民國11年6月15日，重作馮婦的黎元洪頒布了全國停戰命令，企圖首先在江西停止南北兩軍的戰爭。可是「援贛軍總司令」蔡成勛拒絕黎所派的歐陽武進行調解工作，並拒絕黎所任命的江西省長謝遠涵到任，使黎的威信受到打擊。為了適應各省自治潮流，實現軍民分治，黎分別任命了七個省長，其中五個省長受到軍閥的拒絕而不能到任。
黎所派的湖北省長湯薌銘，早在民國4年就做過湖南督軍，當時曹錕還只是第三師師長，駐防岳州，吳佩孚則在曹下面擔任副官長，曹曾派吳到長沙去和湯薌銘有所接洽，湯對吳極為賞識，向曹要求要留用吳，因此使曹對吳刮目相看，所以湯可以說是最早識拔吳的，也可以說湯對吳是有舊恩的，如今曹、吳得勢，湯因和黎同鄉的關係受到黎元洪的提拔才得到湖北省長一職，黎叫湯到保定和洛陽去見曹、吳，聯絡一下，不料湯到保定後，見到了曹，曹的態度非常冷淡，推說湖北不是他的管轄區，叫他先去問吳佩孚。湯到了洛陽，吳竟拒而不見。同時曹、吳都有電報給黎，推薦蕭耀南兼任湖北省長。黎看到這個電報不禁忿然說：「湖北是我的家鄉，別的地方我可以不管，我的家鄉，我一定要管！」便叫湯薌銘直接去湖北接事。
7月29日湯到漢口時，蕭耀南指使「拒湯派」橫卧在京漢路的軌道上，阻止湯所搭的火車通行，湯只好在劉家廟下車，改乘軍艦在漢口特區登陸，可是江岸上不少的「迎湯派」，竟被軍警橫施毆辱，受重傷者有四五十人。
蕭耀南派副官鄒海清到軍艦上見湯，勸湯不要登陸，以免引起騷亂。湯不聽勸阻，登陸後親自渡江到武昌去見蕭，蕭竟拒而不見，卻在軍署內召集一些不三不四的人舉行所謂湖北各公團聯席會議，當場推舉蕭自己兼任省長，而蕭也就馬上宣布就職。
湯搞得很慘，把這些情況報告了黎，請求辭職，黎回答說：「這不是你干不幹省長的問題，而是我干不幹總統的問題。」
蕭耀南是吳佩孚所提拔的，因此黎元洪希望這位捧他復任總統的吳大帥能出面替他撐腰。可是吳卻不聲不響，裝著沒有這回事一樣。
黎元洪現在的日子並不比剛下台的徐世昌好過，總統一點權也沒有，隨時要看軍閥們的嘴臉，隨時要碰軍閥們的釘子，這總統實在不如一個有實際權力的縣長。
黎元洪上台前所高唱的廢督裁兵問題，在他上台後受到各方冷落。曹錕借口全國戰事還未停止，督可廢而兵不可裁，又一再電催任命蔡成勛為江西督軍，說明他的真意在兵不可裁，而督亦不可廢。吳佩孚雖然口稱擁護裁兵，可是卻在直、魯、豫三省大招新兵，補充第三師的缺額。7月4日吳在致蔡元培的電報中露骨地說：「裁兵廢督，須俟統一完成，通盤籌劃，此時貿言裁廢，適以增亂。」
七八月間，黎先後下令把許多在職督軍、師長加冠了「將軍」的頭銜，這是他想的新辦法，為督軍們下台後保留將軍尊號預留地步。其實這並不是一個新辦法，因為袁世凱早就採用了。袁就是用這個方法廢督，可是就沒有行得通。袁都行不通，黎又如何行得通。
北京依然還是一個老問題——財政問題。北京老早就面臨財政破產的絕境。黎任命英美派外交家顧維鈞為財政討論委員會委員長，目的在於取得西方國家的大借款。奉直戰後，英、美、法三國公使會議，決定在財政上援助北京政府進行統一。日本為了要消除它曾經援助奉系的嫌疑，所以也同意參加。可是日本和西方國家在對華問題上的矛盾沒有消除，所以日本內閣討論「參加」與否問題時，認為時機未至，主張推遲進行。
北京政府由於借債遲遲未成，軍餉不能按時發放，於是全國各地到處發生兵變。光是七八兩個月之間，保定、衛輝、熱河等地就傳來一片兵變之聲，北京也被波及，特別是江西發生了多次的兵變，引起外交團一再提出嚴重的抗議。
北京政府各部的公務員終日忙於索薪，全體教職員因斷炊而罷課，北京城內到處聽到哭窮訴苦之聲。7月15日陸軍部被裁人員700餘人組織索薪團，包圍國務院，黎正在列席國務會議，匆忙地避開，那位號稱「活包公」的財政總長董康，跑遲了一步，竟被請願索薪的人員揪住，紗馬褂被扯破了，近視眼鏡也被打落了，眼皮也被擦破了，還挨了三下耳光，嚇得他狂呼救命。事件過後，他感到「窮」官不易為，第二天就提出辭呈，堅決求去。
