歷史總是如此驚人相似，和五年前一樣，巴喬又不得不離開自己獲得成功的俱樂部，上一次是不得不離開佛羅倫薩去尤文圖斯，這一次是不得不離開尤文圖斯AC米蘭。那麼，這一次是誰迫使巴喬離開尤文圖斯呢？
當時有不少人認為是尤文圖斯隊的主教練里皮迫使巴喬離開尤文圖斯的。但是，三年多之後，也就是1998年9月21日，國際足聯組織了一次世界足球先生候選人的提名活動，當時巴喬和里皮都被委員會邀請為佳賓參加這一活動，他們在那裡不期而遇。見面後兩人互相握手致意，還互相擁抱，低聲交談著什麼，狀態十分親密。過去，人們以為他們之間積怨頗深，矛盾不可調和，但事實卻並非如此。那時，巴喬輕鬆地說：「與里皮相見使我感到很高興。里皮與我打招呼，並對我說：『我絕對沒有想過要把你排斥在我的隊伍之外，我們之間不了解純粹來自於外部的流言蜚語，我敬重你，你一直是我十分賞識的球員。』里皮的一席話使我感到十分高興，這同我對里皮的看法和感覺是一致的。」里皮說這些話給巴喬聽，其實是暗示，巴喬被迫離開尤文圖斯是有另外原因的，並不是像外界傳說的那樣，是他不喜歡巴喬，他不應該承擔趕走巴喬的責任。不過從事實上來看，里皮雖然從內心來說可能並不低看巴喬，但他的戰術思想不適合巴喬的發揮卻是客觀的現實，這使巴喬逐漸失去了在球隊的核心地位，而胸部的領導層據此認為巴喬在球隊里並不起什麼作用了，因此起了逼走巴喬的念頭。有一個現實的事例可以證明這一點。如今，里皮已是國際米蘭的主教練，巴喬又在他旗下效力，今天的里皮仍然沒有重用巴喬，他認為巴喬不適合他的戰術需要，兩人為此鬧得有些僵。
此外，也有不少人認為，是尤文圖斯隊的新人德爾.皮埃羅擠走了巴喬。
眾所周知，皮埃羅的特點和巴喬十分相似，都是既善組織又能自己打陣得分的前場攻擊手，而他又有比巴喬年輕近十歲的優勢，俱樂部從未來的前途著想，讓皮埃羅取代巴喬也在情理之中。而尤文圖斯的老闆阿涅利就曾表示：「我們已經擁有皮埃羅了，為什麼不在實施一套老將的鋒線組合？」他暗指巴喬和維亞利這些老一代前鋒可以出賣。而事實上，後來的情況正是朝著這一方向發展的。巴喬和維亞利都相繼離開了尤文圖斯。 不過從巴喬和皮埃羅兩人的個人關係上來說，他們並沒有鬧到水火不容的地步。在一次記者的採訪中，記者問皮埃羅，他與巴喬之間更多的是友誼不是競爭時，他說：「當然是友誼。在我們之間從來不存在著競爭。我應該感謝巴喬和尤文圖斯。巴喬普拉蒂尼一樣，都取得了卓越的成績，巴喬一名偉大的球員，他所做出的一切已證明了這一點。我所能表明的是：不是我促使巴喬離開尤文圖斯的，我沒有推他下場。離開俱樂部的原因與比賽毫不相干。」另一個事實也可說明一些問題，就在1998年的那次世界足球先生候選人的推舉中，巴喬說：「也許你不相信，在義大利最佳球員中我推舉了皮埃羅。」正如里皮一樣，皮埃羅本人並不應該對巴喬離開尤文圖斯負責，但客觀上，正是皮埃羅的成長使俱樂部覺得不再需要巴喬了。
其實，巴喬最終不得不離開尤文圖斯的原因在於俱樂部的領導層。由於巴喬在轉會市場上能大賺一筆，而本俱樂部又有了他的接班人，何不乘機撈上一筆呢？這種想法本身並沒有什麼可譴責的，關鍵在於尤文圖斯俱樂部領導層的態度曖昧，把責任推給巴喬感到不快。後來在AC米蘭巴喬對記者說：「我為自己給尤文圖斯帶來的許多榮譽感到驕傲，但俱樂部對我可不怎麼樣。問題不在於減了我的工資，當然我認為這一點也是不應該的。最令我難過的是把我封鎖起來，直到最後一刻才把他們的意見告訴我，這給我帶來一定的困難，包括心理上的不平衡。我認為這樣對我太不夠意思了，是耍了手腕的。」
誰是誰非，歷史自有公論。既然已經離去再去爭論是非也毫無價值了，更關鍵的是，來到一個新的豪門，巴喬又將面臨一個什麼樣的前途呢？