戴笠在重慶的非正式機構各式各樣，其中包括一個叫做「裕民米店」，實為大米囤積庫的連鎖糧食商店，以及在珊瑚壩機場附近的飛虹照相館這類偷拍有反蔣嫌疑的旅客照片的照相館。
戰時首都重慶的大多數飯館老闆都與軍統有非正式的關係，但一些最大的則實際屬於軍統官員們掌管：皇后飯店是軍統大特工許忠午開的（他還在打銅街開了一個舞廳）；鄒容路上的新味腴餐廳和民生路上的味腴餐廳，為偵緝大隊副大隊長沈夕峰所擁有；而凱歌歸菜館是黃埔軍校畢業生李岳陽開設的，此地是國民黨高級軍官常去的地方。此外，大多數旅館的服務人員，尤其是在重慶最大的旅館勝利大廈里的服務員，全都是軍統特工開辦的「跑二排」。
這些非正式的掩護機構和半特工們都由重慶特區（即渝特區）管轄。該特區負責外勤，而它的外勤人員直接向稽查處彙報。渝特區由姜紹謨任區長，區部設在老街32號，此地在戰前是西南軍政公署第二處辦公處，現在是軍統在當地行動的「醜惡網路」或「巨大的無形網路」的中心。該辦公室有40到45名高級情報官員，他們掌管軍統在全市的所有人員，包括民主黨派人士和一些從共產黨那裡過來的「叛徒」。特區本身被劃分為5個地區組，其中最重要的是西郊組辦公處，它負責監視共產黨紅岩村和《新華日報》辦事處。由於西郊組無力收集關於共產黨在紅岩村的情報，姜區長向沈醉建議向他的特工頒發槍支（正常情況下便衣外勤人員不佩帶槍支），來誘惑共產黨向他們開火。他說，這樣，在混戰之後，軍統的人便可以衝進共產黨的村子搜查他們的地盤。沈醉向他的上司彙報了這個計畫，戴笠一聽就火了，罵姜是「飯桶」，並指責沈醉本人贊同這種愚蠢的計畫：「你在胡鬧！我們和共產黨作鬥爭靠這些辦法能達到目的嗎？打死了算白打死，打傷了是活該！不準在這個上面去打主意！」
所以，對軍統正規特工的實際政治監視，戴笠的總部會予以相對嚴格的控制。但軍統在「外圍分子」活躍的地方則比較放鬆，而他們幾乎遍布重慶，這些到處都是的密探和間諜非常起勁地搜尋有「進步」嫌疑的人，以維持他們作為軍統「跑二排」的微薄工資。這些毫無紀律的監視人不僅利用與軍統遙遠的關係來進行敲詐；而且他們知道，假如不能在一年裡起碼搞到一兩份情報，他們就會被除名。結果，普通的市民人人自危，怕被告發，他們知道一出門就會被盯梢，而且，起碼在他們探訪親友時，愛管閑事的鄰居會把他們的出現報告給上級秘密警察當局。與此同時，所有的信件、電報和電話全都受到監視。