財政困難，巧婦難為無米炊，這是北京多年的老病，黎元洪當然救不了，北京政府的前途風雨飄搖。交通總長高恩洪擬以京奉、京漢、京綏、津浦四路作抵，進行3億元的統一大借款，四國銀行團有所顧慮，所以不敢做這筆買賣。
黎上台後，內閣本是由顏惠慶暫時代理，顏只答應看守到8月1日國會復會那一天為止。黎一直想在南方找一位人出來，以達成形式上的南北統一。他原本請伍廷芳，因為他前次下台時就是伍廷芳代理閣揆，現在他復職，而伍已是南方政府的巨頭，如果伍來北京擔任國務總理，一切都顯得非常圓滿。可是伍廷芳卻在陳炯明叛變時，氣忿而死，於是黎又想到南方的另一位「名流」唐紹儀，想請他北上組織內閣，以便促進統一。
7月下旬黎派金永炎到保定和洛陽，把擬請唐組閣事先徵求曹、吳兩位老闆的意見。曹、吳都很客氣，表示內閣總理應由元首選派，我等決不干涉。曹錕提出高凌霨為交通總長，汪士元為財政總長，張紹曾為陸軍總長，其餘閣員概不過問。吳佩孚補充了一個人，就是請曹同意仍由高恩洪留任交通總長，而將高凌霨調任為財政總長。
7月31日，黎派王寵惠暫行代理內閣總理。
8月5日黎正式發表唐紹儀的組閣令，唐未北上前仍由王寵惠暫代。閣員名單如下：
外交總長顧維鈞
內務總長田文烈
財政總長高凌霨
交通總長高恩洪
陸軍總長張紹曾
海軍總長李鼎新
司法總長張耀曾
教育總長王寵惠
農商總長盧信
黎認為這個新閣算是各方兼顧了，因為曹、吳兩位大老闆的人都容納在重要位子上，盧信是唐紹儀的親信，張耀曾屬政學系。為了慎重起見，在提出盧信和張耀曾時，黎還和府中策士饒漢祥、韓玉辰等討論過，他們認為元首有組織內閣的特權，不必事事請教別人。黎又把閣員名單和國會議長吳景濂仔細研究過，取得吳的同意才拿出來。
組閣命令發表後，唐紹儀在廣東香山原籍不肯「出山」，高凌霨因為財政沒有辦法，也不敢出任艱鉅，張紹曾則意存觀望，田文烈宣稱不願與人競爭而不肯就職，於是這個新閣仍是殘破不全。
黎為了避免別人說他干涉內閣行政，不再列席閣務會議。
8月8日，代理國務總理王寵惠舉行政治宴會，在宴會中內務次長兼代部務的孫丹林拿出吳佩孚的麻（6日）、陽（7日）兩通電報給大家傳觀。
吳的麻電說：
「曉峰（金永炎）來，商組閣事，對唐決不贊成，以維持現狀為宜。如顏不願續，以亮畸（王寵惠）代揆，高交（指高恩洪的交通總長）不動，張長陸軍，余請元首斟酌。李印泉（李根源）、張西（張耀曾）、谷九峰（谷鍾秀）諸君，（按上三人均為政學系），川、滇、粵與之向有惡感，現正力謀統一，未便入閣。」
吳的陽電說：
「適接公府歌電，唐閣已發表。查唐主上海八年和會，外間嘖有煩言，張西入閣，妨礙川、滇、粵統一；盧信為金星公司交易所詐財流氓（按盧為該公司總經理），均不可入閣。金曉峰來，言之至再，不意回京後卒然發表，顯系別有用意，何必惶惶來洛，貌為周旋，想議員諸公洞徹大局，決不輕予通過也。」
同一天，吳另有致「某要人」的電報說：「南有政學，北有安福。南北政黨，一丘之貉！」
這些電報像幾枚炸彈一樣，震動了北京政壇。很簡單，吳佩孚現在正是北京政府的後台老板，他公然表示對於現狀不滿意，這個政府怎麼還能存在？
可是，吳、曹一再表示「不幹政」，且公諸通電，發出宣言，言猶在耳，何至突變。所以公府中的策士，認為這是孫丹林捏造的假電報，認為孫由於沒有坐上內務總長的位子，所以藉此以發泄私忿。
9日黎元洪把孫丹林召進公府，查詢吳佩孚電報的真相，令人失望的是這些電報竟是真的，是吳發的。黎不禁轉羞為怒，拍著桌子說：「都是你搗的鬼，你簡直是徐樹錚第二。」孫丹林怒目相對，拂袖退席，氣沖沖地走出，宣稱要到洛陽去告狀，還是高恩洪勸他冷靜一點，他才沒有離開北京。
黎又找王寵惠來訴苦，王勸黎不如就把內務總長這個位子給孫丹林，省得孫暗中搗鬼，鼓動政潮。黎元洪老毛病又發了，他表示堅決不肯讓步，並且憤慨地說：「我不，看他們把我怎麼樣？他們把我推上台，原來是叫我來活受罪！」
其實