在美國人看來，中美合作所的核心是它的訓練項目。在中美合作所存在的三年里，共有二千五百個美國人輪流去中國服役，他們大多數是海軍，認為自己的主要任務是訓練中國游擊隊來與日本人作戰。當然，其中有些人到了西北偏遠的氣象站工作，或在中國東南沿海地區從事海岸監視。中美合作所絕大多數的官兵被分配到重慶城外的「歌樂山」總部，或到遍布中國各地的14個分所去，他們把類似童子軍戰地訓練的計畫與謀殺、破壞和小組作戰的教程結合使用。
雖然只有26794名學生正式從中美合作所訓練營畢業，但其訓練點號稱為戴笠的軍隊培訓了四至五萬名人員。戰爭結束後，梅樂斯斷言，中美合作所的游擊部隊包括97000名中國人員和3000名美國人員。他宣稱：這支強大的力量消滅了71000個日本人。
無論這些說法的可信度如何，中美合作所的美國人員認為他們在中國的主要使命是訓練游擊隊，使之最終成長為一支地下抵抗力量，以便在美國正規軍最終登陸中國海岸時向日本人進攻。考察中美合作所的每一個單位，便會發現他們所通報的敵人傷亡人數並不準確，但這絕對沒有貶低自願為這項使命工作的美國人的英雄主義精神。當這些人在回顧自己的戰爭經歷時，他們感到的是驕傲和對部下的鐘愛。由於幾乎所有這些美國人在赴華工作之前都對中國一無所知，也不會說最基本的漢語，所以他們有時對環境的誤解往往令人可笑。我們相信，當他們中一些人後來得知，自己在中美合作所鼎盛時期，曾經參與訓練國民黨政權最可怖的、專門以綁架、酷刑和殺害等手段從事迫害整個「國統區」里的進步分子的秘密警察組織的時候，他們想必十分震驚，或者無法相信。