據說美軍總司令部由於留用了有關人員，在日本大大開展了細菌技術的研究工作。美國在朝鮮戰爭中曾廣泛使用細菌武器的說法，如今也差不多成為定論了。在美國本土，對細菌戰的研究也早就展開了。這個機構究竟做些什麼樣的研究，從一九四六年喬·伍·馬克（後來擔任美國細菌武器委員會的主席，由於改進細菌武器有功，曾被任命為陸軍部長）所作的報告中也看得很明白。
據這個報告說，細菌武器的研究工作曾獲得飛躍發展，已移交給美國陸軍化學研究所管理。該所的中心研究機構設在馬里蘭州腓德烈市近郊狄特利克營，又名「特殊計畫部」，據說第二次世界大戰期間約有三千六百餘人在這裡工作。除此而外，美國海軍還在加利福尼亞大學內設立直屬的細菌武器研究機構。這些機構的研究費高達五千萬美元。正當朝鮮戰爭爆發前三個月，即一九五〇年三月三十一日，美國國防部部長劉易斯·約翰遜向總統提出了年度報告。其中有這樣一段說：「對人、家畜以及穀物正在進行關於傳染性的多數病原體的全面而詳細的研究。然而從國防角度看，公開發表這一研究是不明智的。」
一九五〇年四月號的《軍事評論》上刊登了關於使用細菌武器的論文，上面記載著：「所感染的必須是非常難治的病，感染的過程必須是難以判明的。不論什麼部位都不可以有醫療上免疫的可能性，最好讓感染者對任何化學治療都無反應。」
一九五一年三月，美國衛生研究院院長海斯公然宣稱：「微生物的炮彈和炸彈已製造成功，達到了能使用的階段。」根據已發表的這方面的記錄，情況如下：
美軍是在一九五〇年聯合國軍從北朝鮮退卻時開始進行細菌戰的。當時他們在所經過的平壤市、平安南道、平安北道等地都散布了細菌，因而引起天花的流行。到一九五一年四月底為止，就發現了三千五百多個病例，患者百分之十死亡。江原道發現了一千一百二十六個病例，咸鏡南道發現了八百十七個病例，黃海道發現了六百零二個病例。美軍未經過的地區均未流行天花。
又聽說一九五一年三月美軍第一〇九一號細菌登陸艇停泊在朝鮮東海岸元山港時，曾在艇內對俘擄的朝中兩國人民做了試驗。關於這件事，四月九日發行的美國《新聞周刊》曾報道說：
「共軍當中流行鼠疫，這一可怕的疾病有傳染給聯合國軍方面的可能性。這隻登陸艇上載有醫學研究設備和試驗用的動物。」