莫拉蒂重振國際米蘭的堅定信心，願意去一個有雄心壯志的球隊踢球。此外，巴喬個人對國際米蘭也頗有好感，自小就和家人一起支持該隊。就是在聯賽結束的同時，巴喬轉會國際米蘭的事也基本敲定，國際米蘭的官方網站率先發布了這一消息。 在義大利國家隊世界盃賽前的集訓基地，一位攝影記者用長鏡頭拍下了一張照片，照片上穿運動服的巴喬與國際米蘭的老臣貝爾戈米笑容可掬地擁抱在一起。人們據此推斷，巴喬正式加盟國際米蘭已是不可更改的事實了。
由於博洛尼亞隊深知巴喬自小就是國際米蘭的球迷，而且他們也相信巴喬在國際米蘭這樣的大球隊會取得更大成就，因此他們根本沒有去阻止巴喬轉會國際米蘭，他們的要價也非常地低，只有區區兩百萬美元。轉會協議是在世界盃開賽之前簽好的，義大利國家隊在瑞典打完熱身賽回到國內後，巴喬抽空與國際米蘭最後敲定了合同的細節，使自己如願重返米蘭。